Name : Rh054_03495 (Rh054_03495) Accession : YP_004764339.1 Strain : Rickettsia heilongjiangensis 054 Genome accession: NC_015866 Putative virulence/resistance : Unknown Product : succinate semialdehyde dehydrogenase Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1012 EC number : - Position : 612129 - 613556 bp Length : 1428 bp Strand : + Note : COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases DNA sequence : ATGAGCTTACTTAAAAACATTACGGGAAAGAATTATATAAACGGTGAATTTATAGAGTTCGGGAAGCAAATATCCGTTAT TAATCCTGCAACCTTAAAAGAAATTGCTACAGTTCCGAATTTAGGATTATCTGAGATTAATTCAGCGATTAATAATACGG TGACTAGTTTTTCTTTATGGTCACAAAGCTCATTTGAAGCGAGAATAGCGATTCTTAGAAGATGGTATAATTTAGTAATC GCAAATATTGAGGAGTTAAGTCATATATTAACCCTCGAGCAGGGTAAAATACTTGTTGAATCAAAAAAAGAAATTTTATA TGGAGCCTCTTTTATTGATTGGTATACGTATGCTATACATAATATTCATTCGACTATCAAGCCCGGTAATAGTAAAACTC ATAAAATTGTTACGCAATATGAGCCTGTAGGACCGTCTGCTGCTATAACTCCTTGGAATTTTCCAAATGCAATGATTACT CGCAAGGTAGTACCTGCAATAGCTGCGGGTTGCAGCGTTATATTAAAACCGTCAAGTCTTACGCCTCTATCAGCTTTAGT ACTTGCGAAATTTGCAAGCGATGCCGGTTTGCCTGCCGGAGTATTTAATATAATTACAGGTAGTTCAGATATTATAGGTA AGGCTTTTTGTGAAGATTTTAGGCTTCGGAAATTATCATTTACCGGCTCTACAAATGTCGGTAAAATTCTATATCAAAAT GCCGCAAATACTCTAAAACGTTTATCTTTGGAACTTGGCGGCAATGCTCCTTTCATTATAACGGCAGATAATAATTTAGA GAAAGTAGTAAGTGATTTAGTAATCGCTAAAACTAGAAATAGTGGACAGTCTTGTATTTCACCTAACAGAATATTTATAG AAGAATCTATATATGAAAAATTTATAGAAATTCTAAAGGCTAAATTTACTAAGCTTAAAGCCGGTGACGGATTTGATAAG GAATCGGATGTAGGTCCGTTAATTAATTCTGCTGCCATAGAAAAAATACAAAAGTTACTCGCTGATGCACAAAGTAAAGG AGCTAAATTAATTTGCGGCGGTAAAGTTGTTGATAATTTTATTGAGCCTACTATTATTATTGACTGTTTGGATAATATGG ATATCTTTAGAATAGAAATATTCGGTCCGGTAGTTGCTTGTTATAAGTTTAAAGATTTGGATGAAGTAATAGAACATGCA AATAATACCGAATACGGCTTGCAAGGATATGTATATTCAAATAATATATCCGTGGCACAAATGATAGCGTCTAAGCTTGA TTTTGGTATGGTATCGATTAACGACCCGTTACCTGCAAATGCAAAAGCACCTTTTGCAGGACGTAAAGCTTCAGGTTTTG GAGTTGAAGGCTCATTTGAAGGGATATTTGAATATCTAAATACGAAATATATAAATTTACAGAATTAA Protein sequence : MSLLKNITGKNYINGEFIEFGKQISVINPATLKEIATVPNLGLSEINSAINNTVTSFSLWSQSSFEARIAILRRWYNLVI ANIEELSHILTLEQGKILVESKKEILYGASFIDWYTYAIHNIHSTIKPGNSKTHKIVTQYEPVGPSAAITPWNFPNAMIT RKVVPAIAAGCSVILKPSSLTPLSALVLAKFASDAGLPAGVFNIITGSSDIIGKAFCEDFRLRKLSFTGSTNVGKILYQN AANTLKRLSLELGGNAPFIITADNNLEKVVSDLVIAKTRNSGQSCISPNRIFIEESIYEKFIEILKAKFTKLKAGDGFDK ESDVGPLINSAAIEKIQKLLADAQSKGAKLICGGKVVDNFIEPTIIIDCLDNMDIFRIEIFGPVVACYKFKDLDEVIEHA NNTEYGLQGYVYSNNISVAQMIASKLDFGMVSINDPLPANAKAPFAGRKASGFGVEGSFEGIFEYLNTKYINLQN |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
orf17 | AAO17183.1 | Orf17 | Not tested | tcd island | Protein | 9e-95 | 47 |