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Name : lysS (BCTU_284) Accession : YP_004590118.1 Strain : Buchnera aphidicola host: Cinara tujafilina Genome accession: NC_015662 Putative virulence/resistance : Virulence Product : lysyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG1190 EC number : - Position : 332335 - 333888 bp Length : 1554 bp Strand : + Note : LysS DNA sequence : ATGCCTAATACAAAAAAATATGCTTTAATTAATAAAAAAAAAATTCTCACAGAAAATAATATAAGAAAAAAAAAATTAAA AAAATTATGCGATAACGGTTTTAATTTTCCAAATCTTTTTCATTGTAATAACACAGCAAAAAACATACTTTTATTATATA AAAAATATACAAAAAAAGAATTAAAAAAAATCAATGTTCAGATAAAAATCGCAGGACGCATTATAAATAAAAGAGTATTA GGGAAAGCATCTTTTTTTAAGATACAAGATTATGATTATGAAATTCAAATATATATTCAAAGTAATAATTTTAAAAAAGA TTTTTATAAAGATTATATTCTTGAATTAGATTTAGGTGACATCATAAGTGTTGTAGGAACTGTTTTTAAAACTAATACAC AAGAAATATCTATTTTTTGTTATAAAATAGAATTATTAACAAAAATTTTACATCCATTACCTGATAAATATCACGGTTTA CAAGATCAAGAACTAAAATATAGAAAAAGATATTTAGACCTAATCGCTAACAATAAAATTAAAAAAATATTTAAAAGAAG ATCAAAAATATTATCTGTCATTCGTATGTTTATGGAAAAAAAAGATTTTTTAGAAGTCGAAACACCTATGATTCATAGTA TTCCAGGAGGAGCTAACGCAAAACCCTTTATTACATATCATAATACCTTTAATAAAAAAATGTATTTACGAGTAGCACCT GAATTATATTTAAAAAGATTGATTATTGGTGGTTTTAATAAAATATTTGAAATTAATAGAAGTTTTCGAAATGAAGGAAT TTCGTCTCGTCATAATCCGGAATTTACTATGATGGAAATATATATGGCATATAGTAATTATAAAGATATGATGAAACTAT TAATTAAATTATTAAAATTTATTACAAAAAAATTTTTAATACATCAAAAATTTATTATAATAATTATAAAATTAATTTTA AAAAAAATTAAAACGATGACAATGATTGATGCTATTATATATTTTAATAAAAATATTAAAAAATCTGATTTAAAAAGTAT TAATAATATCAAAAAAATAATGAATGATTTAAACTTAAAAATACCATTAAATATTTCTTTAGGAGAAATGATTAATATAA TTTTTGAAAAAACTACAGAAAAAAAAATAATAGAACCTACATTTATTACTAATTATCCAATTGAAGTTTCTCCATTAGCA AAATCAAAATCTACTAAAAATCATATTGCAGAACGATTTGAATTTTTTTTATCAGGATATGAAATAGCTAATGGTTTTTC TGAATTAAACGATTCTAAAGAACAAAAAAAAAGATTTAAAAAACAAATAATAGAAAAAAACAACAAAAAAACTTCTGATA TTAATTATGATTACGATAAAGAATATATTTCAGCATTAGAATATGGATTACCACCAACATCAGGACTAGGTATTGGAATT GATCGGTTAATCATGATTTTTACTAATCAAAAAAGTATTCGTGATGTGATTTTATTTCCAACGCTACGCTCGTTAAAAAA AACAGAAATAATCAAAATATTTAATATTTTATAG Protein sequence : MPNTKKYALINKKKILTENNIRKKKLKKLCDNGFNFPNLFHCNNTAKNILLLYKKYTKKELKKINVQIKIAGRIINKRVL GKASFFKIQDYDYEIQIYIQSNNFKKDFYKDYILELDLGDIISVVGTVFKTNTQEISIFCYKIELLTKILHPLPDKYHGL QDQELKYRKRYLDLIANNKIKKIFKRRSKILSVIRMFMEKKDFLEVETPMIHSIPGGANAKPFITYHNTFNKKMYLRVAP ELYLKRLIIGGFNKIFEINRSFRNEGISSRHNPEFTMMEIYMAYSNYKDMMKLLIKLLKFITKKFLIHQKFIIIIIKLIL KKIKTMTMIDAIIYFNKNIKKSDLKSINNIKKIMNDLNLKIPLNISLGEMINIIFEKTTEKKIIEPTFITNYPIEVSPLA KSKSTKNHIAERFEFFLSGYEIANGFSELNDSKEQKKRFKKQIIEKNNKKTSDINYDYDKEYISALEYGLPPTSGLGIGI DRLIMIFTNQKSIRDVILFPTLRSLKKTEIIKIFNIL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | CAD66193.1 | putative lysil-tRNA synthetase LysU | Not tested | PAI III 536 | Protein | 6e-86 | 46 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| lysS | YP_004590118.1 | lysyl-tRNA synthetase | VFG1668 | Protein | 3e-86 | 46 |
