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Name : polA (HMPREF0538_20261) Accession : YP_004648764.1 Strain : Lactobacillus reuteri SD2112 Genome accession: NC_015697 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA-directed DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : 2.7.7.7 Position : 247201 - 249867 bp Length : 2667 bp Strand : - Note : COG: COG0749 DNA sequence : ATGACAAAACAATTATTGTTAATTGACGGAAATAGTATTGTTTTCCGGGCATTTTTTGCCATGCATAACCAAATGGACAA GTTTACAAATAAGGACGGCTTGCATACGGCTGCAATTTATGGCTTTAAGTTGATGCTTGACCATGTGTTGCAAAACTTTA AACCGGATACGGCTTTAGTAGCCTTTGATGCAGGGAAGGTAACCTTCCGGACGAAAATGTATGATGACTATAAGGGTGGT CGAAACAAGACGCCTAATGAATTGACCGAGCAAATCCCTTATGTGCGTGAATTGATCAAAGACTCTGGGTTACATAGTTA TGAATTAGCTAACTATGAGGCTGACGATATTATCGGTACTTTGGCTAAGCAGGCGGATGATGCTGGCTACAAGACGTTGA TCGTAACTGGAGATCGGGACCTTACCCAGTTAGCAAGTGAAAATACAACCGTTGCCGTTACCCACAAGGGAGTTACTGAC ACGGAACACTATACGCCAGCGCATGTCGAAGAAAAATTAGGAATTACCCCACGCCAAATAATTGATATGAAGGCATTGAT GGGTGATTCTTCCGATAATTATCCTGGTGTAACTAAAATTGGAGAAAAGACGGCGATCAAACTTGTGAAACAGTTTGGTT CGGTTGAAGAGCTTTATGACCATATTGATGACCTCAAAAAGAGTAAGATGAAAGAACATTTGATTGAGGATGAAGAGATT GCTCGCCAATGTAAGACGTTAGCGACAATTCTTCGGGATGCTCCGCTCAAGATTGGCCTAGATGATTTGCAATACCAAGG TCCACAAACGGATGACTTGATTAAGTTTTACAAAGAGATGGGCTTTAAATCTTTCTTGAAAAAGATGGATATCGATGGGG CTGGAGAGGAAGACGAAGCTGAGATTGCTCCAATTGACTACACAGTTTTAACTAAAGATAACTTAGATGAACTAGGACAA TTAACGGGTGAAGTAAGTTTTTACCTTGAAATGCCAGCAGAAAATTACCACACGTCACCATTCGCTGGTTTTGTGATCGG CAATGAAGGACACTGGTTTACGAGTCGAGATGTGGACCTGCTTAAAGAGGCGCCTCTCAAGGATTTACTCCAGAGTGATA GTGTTAAGAAGAATGTCTTTAATGCCAAGGCACAAATCGTTGGACTTCATCGCCTCGGTATTCCGCTTGAAAATATTAAT TTTGATCTGCTTTTGGCATCTTACCTTCTAAATACTAATGACAATAGTAACGACCTGGGACAAGTAGCTCAGGAACACGG TTATGATGATGTACGAACAGATGAGGAAGTTTATGGTAAAGGTGCTAAGCGTGCTGTGCCTGATGATGACGAGACCTTCT TTAGTCACCTGGCTACGAAAGCGCGGGCAATTGAACATCTGCGTAAGGATTTTTTTGCCAAATTAGATGAAAATAAGCAA ACGCCGCTATATACCGATATTGAATTACCGCTAACCCGGGTTCTTGCAAAAATGGAAATCGCGGGTGTCCATGTAGATGC ACAAACTTTGAAAGATATGGGTAGTAAATTAACTGAACGGCTATCAGAAATTGAAAGTCAGATCTATCAAGAAGCTGGCG