Name : WKK_00380 (WKK_00380) Accession : YP_004725631.1 Strain : Weissella koreensis KACC 15510 Genome accession: NC_015759 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : - Position : 78333 - 81017 bp Length : 2685 bp Strand : - Note : COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) DNA sequence : ATGGGGAAACCAAAACTATTATTAATTGATGGGAACTCATTAGCATTTCGTGCATTTTATGCACTCATTAATCAGGTGGA CAGATTTGTTAATCATGATGGCTTACATACTAATGCGTTAGTTGGTTTTAACAACCTTCTTGATGGGATTGTAGATCCAT TTGAACCGGATAAAGCCTTAGTCGCTTGGGACGCTGGGAAAACAACTTTCCGTACGAATGCCTACGATAATTACAAAGGA AATCGGGATAAAACGCCCCAAGAATTAGTGGAGCAATTTGAACCGCTGCGTGAAATGGTTCGTTTACATGGAATTACAAA TTATGAATTAGCTGATTATGAAGCAGACGATATTATTGGAACAATGGCTCACGCAGGCGTAGAATCTGGATATGCAGTTA CGATTGTGACTGGTGATCGAGACATGCGTCAATTAGTGGATGACGATATCACAGTTTGGATCACTAAAAAGGGTATCTCT GAAATTGATAAATATACTCCCGCTGAAGTAGCTGATGTTTATGGCGGTTTGACCCCAAAACAAGTGATTGAAGTAAAGGG GTTACAAGGTGATCCATCTGATAATTATCCTGGTGTTCCAGGGATTGGTGAAAAAACGGCCATTAAGTTAATTCAGGAAT ATCATGATATTCCTGAATTATATGAACAAATTGATATGATGAAGAAGTCTAAACGCAAAGAAAATTTGATTCAATATAAG GATGATGCTTTCTTATCACGGGATTTAGCTCGTATTCGTCTTGATGCACCAGTGACTTTGGATTTAGATGATCTAGCATA TCGAGGAATTCAATATCAGGATTTAATTCCGTTTTATCAGCATTTGGATTTTAAACAACAACTAGTAAAATTAGCTAATC AAGGATACACAATTACTGGAACTCAAAATGAAAGTAACCCTACTGTAAAACTTAATGTTGCTCCTTTAACAGCTAATAAT TTAGCTCACGTAGAAGCTTTACAAGATGATGTTGACTTTTATGTAGAGTTAGATGGAGAAAATTATCATCGCGCAGCTAT TGTTGGTTTTGTTATCGGGAATCAACAACAAGGGTATTTAGCTAGTCGTGACTTAGAGTTATTATCACAAGATACACCTG TGAAAAGAATCTTGGAAAATAATAAAATCAAGAAAAATGTTTTTAATTCAAAAGAAACATTTGTGGCCTTGCACCGCTAT AACGTTGATTTAACTGGAGTTGATTTTGATTTGCTACTGGTTTCATATTTATTGAATGTCAATGACAATAGTAATGATTT AGGTACCATTGCACATGAGCATAATTATTTCGATGTTCAAACAGATGATGAAGTTTATGGAAAAGGAGCCAAATTTGCGA TCATAGATAATGATACTGATTTTTTTGAACATTTGGGTCGTAAAGCACAAGCAATTGGCGCCTTAAAACAGCCACTCATG CAAAAATTAGATGAGCATGAACAGACTGATTTATATACTGAAATTGAATTGCCTTTAACGTTTGTTTTGGCACATATGGA AATTAATGGGATTACGGTTAATGCTGAACGTTTATTGGGCATGCAGTCAAAATTAACCGAGCGTCTATCAGAATTAGAAC AAACGATTCATCAACAAGCGGGCCACGAATTTAATATTCAATCCCCTAAACAACTGGGGGTGATTTTATTTGAAGAAATG