Gene Information

Name : LGMK_01325 (LGMK_01325)
Accession : YP_004704950.1
Strain : Leuconostoc sp. C2
Genome accession: NC_015734
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : alpha-glucosidase
Function : -
COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism
COG ID : COG0366
EC number : -
Position : 281563 - 283239 bp
Length : 1677 bp
Strand : +
Note : COG0366 Glycosidases

DNA sequence :
ATGACAAAGAATATTAAATGGTGGCAAAAGGCAGTAGTTTATCAGGTCTATCCACGCTCGTTTCAAGATGCTAATGGCGA
TGGTATTGGCGATTTACAAGGGATTGAGCAACGATTAGATTATATCGAAAAATTAGGTGCTGACGTCATTTGGTTGAATC
CAATTTACGCCTCACCTGATAAAGATAATGGCTATGATATCTCTGATTATGAAGATATCAATGCAAAATTTGGTAATATG
GCTGATTTTGATCGTTTACTTCAAAAAGCCCACGACAAAAATATTAAAATTTTGATGGATTTGGTTGTTAATCATACCTC
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TTGATGGACACGAGCCAAACAACTGGGGGTCTTTCTTTTCTGGTCCAGCTTGGAAATTTGATGATGAAAGCGGTCAATAT
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CAGGAAATGCGTCAAAAAGTGTTAAATAGAGCTGATATGATGACAGTTGGTGAAGCTTCTGGGGTTGATATTGATAACGC
TATTAAGTATGCTGCCAAAGATACTTCTGAATTAAATATGGTTTTCCAATTTGAACATATGGGATTAGATAATAACCCTA
ATCCAGCGCTTGGTAAGTGGTATGATAAAAAAGTGAATTTGATTGATTTGAAACAGAATTTATCAAAATGGCAAAATAAA
CTGGCGAATAAGGCTTGGAATTCCCTTTACTGGGATAATCACGATCAGCCACGTGCAGTGAGTCGATACGGTGATGACCG
ACCAGAATATCGTGTTGTTTCAGCAAAAATGGCTGCAACATTGCTTCACTTCATGCAGGGAACACCTTATATTTATCAAG
GTGAAGAAATTGGTATGACCAATGCTTATAATTTAAAACGTGCAGATTTTGACGATATTGAAATTAAAAATGCCTTTAAA
TATTTGATCGATAAAGATCACTTAACAGATGAAGAGACAATGCTGCGTTATGTTCACGCGAAAGGACGCGATAACGCACG
CACACCCATGCAGTGGGATGATAGTCAAAATGCTGGGTTTACAACAGGTGAACCATGGCTTAAGTTAAATGATAACTTTC
AAACGATTAATGCTCAAGAAGCATTAGTTGATCCACAGTCAATTTTTTATTATTACCAAAAACTGATTCGCTTGCGACAT
GAGTTGCCTATTATCACAACAGGGACGTATCAGCTTTTGGATTCAGATGACGATCAAGTATATGCTTATCGACGTGTGTT
AGATAATGAACAACTGCTTGTTATTAACAATTTTACTGATCAAGTGCTAAACCGTGATTATCATGTAGACCTGAATGCCG
ATGTGCTGATTAGTAACTATGAAGACGATCAGGGTAGTACGTTACGTCCTTACGAATCAAAAGTTTATCGATTTTGA

Protein sequence :
MTKNIKWWQKAVVYQVYPRSFQDANGDGIGDLQGIEQRLDYIEKLGADVIWLNPIYASPDKDNGYDISDYEDINAKFGNM
ADFDRLLQKAHDKNIKILMDLVVNHTSDQHKWFIESRSSKTNDKRDFYIWRDPVDGHEPNNWGSFFSGPAWKFDDESGQY
YLHLFVEGQPDLNWVNPKVRQSVFDMMNFWVDKGIDGFRMDVISLISKPDGLPDGEVPEGGEYGNSDRAVANGPHVHEYL
QEMRQKVLNRADMMTVGEASGVDIDNAIKYAAKDTSELNMVFQFEHMGLDNNPNPALGKWYDKKVNLIDLKQNLSKWQNK
LANKAWNSLYWDNHDQPRAVSRYGDDRPEYRVVSAKMAATLLHFMQGTPYIYQGEEIGMTNAYNLKRADFDDIEIKNAFK
YLIDKDHLTDEETMLRYVHAKGRDNARTPMQWDDSQNAGFTTGEPWLKLNDNFQTINAQEALVDPQSIFYYYQKLIRLRH
ELPIITTGTYQLLDSDDDQVYAYRRVLDNEQLLVINNFTDQVLNRDYHVDLNADVLISNYEDDQGSTLRPYESKVYRF

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
malL YP_251987.1 oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase Not tested SCCmec Protein 2e-159 56