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Name : serS (BCTU_203) Accession : YP_004590047.1 Strain : Buchnera aphidicola host: Cinara tujafilina Genome accession: NC_015662 Putative virulence/resistance : Unknown Product : seryl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG0172 EC number : - Position : 246785 - 248092 bp Length : 1308 bp Strand : - Note : SerS DNA sequence : ATGTTAGATTTTAATTCTATGAAACATAATTATCAATATTTTTATGAGCAACTAAAAAGAAGAAATTTTTTTTTAGATAT TAAAAAAATTTCTAAATTAGAAAATAAAAGAAAAAAACTACAAAGTGATAGTGAATCTTTACAGTCAGAACACAAAAAAC TATCTCAATATATTTTATATAAAAGTAAAATATATAATAACATTGATATTTTTAAAAATCAATTAATTGCCTCTAGAAAC CGTTTATCAGTTTGGAAAAAAAAATTAAAATCTATTCGAGATCAAATGAATTTTTTTTTAGATCAGATACCTAATATTCC TTCATTAGATAGTCCAGATGGAAAAAATGAAAAAGATAATAGAGAAGTTAGTTTATGGGGAAATATAAAAAAATATAATT TTTCAATTAGTAATCATATCCATATTGGACAAAAAATACATGGTTTTGATTGGAAAATTGCATCATTGATATCAGGTTCT GGTTATACAGTTATAAAAGGTAAATTAGCAAAATTACATCGTGCATTAGGGCAATTTATGTTAGATATTCATATTGAAAA ACATGGATATCAGGAAGTATATGTTCCTAATATAGTACAAGAACATTGCATGTATGGTACAGGACAATTACCGAAATTTG AAAAAGAGTTATTTTATGTAAATACATATCATGATGATAATAAAAAAATAAATCAAAAAAAATACTTTTTAATTCCTACA GCTGAAGTACCATTAATCAATTTAATGCAAAATAAAATAATATTATCTAAATTCTTACCTATTAAATACGTTTCTTTAAG TGCTTGTTTTCGTGCTGAGTCTGCTGCATATGGAAAAAATAAGCAAGGTTTAATTAGAAATCATCAATTTGAAAAAGTGG AAATAATTCAAATTGTACATCCTGATAAATCTGAAGAGAGTTTTGAAAATCTAACAAAAGATGCAGAACATATATTAAAG TTACTTAAACTTCCTTACAGAAAAATATTACTTTGTACTGGTGATCTTGGATTTTCTGCTAAAAAAACATATGATTTAGA AGCGTGGTTTCCTGCACAAAATTGTTATCGTGAAATTTCTTCATGCTCTATGATAGGTGATTTTCAATCAAGAAGAATAA AAGCTCGATATAGAGATGAGAAAAAAAAAAAAATAAATTTTTTACATACTTTAAATGGTTCTGGGTTAGCTGTTGGTCGA ACTTTAGCAGCAATTTTAGAAAATTTTCAATGTTCAGATAATAAAATTATTATTCCAAAAGTTTTACGTAATCCTTATAT GAATGGAATAAAAACTTTAAAATTTTAA Protein sequence : MLDFNSMKHNYQYFYEQLKRRNFFLDIKKISKLENKRKKLQSDSESLQSEHKKLSQYILYKSKIYNNIDIFKNQLIASRN RLSVWKKKLKSIRDQMNFFLDQIPNIPSLDSPDGKNEKDNREVSLWGNIKKYNFSISNHIHIGQKIHGFDWKIASLISGS GYTVIKGKLAKLHRALGQFMLDIHIEKHGYQEVYVPNIVQEHCMYGTGQLPKFEKELFYVNTYHDDNKKINQKKYFLIPT AEVPLINLMQNKIILSKFLPIKYVSLSACFRAESAAYGKNKQGLIRNHQFEKVEIIQIVHPDKSEESFENLTKDAEHILK LLKLPYRKILLCTGDLGFSAKKTYDLEAWFPAQNCYREISSCSMIGDFQSRRIKARYRDEKKKKINFLHTLNGSGLAVGR TLAAILENFQCSDNKIIIPKVLRNPYMNGIKTLKF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| serS | YP_003446791.1 | seryl-tRNA synthetase | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 5e-77 | 42 |