GGTCTAAAACCTTTGAAGAAAACTAAAACTGGTTATTCAACATCAGTAGAAGTTTTGGAACAAATGACAGACGTTCCATT AGTTGCATCAATTTTACAATATCGGCAATTAGCTAAGATCTTATCGACATATGTTGATGGATTACTACGAGTTATTCATG GTAGCGATTCAAAAGTACATACCCGATACTTACAGACTTTGACACAAACGGGTCGTTTATCATCTATTGATCCTAATTTG CAAAATATTCCTGTACGTGTCGAGGAAGGCCGACAAATTAGAAAAGCTTTTGAACCACAACAAGCTGGGTGGTCGTTATT AAGCGCTGATTATTCACAAATTGAATTACGAGTATTAGCACATATTACAAATGATGAAAAAATGCGGCAAGCCTTCATTA ATGATGAAGACATTCACGCAGCAACTGCGCGTCGTATTTTTGGTCTTGCTGAAGATGCAGTCGTGGATAGTAATTTAAGA CGCCAAGCAAAGGCCGTTAATTTTGGAATTGTTTATGGTATTTCTGAGTTTGGCTTGGCTAAAAATATTGGTACGGATCG TAAAACTGCTAAAAGTATAATTGATACTTACTTAAATGAATATAGTGGAGTTAAAAAGTGGACCGAGGAGATTATTTTAG ATGCTCGTGAAAAGGGCTACGTTGAGACGATTGCACATCGGCGACGCTATTTACCAGATATCAAGGCAAAAAGCTTTAAT GCACGTAGTTTTGCTGAACGAACAGCAATGAATACTCCGGTTCAAGGGTCAGCGGCTGATATTATCAAAATTGCTATGAT TAAAATGCAATCTGTAATGGAACAAAAGCAACTTAAGTCCAAAATGCTACTTCAAGTACATGATGAATTGATTTTTGAGG TACCTGAAGACGAATTAACGTTAATGCATAAATTAGTACCTGAAGTTATGGACTCAGCTGTAAAGTTGACTGTGCCTTTG AAGGTTGAAACGCATGAGGGTAAGACTTGGTATGATGCAAAATAA Protein sequence : MGKPKLLLIDGNSLAFRAFYALINQVDRFVNHDGLHTNALVGFNNLLDGIVDPFEPDKALVAWDAGKTTFRTNAYDNYKG NRDKTPQELVEQFEPLREMVRLHGITNYELADYEADDIIGTMAHAGVESGYAVTIVTGDRDMRQLVDDDITVWITKKGIS EIDKYTPAEVADVYGGLTPKQVIEVKGLQGDPSDNYPGVPGIGEKTAIKLIQEYHDIPELYEQIDMMKKSKRKENLIQYK DDAFLSRDLARIRLDAPVTLDLDDLAYRGIQYQDLIPFYQHLDFKQQLVKLANQGYTITGTQNESNPTVKLNVAPLTANN LAHVEALQDDVDFYVELDGENYHRAAIVGFVIGNQQQGYLASRDLELLSQDTPVKRILENNKIKKNVFNSKETFVALHRY NVDLTGVDFDLLLVSYLLNVNDNSNDLGTIAHEHNYFDVQTDDEVYGKGAKFAIIDNDTDFFEHLGRKAQAIGALKQPLM QKLDEHEQTDLYTEIELPLTFVLAHMEINGITVNAERLLGMQSKLTERLSELEQTIHQQAGHEFNIQSPKQLGVILFEEM GLKPLKKTKTGYSTSVEVLEQMTDVPLVASILQYRQLAKILSTYVDGLLRVIHGSDSKVHTRYLQTLTQTGRLSSIDPNL QNIPVRVEEGRQIRKAFEPQQAGWSLLSADYSQIELRVLAHITNDEKMRQAFINDEDIHAATARRIFGLAEDAVVDSNLR RQAKAVNFGIVYGISEFGLAKNIGTDRKTAKSIIDTYLNEYSGVKKWTEEIILDAREKGYVETIAHRRRYLPDIKAKSFN ARSFAERTAMNTPVQGSAADIIKIAMIKMQSVMEQKQLKSKMLLQVHDELIFEVPEDELTLMHKLVPEVMDSAVKLTVPL KVETHEGKTWYDAK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 51 |