AGGAATTTAACATTAACTCCACTAAGCAACTAGGCCATATTCTGTTCGAAAAATTGAAATTGCCAGTGATCAAAAAGACC AAGACCGGTTATTCCACTGCAGTTGATGTGCTGGAAAAGTTAGCTGATAAGTCACCGATTGTTGAGCAAATTTTGGAATA TCGTCAAATTGCTAAGCTTCAATCTACCTATATCACTGGTTTGCTGAAAGTTATCCATTCAAATGACCAGAAGATCCATA CGCGCTACTTACAGACATTAACGCAAACTGGTCGCTTGTCTTCTGTTGATCCTAACCTGCAAAATATTCCAGTACGGTTG CCGGAAGGGCGCTTAATCAGAAAGGCATTTGTTCCTAGTCATGAAGGTTGGCAAATCTTCTCTTCAGATTATTCGCAAGT TGAATTACGGGTTCTTGCTCACATCACTGGTGACAAGAACCTTCAGGAAGACTTTAAGAATGGTGAAGATATTCATGCTA GTACAGCTCGCCGAATTTTCCATCTAGCCCCTGATGCCGAGATTGACCGTAATATGCGGCGTCGGGCAAAAGCAGTTAAT TTTGGAATTGTTTACGGGATTAGTGATTACGGACTGGCACAACGGATTCATGTTAGTCGTGCAGAAGCTCATGAATTTAT TCAAAATTATTTCCATGAATTCCCCGGTGTAAAGAAATACATCAATGACACAATTGCGTTTGCTAAAGAAAATGGTTATG TTGAGACGATTACTCACCGTCGTCGTTACTTACCAGATATTCATGCCAAAAGTTTTAGCAAGCGATCATTTGCAGAGCGG ACTGCAATGAATACGCCAATTCAGGGGAGCGCTGCTGATATCATTAAGATTGCGATGATCCGGATGCAAGATGAGCTTGA GAAACGCCATCTAAAGGCAAAAATGCTCTTGCAGATTCATGATGAGTTAGTCTTTGAGGCTCCAAAGGAAGAAATCCCGA TTCTATCGGAATTGGTGCCAAAAGTAATGGATTCGGCCGTTAAGTTGGATGTGCCACTTAAAGTAGATAGTAAGTATGGG GATACCTGGTATGACCTTAAAAAATAG Protein sequence : MTKQLLLIDGNSIVFRAFFAMHNQMDKFTNKDGLHTAAIYGFKLMLDHVLQNFKPDTALVAFDAGKVTFRTKMYDDYKGG RNKTPNELTEQIPYVRELIKDSGLHSYELANYEADDIIGTLAKQADDAGYKTLIVTGDRDLTQLASENTTVAVTHKGVTD TEHYTPAHVEEKLGITPRQIIDMKALMGDSSDNYPGVTKIGEKTAIKLVKQFGSVEELYDHIDDLKKSKMKEHLIEDEEI ARQCKTLATILRDAPLKIGLDDLQYQGPQTDDLIKFYKEMGFKSFLKKMDIDGAGEEDEAEIAPIDYTVLTKDNLDELGQ LTGEVSFYLEMPAENYHTSPFAGFVIGNEGHWFTSRDVDLLKEAPLKDLLQSDSVKKNVFNAKAQIVGLHRLGIPLENIN FDLLLASYLLNTNDNSNDLGQVAQEHGYDDVRTDEEVYGKGAKRAVPDDDETFFSHLATKARAIEHLRKDFFAKLDENKQ TPLYTDIELPLTRVLAKMEIAGVHVDAQTLKDMGSKLTERLSEIESQIYQEAGEEFNINSTKQLGHILFEKLKLPVIKKT KTGYSTAVDVLEKLADKSPIVEQILEYRQIAKLQSTYITGLLKVIHSNDQKIHTRYLQTLTQTGRLSSVDPNLQNIPVRL PEGRLIRKAFVPSHEGWQIFSSDYSQVELRVLAHITGDKNLQEDFKNGEDIHASTARRIFHLAPDAEIDRNMRRRAKAVN FGIVYGISDYGLAQRIHVSRAEAHEFIQNYFHEFPGVKKYINDTIAFAKENGYVETITHRRRYLPDIHAKSFSKRSFAER TAMNTPIQGSAADIIKIAMIRMQDELEKRHLKAKMLLQIHDELVFEAPKEEIPILSELVPKVMDSAVKLDVPLKVDSKYG DTWYDLKK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 52 |
