Gene Information

Name : Lacal_2547 (Lacal_2547)
Accession : YP_004580816.1
Strain : Lacinutrix sp. 5H-3-7-4
Genome accession: NC_015638
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : C4-dicarboxylate anaerobic carrier-like protein
Function : -
COG functional category : S : Function unknown
COG ID : COG1288
EC number : -
Position : 2829279 - 2830772 bp
Length : 1494 bp
Strand : +
Note : PFAM: C4-dicarboxylate anaerobic carrier-like; KEGG: cly:Celly_2929 C4-dicarboxylate anaerobic carrier

DNA sequence :
TTGAAAAATATAAAATTTCCCACAGCACAAACAATTCTTTTAATTATAGCAGGACTTGTAACACTTTTAACATGGTTTAT
ACCTGCTGGTAAATATGATACTTTATTATATAATAGTGCCAGCAATAACTTTACTCAAACAAGTACAACACAAACTTTAA
ATTTACCAGCTACACAGCAAACTTTAGATGCATTAGCTATAAAAATTCCTTTAGAGAAATTTACAAATGGTGATATTTAT
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ATCCTTTTAGTACAATTATAGCAAGTGACGCAGCAGGAATAAGCTGGACAACAGGTGTTTGGGGAAGAGTTTTTATGTTA
GCAGCTTGTTTAACAATTTGTTTGATATATATAATTCGATATGCAAACCGTGTGAAAAAAGACCCTACAAAATCTATTAT
ATACGATCAAAGAGAACAAATTGCGGCATTATTTGGTAATACAAATGCTAAAGTTATACATTTTACAACACGATTACGTT
TGGCTTTATTTGTGTTTGCAATGTGTTTTGCTATTATGATTTATGGCGTTGTTTTCTTAGAATGGTGGTTTGTAGAAATG
ACAGCAACTTTTCTTGTTGGTGCTATAATTATAGGATTTATTGCCAATATAAAAGAATCTGTTTTTGTAGATACTTTTGT
TAAAGGCGCTGGAGATTTACTAGGTGTAGCTTTAATTATTGGTATTGCACGAGGTATTACCGTAATTATGGCAGATGGTC
TAATTAGTGATACCATGTTATATTATGCTAGTGATTTAACTACAGGAATGAATAAAGGTTTATTTGCTACTGCTATGACT
GGTATTTATGCAGGTCTTTCTTTTTTTATACCAAGTTCTTCTGGTATGGCAGTACTTACCATGCCTATAATGTCTCCACT
AGCAGATACCGTAGGTGTTGGACGCGAAATTGTAGTAAATGCTTATCAATATGGATTAGGCTTATTCTACTTAATTAACC
CAACAGGTCTTATTTTAGCTTCACTAGCAATAGTAAAAGTTGGATTTAATAAATGGCTAAAATTTATCATGCCGCTTTTT
GTAATTTTAATTGTATTCACTTTAATAGTCATGACGCTTTCAGTATATTTATAG

Protein sequence :
MKNIKFPTAQTILLIIAGLVTLLTWFIPAGKYDTLLYNSASNNFTQTSTTQTLNLPATQQTLDALAIKIPLEKFTNGDIY
KAINIPNTYKKLEAQPQGVLEFIKSPVKGIIEAADIIFLVLIIGGLIGIINSTGAFDAGISWLANKLKGNEYILIILVTT
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AACLTICLIYIIRYANRVKKDPTKSIIYDQREQIAALFGNTNAKVIHFTTRLRLALFVFAMCFAIMIYGVVFLEWWFVEM
TATFLVGAIIIGFIANIKESVFVDTFVKGAGDLLGVALIIGIARGITVIMADGLISDTMLYYASDLTTGMNKGLFATAMT
GIYAGLSFFIPSSSGMAVLTMPIMSPLADTVGVGREIVVNAYQYGLGLFYLINPTGLILASLAIVKVGFNKWLKFIMPLF
VILIVFTLIVMTLSVYL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SAV1171 NP_371695.1 hypothetical protein Not tested vSa¥ã Protein 2e-81 41
SA1014 NP_374287.1 hypothetical protein Not tested vSa¥ã Protein 2e-81 41
SACOL1183 YP_186046.1 hypothetical protein Not tested vSa¥ã Protein 4e-82 41
SAUSA300_1064 YP_493762.1 TRAP family protein Not tested vSa¥ã Protein 4e-82 41