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Name : pdhD (HMPREF0538_21877) Accession : YP_004650376.1 Strain : Lactobacillus reuteri SD2112 Genome accession: NC_015697 Putative virulence/resistance : Unknown Product : dihydrolipoyl dehydrogenase Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1249 EC number : 1.8.1.4 Position : 1912408 - 1913835 bp Length : 1428 bp Strand : + Note : COG: COG1249 DNA sequence : ATGGCTGATGTTGAACAAAAGGATACAGTAATTGTTGGTGGAGGTCCTGGTGGTTATGTAGCCGCTATTCGAGCTTCAGA ATTAGGTCAAAAGGTTACCTTAATTGATAAGGGAGAACCAGGTTTAGGTGGTGTTTGTTTAAATGTTGGATGTGTACCAT CTAAAGCATTAATTGCTGCTGGCCACCGTTACCAAGAAACTTTAGACTCATCTATTTATGGTATTTCTAAAACCGATGCA AAGCTAGACTTTACTAAGACTCAAGAATGGAAGGACCATAAAGTTGTCGACCGTATGATTCGTGGAGTTAAGATGCTTTT GAAGAAGCATAAAGTTGAAATCATTGATGGAGAGGCAATTCTTGATAATGACCACCAACTTCGTGTAATCAAGCCTGGTC CAAAGCAATTCATGGATAATGATAATGGTCGTACTATCACGTGGAAGAATTTAATTCTTGCAACAGGAAGTCGTCCAGTA GAAATTCCTCATTTTAAGTTTGAAGGTCGTGTTATTGATTCAACCGGTGGCTTAAACCTTAAGGAAGTACCAGAAGAATT AGTTGTAATTGGTGGGGGCTACATTGGTACAGAATTAGCTGGTGCCTATGCTGATCTTGGTGCTCATGTAACGATTATTG AAGGTACTGATTCAATTCTTGGTGGATTTGACCACGATATGGTTGATATTGTTGTCAAGAATCTTGAAAAGAAGGGCGTA GACATTGTAACTAAGGCAATGGCTAAAGATTCTCAGCAAGATGAAAATAGCGTTACTGTCACTTATGAAGTTGATGGTAG CGAAAAGAGCATTAAAGCAGACTACTGCATGGTATCTGTTGGTCGTAAACCAAATACTGATGATTTTGGGCTTGATATGA CAAATGTTAAGTTAAACGACCGTCATCAAGTAATTGTTGATGAACAAGGCCGGACGAATGTACCTGGTATTTGGGCTATT GGAGATATTGTTCCTGGTCCTGCACTTGCTCACAAGGCATTCTTTGAAGCTAAGACTGCCGCTGGTGCCATTGCTGGTAA GAATACTGCTAACGATTGGGTTGGAGTACCAATGGTTTGTTTTGCTGATCCAGAATTAGCTCAAGTTGGTATGACGGTTG AAGAAGCTAAAGATAAAGGAATTGATGTATCTACTGCTCAATTCCCATTTGCCGGTAATGCCCGTGCTGTTTCTCTTGAT GCTGCCGAAGGATTTATTCGCTTAATCTACACTAAAGATAAGAAAAATGTTATTGGTGCTCAAGGTGTCGGTCCTGGTGT TAGTGACCTTGCTGGTGAACTTTCATTGATTGTCAACTGTGGTATGAATGTTGAAGATGTTGCTTTAACAATTCACCCAC ACCCAACATTGAATGAACCTGTTCAAGAAGCTGCAGATATTGCGCTTGGCTTCCCAACACATATTTAA Protein sequence : MADVEQKDTVIVGGGPGGYVAAIRASELGQKVTLIDKGEPGLGGVCLNVGCVPSKALIAAGHRYQETLDSSIYGISKTDA KLDFTKTQEWKDHKVVDRMIRGVKMLLKKHKVEIIDGEAILDNDHQLRVIKPGPKQFMDNDNGRTITWKNLILATGSRPV EIPHFKFEGRVIDSTGGLNLKEVPEELVVIGGGYIGTELAGAYADLGAHVTIIEGTDSILGGFDHDMVDIVVKNLEKKGV DIVTKAMAKDSQQDENSVTVTYEVDGSEKSIKADYCMVSVGRKPNTDDFGLDMTNVKLNDRHQVIVDEQGRTNVPGIWAI GDIVPGPALAHKAFFEAKTAAGAIAGKNTANDWVGVPMVCFADPELAQVGMTVEEAKDKGIDVSTAQFPFAGNARAVSLD AAEGFIRLIYTKDKKNVIGAQGVGPGVSDLAGELSLIVNCGMNVEDVALTIHPHPTLNEPVQEAADIALGFPTHI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SE0077 | NP_763632.1 | dihydrolipoamide dehydrogenase component of pyruvate dehydrogenase E3 | Not tested | SCCpbp4 | Protein | 2e-85 | 45 |
