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Name : LGMK_05685 (LGMK_05685) Accession : YP_004705818.1 Strain : Leuconostoc sp. C2 Genome accession: NC_015734 Putative virulence/resistance : Unknown Product : translocase Function : - COG functional category : U : Intracellular trafficking, secretion and vesicular transport COG ID : COG0653 EC number : - Position : 1156691 - 1159105 bp Length : 2415 bp Strand : - Note : COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase) DNA sequence : ATGGCAAATCCAATACGTAAATTAGTTGATAATTCAAAAAAGCAACTAAAAAAATTAAATCATATTGCTGAGCAAGTAGA AAGCTATGCCGATCAAATGTCTGCAATGTCTGATGAAGCTTTGCAAGCAAAAACACCACAGTTTAAGCAAATTATTGCTG ATGCATTAGCAGATGTTAAAGATAAAGACAAACAGAACAAAATATTAGCGAAGACTTTAGATGACATTTTACCTGAGGCT TTTGCTGTGGCACGTGAAGGTGCGAAAAGAGTCCTTGGATTATATCCTTTCCATGTACAAATTATGGGATCAGCAGCGTT ACATGATGGTAACTTAGCTGAAATGCGTACAGGAGAGGGAAAAACATTAACGGCTACTATGACAGTTTATCTTAACGCGC TGTCAGGTCGCGGTGTGCATGTTGTCACGGTTAATGATTATTTATCATCTCGTGATGCTGAGCAGATGGGGCAATTATAT CATTGGCTTGGATTGTCAGTTGGAGTCAATGTAGGTGACGCACCTGCAGAAGAAAAACGTGCGGCTTATGATGCCGACAT TACGTATTCGACTAATTTTAATATTGGTTTTGATTACTTGCGTGATAATATGGTTCGTCGAGCAGATGAACGCGTGATGC AGCGTGGTTTGAACTTTGCCTTAATTGATGAAGCAGATTCTATTTTAATTGATACTGCCCGTACACCATTGATTATTTCT GGACCTGGGTCAGGGGTATCACAACTTTATGGACGTGCTGATCGTTTTGTCAAAACGTTACAGTTTGATGAAGATTACAA AATTGATGAAGAAGCTAAAACAACAATGCTAACAAATGAAGGCATTCATAAAGGTGAAATTTTCTTTAATTTAGATAATT TATATGATGCCGGCGATACAGCTTTAACACATCACATTGATCAAGCCTTACGTGCGAACTTTAACTATATTAACGATAAA GATTATGTTGTTCAAAATGGGGAAGTTAAGTTAATTGATCAAGCCACAGGTCGTATTTCCGAAGGAACACGTCTATCAGA TGGACTACATCAAGCAATTGAAGCCAAAGAAAATGTTGAGATTCAAGAAGAAAACAAATCGATGGCGCAAATTACATATC AAAACTTATTCCGTATGTATAAAAAGCTCTCCGGTATGACTGGTACTGCTAAAACAGAGGAAGAAGAATTACGCGAAATT TATAATATGGAGGTTGTTACGATTCCGACCAACCGACCAATTAAACGTGTTGATTATGCTGATTTGTTATATCCATCTGT CCGTGCAAAATATAATGCCGTTGTTAATTTAATACAGGAGTTGCATGCCAATGGTCAACCAATTTTAATTGGTACTGGGT CAGTAGAGTCTTCTGAATTGCTATCAAAGATTTTAATGGCACAAAATGTTCCTCATAATGTTTTAAATGCTAAAAATAAC GCAAAAGAAGCAGAAATCATTGCAAATGCAGGGCAACGTGGTGCAGTTACTGTAGCAACAAATATGGCGGGACGCGGAAC CGATATTAAGCTTGGGCCAGGTGTCGCTGATTTAGGTGGCTTGGCTGTTATTGCAACTGAGCGTCACGAGTCACGACGAA TAGATAACCAATTACGTGGTCGTGCAGGCCGTCAAGGTGATGCGGGCTTTTCTCAGTTCTTTTTGTCACTTGAAGACGAT TTGATGATCCGTTTTGGTGCAGATCGTATTCGTGCTGTCTGGGAACGAATGAATCTTGATGAAGAAGAGACTGTTATCAA AAATCGTATGATTACACGCTCAGTAGAATCTGCTCAGAAGCGTGTTGAAGGTAATAACTATGACACACGTAAAAACGTTT TACAATATGATGATGTTGTTCGTGAACAGCGTGAATTGATTTATCATCAGCGTGATGTTGTCATTGATGAGTCAAAGTCT TTAGAGTGGGTTTTGATGCCGATGGTGGAAAGAACGATTAACCGCGTGGTAGATGCGCAAACAATCAGCAAAAAGTCCTC AGGTTGGCATCTTGAACAAGTGATTACTTTTGCCAATAACGCTTTGGTCCATGAAGGAGATATCACGGCTTCACAATTAC AAGAGTTATCACGTGATCAAATTAAATCAAAGCTGTTTGACCTTGCTAAAATAAACTATAAAGCTAAAAAAGGGCAATTA TATGATCCTGAACAAATGCTTGAATTTGAAAAAGTTGTGATTTTACGTGCAGTAGATCAACACTGGACAGACCATATCGA TTCATTGGATCGCTTGCGTCAAGGTGTTGGATTACGTGGTTATGGGCAATTGAATCCACTCATAGAATATCAAAATGAAG CATTTGAAAACTTTAATAAGATGATTGTTGATGTCGAATACGATGCAACACGTACGTTTATGAAAGCTGAAATTCGTCAG AATTTAAAAGCGTAG Protein sequence : MANPIRKLVDNSKKQLKKLNHIAEQVESYADQMSAMSDEALQAKTPQFKQIIADALADVKDKDKQNKILAKTLDDILPEA FAVAREGAKRVLGLYPFHVQIMGSAALHDGNLAEMRTGEGKTLTATMTVYLNALSGRGVHVVTVNDYLSSRDAEQMGQLY HWLGLSVGVNVGDAPAEEKRAAYDADITYSTNFNIGFDYLRDNMVRRADERVMQRGLNFALIDEADSILIDTARTPLIIS GPGSGVSQLYGRADRFVKTLQFDEDYKIDEEAKTTMLTNEGIHKGEIFFNLDNLYDAGDTALTHHIDQALRANFNYINDK DYVVQNGEVKLIDQATGRISEGTRLSDGLHQAIEAKENVEIQEENKSMAQITYQNLFRMYKKLSGMTGTAKTEEEELREI YNMEVVTIPTNRPIKRVDYADLLYPSVRAKYNAVVNLIQELHANGQPILIGTGSVESSELLSKILMAQNVPHNVLNAKNN AKEAEIIANAGQRGAVTVATNMAGRGTDIKLGPGVADLGGLAVIATERHESRRIDNQLRGRAGRQGDAGFSQFFLSLEDD LMIRFGADRIRAVWERMNLDEEETVIKNRMITRSVESAQKRVEGNNYDTRKNVLQYDDVVREQRELIYHQRDVVIDESKS LEWVLMPMVERTINRVVDAQTISKKSSGWHLEQVITFANNALVHEGDITASQLQELSRDQIKSKLFDLAKINYKAKKGQL YDPEQMLEFEKVVILRAVDQHWTDHIDSLDRLRQGVGLRGYGQLNPLIEYQNEAFENFNKMIVDVEYDATRTFMKAEIRQ NLKA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secA2 | YP_006310687.1 | preprotein translocase subunit SecA2 | Not tested | FWisland_3 | Protein | 9e-147 | 42 |
