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Name : LGMK_04190 (LGMK_04190) Accession : YP_004705519.1 Strain : Leuconostoc sp. C2 Genome accession: NC_015734 Putative virulence/resistance : Unknown Product : betaine ABC transporter permease and substrate binding protein Function : - COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism COG ID : COG4176 EC number : - Position : 861811 - 863517 bp Length : 1707 bp Strand : - Note : COG4176 ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component DNA sequence : ATGCCTAATTTACCTAAGATACCGTTAGAAAATTGGATTAGTGATATTGTCAGTTGGTTAACAACGCATTTATCAGGGTT ATTCAATTTGATGCAAAAGGGTGGACAAAATGTTATGGACGGCATAACAAACGGTTTAACAGCTGTTCCGATGCCGTTGA TGATAATTGGTTTAACGCTTATAGCTGTATTAACAACACGAAAAAAATACGGTTTCCCAATATTTACCTTTATTGGATTA GCATTGATTGCTAATCAAAATTTGTGGTCTGACCTAATGAGTACAGTGACATTGGTGATCATGGCGTCCGTCATATCGCT TGTTATTGGTATTCCGTTAGGAATTTTAACTGCTAAGTCTCCTAAAACAGCAGCGATAGTGAAGCCAATTCTAGACTTTA TGCAGACAATGCCTGGCTTCGTCTATCTGATACCAGCTGTTGCATTCTTTGGTATTGGTGTTGTACCCGGCGTGTTTGCT TCGATTATTTTCGCCTTACCACCAATGGTTCGAATGACTGATTTAGGTATTCGTCAAGTACCAATTGCTTTAGTTGAGGC TGCTGATTCGTTTGGATCAACAACATGGCAAAAATTGATTAAGCTCGAATTACCTAATGCACGTAATACCATTTTAGCTG GTGCTAACCAAACAATCATGTTAGCATTGTCGATGGTTGTTACAGCTTCTATGATTGGGGCCCCTGGTCTTGGACGTGGT GTCTTGTCTGCTGTACAACGTGCTGATGTGGGTTCTGGATTTGTTAACGGATTAGGGTTAGTTATTTTAGCTATTATTAT TGATCGTTTTACTCAAAAGTTAAATACAACACCTGGTCAGAAATCAATTAGTAAACCTTGGCGTCGCTGGGCCGTACTAG CTACGGTAGTTGTGATGATTGGTGGCGGCGTTGTGAATGCCATGACATCACATAAAACGACAGGCCAAAAAGTGACATTA GGGTATGTTGCATGGGACTCTGAGGTTGCTTCAACAAATGTGCTTGCGCAATCGTTACGTCAACATGGCTATGACGTTAC CATGACGCCCCTGGATAATGCTGTTTTATGGCAGTCAGTAGCTAATGGTCAAGTTGATGCATCTGTGAGTGCTTGGCTAC CATACACGCATAAAGCATTGTATGACAAGTATAAGAATGATATATCATTACTTGGACCTAATCTTCATGGTGCCAAAACA GGGTTCGTCGTACCTGATTATATGAAAGTAAATTCAATTGCTGACTTGAAAAATGAAGCTAATAAAACAGTAACTGGGAT TGAGCCCGGAGCAGGTGCTATGATAACCGCACAAAAGACGGTTGATAGTTATCCTAATCTTAAAGGATGGCAACTGTCGT CGTCATCTTCAGGCGCCATGACTACTGCGCTTGATAAAGCATATAAGGCAAAACAAGATATTATTGTGACGGGTTGGTCA CCTCATTGGATGTTTAGTAAGTATAAGTTAAAGTATTTAGAAGATCCAAAAGGTACAATGGGTAAGAATGAAACAATTAA TACCATTGTGCGTAAGGATTTGAAGCATGATAATCCTAAATTTGAAAAAGTGATGAATAAATTCAATTGGACGAAAGACG ACATGGAAAGTGTCATGCTTGACATACAAAATGGTCAATCACCAGAACAAGCTGCAAATAAATGGTTGAAATCACATGCC AAATTGGCCGATAGTTGGTACAAGTAA Protein sequence : MPNLPKIPLENWISDIVSWLTTHLSGLFNLMQKGGQNVMDGITNGLTAVPMPLMIIGLTLIAVLTTRKKYGFPIFTFIGL ALIANQNLWSDLMSTVTLVIMASVISLVIGIPLGILTAKSPKTAAIVKPILDFMQTMPGFVYLIPAVAFFGIGVVPGVFA SIIFALPPMVRMTDLGIRQVPIALVEAADSFGSTTWQKLIKLELPNARNTILAGANQTIMLALSMVVTASMIGAPGLGRG VLSAVQRADVGSGFVNGLGLVILAIIIDRFTQKLNTTPGQKSISKPWRRWAVLATVVVMIGGGVVNAMTSHKTTGQKVTL GYVAWDSEVASTNVLAQSLRQHGYDVTMTPLDNAVLWQSVANGQVDASVSAWLPYTHKALYDKYKNDISLLGPNLHGAKT GFVVPDYMKVNSIADLKNEANKTVTGIEPGAGAMITAQKTVDSYPNLKGWQLSSSSSGAMTTALDKAYKAKQDIIVTGWS PHWMFSKYKLKYLEDPKGTMGKNETINTIVRKDLKHDNPKFEKVMNKFNWTKDDMESVMLDIQNGQSPEQAANKWLKSHA KLADSWYK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| opuABC | YP_281522.1 | glycine betaine-binding protein/glycine betaine transporter permease | Not tested | Not named | Protein | 5e-151 | 57 |
