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Name : WKK_01635 (WKK_01635) Accession : YP_004725882.1 Strain : Weissella koreensis KACC 15510 Genome accession: NC_015759 Putative virulence/resistance : Unknown Product : betaine ABC transporter permease and substrate binding protein Function : - COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism COG ID : COG4176 EC number : - Position : 326640 - 328358 bp Length : 1719 bp Strand : - Note : COG4176 ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component DNA sequence : ATGCTTAATTTATTATTACTAACCTCTAAAATTCCATTAGCTGAATATGTTGAGAAGATTGTAAATTGGTTGACTGATAA CTGGACTGGTTTCTTTGGAGCTATCCAAACCGGTGGGCAAGCCTTGATGGACTGGTCTAATGCAGCCTTAGGTGCGATTC AACCAATTATTTTGATTATTGCATTAACGATTTTTGCACTCTTAATTAGTGGTAAAAAATGGACTTTCCCACTCTTTACA GCTTTAGGACTACTTCTAGTTTGGAACCAAGGATTATGGTCAGACTTAATTCAAACAACGACTTTGGTATTATTATCAAG TATCTTGGCTATTATTATTGGAGTTCCTCTAGGAATTTGGATGTCAAAATCTAACACTGTTGATAAAATTGTTCAACCGC TACTTGATTTGATGCAAACTATGCCTGGTTTCGTTTATTTGATTCCAGCAGTTGCTTTCTTTGGAATTGGGGCAGTACCA GGAATTTTCGCCTCATTGATCTTCGCTTTGCCCCCAACAGTACGCTTTACTAGTTTGGGAATTCGACAAGTGCCAACAGA AATGGAAGAAGCAGCTGATTCATTTGGATCAACTGCTTGGCAAAAATTATTTAAGGTTGAATTGCCATTAGCTAAATCAA CTATTTTAGCGGGAGTTAACCAATCGATTATGTTAGCTCTTTCAATGGTTGTTATGGCCTCAATGGTTGGGGCGCCTGGC CTTGGTCAAGGAGTTTTAGCAGCCGTTCAAAAAGCGGATGTTGGTAGTGGATTCGTTAGCGGATTTGCTTTGGTTATCTT AGCTATTGTGATTGATCGATTTGTTCAATTCACAAATGTTGAGCCTGCCAAGCAAGAACCTAAGAGCCCTATGAAAAAAT GGATTGGGGCAATTACAGCCGTTGTTTTGTTGGGTAGCATGGTAGTAGGATTATTCCATACACAACAGCAATCAAAGAAG TCAGTTGATCTAGTTTATGTACAATGGGATTCTGAAGTAGCTTCAAATAATGTTTTAGCTGAAGCAATGCGTCAACATGG TTATCAAGTTAATTTAACACCGCTTGATAACGCAGTTATGTGGCAAACTTTAGCTAATGGTCAAGCTGATGCATCTGTAT CTGCTTGGTTACCCAATACTCAAAAAGCTCAATATCAAAAATATCATGATCAATTAGATATTTTAGGCCCAAATTTGAAG GGCGCTCGAGTAGGATTAGTTGTTCCTTCTTATATGGATGTAGACAGTATTGATGATTTGCAACAAGAGGCTGATCAAAC GATTACTGGAATTGAACCTGGTGCTGGTGTTGTTGCAGCTGCTCAAAAGGCTGTAAAAGAGTATCCAAATTTGAGTGGTT GGCAAGTCCAAACTTCTTCAACTGGATCAATGGCAGTTACTTTAGATAAAGCTATCAAGCAACATCAACCAATCGTAATT ACTGGTTGGTCACCACATTGGATGTGGCAAAAATATGATCTTAAGTATTTAGCTGATCCAAAGGGTGTAATGGGTAAGAG TGAGAGCTTGAATACCATGACTCGTAAAGATTTGAAGGAAAGCAAGCCAGATGTTTATAAAGTAATGAAAAAATTCAAAT GGCAACCTGATGATATGGAAAGTGTAATGTTGGATATTAGTGGTGGGTCAACACCGCAATCAGCTGCTAAAAAGTGGATT AAAGCCCACCAAAAAGAAGTTGATGCTTGGTTTGAATAA Protein sequence : MLNLLLLTSKIPLAEYVEKIVNWLTDNWTGFFGAIQTGGQALMDWSNAALGAIQPIILIIALTIFALLISGKKWTFPLFT ALGLLLVWNQGLWSDLIQTTTLVLLSSILAIIIGVPLGIWMSKSNTVDKIVQPLLDLMQTMPGFVYLIPAVAFFGIGAVP GIFASLIFALPPTVRFTSLGIRQVPTEMEEAADSFGSTAWQKLFKVELPLAKSTILAGVNQSIMLALSMVVMASMVGAPG LGQGVLAAVQKADVGSGFVSGFALVILAIVIDRFVQFTNVEPAKQEPKSPMKKWIGAITAVVLLGSMVVGLFHTQQQSKK SVDLVYVQWDSEVASNNVLAEAMRQHGYQVNLTPLDNAVMWQTLANGQADASVSAWLPNTQKAQYQKYHDQLDILGPNLK GARVGLVVPSYMDVDSIDDLQQEADQTITGIEPGAGVVAAAQKAVKEYPNLSGWQVQTSSTGSMAVTLDKAIKQHQPIVI TGWSPHWMWQKYDLKYLADPKGVMGKSESLNTMTRKDLKESKPDVYKVMKKFKWQPDDMESVMLDISGGSTPQSAAKKWI KAHQKEVDAWFE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| opuABC | YP_281522.1 | glycine betaine-binding protein/glycine betaine transporter permease | Not tested | Not named | Protein | 2e-151 | 58 |
