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Name : tkt (SMB_G1371) Accession : YP_004636014.1 Strain : Clostridium acetobutylicum DSM 1731 Genome accession: NC_015687 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0021 EC number : - Position : 1492479 - 1494470 bp Length : 1992 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAATATAGATAATTTAGCTATAAATACTATAAGAATTCTTTCTGCAGAAGCTATACAAAAGGCAAAGTCTGGTCATCC TGGATTGCCTATGGGGTGTGCACCAATGGCATATACACTTTGGAGCAGACATTTAAAACATAATCCTAATAATTCCAAAT GGAAAGATAGAGATAGATTCGTGCTTTCAGCAGGACATGGTTCTATGCTCTTATATTCGTTACTTAATATATTTGGTTAT GATGTAAGTGTTGAGGAAATAAAAAACTTTAGACAATTCAAAAGTAAGACTCCAGGACATCCTGAGTATAGATGGACAGA TGGAGTAGAAACAACAACAGGACCTTTAGGACAAGGAATATGCAATGCTGTGGGAATGGCAATAGCGGAAACTTATCTAG CAAATAAATTTAATAAGGAAAGTTACAATATTGTAGACCATTATACCTATGCGCTTGTAGGTGACGGCTGTCTTATGGAA GGAATATCAGGAGAGGCAAGTTCTCTTGCAGGTACATTAGGTCTTGGAAAATTAATAGTTTTATATGATTCAAATAACAT ATCAATAGAAGGAAGTACAGACATTGCCTTTAGAGAAAACGTAGCTTTAAGATACGAAGCATACGGATGGCAGGTTATCA AAGTGGATGATGGTACTAATTTAGAAAAAATAGATTTAGCCATAAAGGAAGCTAAGGTAGAAAAAAATAAACCTACCATA ATAATAGTAAAAAATGTTATAGGATATGGCTGTCCATCAAAACAGGGTAAAGCAGCTGCTCATGGAGAGCCTTTGGGAGA AGAAAATTTAAAGCTCACAAAGGAAAATTTAAATTGGAATTATGAACCTTTTACTGTTCCGGAAGAAGTAAGAGCATACA CTAAAGAGTTTAAAGTAAGGGCTCAAAGACAAGAGGATAAGTGGAACAGTATGTTTGAAGAATATAAAAAGGAATATCCA AAGCTTTATAAAGAGTGGGAAGTTTGGTTTAGTGAAAAAACTCCAATGAAGCTATTAGATAATGGAGAATTTTGGAAGTT TGATAAAAACATGGCTACAAGACAGTCCTCAGGGGTTCTTATTAATAGACTTGCAAAACTTATTCCTAACTTAATAGGAG GCTCTGCTGATTTAGCACCATCAAACAAGACACATATGGATGACAGAGGAGATTTTTCAGCTGAAAACAGAAGTGGCTCT AATATGCATTTTGGAGTTAGAGAACATGCTATGGCAGCTATTGCAAATGGAATGTACTTGCATGGTGGACTTAAGGTATT TGTAGCAACCTTCTTTGTATTTAGTGATTACATGAAAGGAGCTATGAGACTTTCTTCTATAATGAAGCTTCCAATAGTTT ATGTTTTAACGCATGACAGTATTGGTGTAGGTGAAGATGGGCCAACTCATGAACCTATTGAGCAATTGGCAGCCTTAAGG TCTATGCCTAATATGACTGTGTTTAGGCCAGCGGATTCTAATGAAACTGCAGCAGCCTGGTATAGTGCATTAAATACTAA AAATGGACCAACAGCCTTAGTTTTAACAAGACAAGCACTTCCTTTATATGATTCTTCAGGAAAAAATGCTTTAAAGGGAG GATACATTCTAAAGGATTCTAAAAATAAAGAAAATCCAGATGTAATACTTATGGCTTCAGGTTCTGAAGTTGAGCTTATA TTAAATGCAGCAAAAGAGCTTCAAAATGAAAATATAGATGCAAGAGTTGTAAGTATGCCTTCCTTTGAAGTATTTGAAGA GCAAAGTGAAGACTATAAAAATTCTATATTACCTAGAAATATAAGAGCCAGAGTTGCAGTTGAAGCTGCATCACCTTTTG GGTGGCATAAATATGTTGGACTTGATGGCGAAGTGATTGCTATGGAGAGTTTTGGTGCATCAGGTAAATCAGATATATTA TTTAAAGAGTTTGGTTTTACTGTGGAGAATGTAGTTGAAAAAGTAAAAAATGTTTTGAAAAATTTAAAATAA Protein sequence : MNIDNLAINTIRILSAEAIQKAKSGHPGLPMGCAPMAYTLWSRHLKHNPNNSKWKDRDRFVLSAGHGSMLLYSLLNIFGY DVSVEEIKNFRQFKSKTPGHPEYRWTDGVETTTGPLGQGICNAVGMAIAETYLANKFNKESYNIVDHYTYALVGDGCLME GISGEASSLAGTLGLGKLIVLYDSNNISIEGSTDIAFRENVALRYEAYGWQVIKVDDGTNLEKIDLAIKEAKVEKNKPTI IIVKNVIGYGCPSKQGKAAAHGEPLGEENLKLTKENLNWNYEPFTVPEEVRAYTKEFKVRAQRQEDKWNSMFEEYKKEYP KLYKEWEVWFSEKTPMKLLDNGEFWKFDKNMATRQSSGVLINRLAKLIPNLIGGSADLAPSNKTHMDDRGDFSAENRSGS NMHFGVREHAMAAIANGMYLHGGLKVFVATFFVFSDYMKGAMRLSSIMKLPIVYVLTHDSIGVGEDGPTHEPIEQLAALR SMPNMTVFRPADSNETAAAWYSALNTKNGPTALVLTRQALPLYDSSGKNALKGGYILKDSKNKENPDVILMASGSEVELI LNAAKELQNENIDARVVSMPSFEVFEEQSEDYKNSILPRNIRARVAVEAASPFGWHKYVGLDGEVIAMESFGASGKSDIL FKEFGFTVENVVEKVKNVLKNLK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 1e-147 | 49 |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 2e-142 | 48 |
