Gene Information

Name : Metok_0054 (Metok_0054)
Accession : YP_004575830.1
Strain : Methanothermococcus okinawensis IH1
Genome accession: NC_015636
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : UDP-glucuronate 5'-epimerase
Function : -
COG functional category : M : Cell wall/membrane/envelope biogenesis
COG ID : COG0451
EC number : 5.1.3.12
Position : 50027 - 51007 bp
Length : 981 bp
Strand : -
Note : KEGG: mae:Maeo_0415 NAD-dependent epimerase/dehydratase; PFAM: NAD-dependent epimerase/dehydratase

DNA sequence :
ATGAAATATAAAAATATTTTAATAACTGGAAGTGCTGGATTTATCGGATTTCATTTAAGCAAATATCTGTTGGAAAATTA
TAATGATATTCAGATAATAGGAATTGATAATCTAAATAATTATTACAATCCTATTTTAAAGGAAAAAAGAAATGATATAT
TAAAAAATTATGAAAATTACAACTTTATTAAAATGGATTTTTCTAATTGGCATGATTTAGTCAATAATTTAAAAAATAAG
GATATTGATTTAATAATACATCTTGGAGCTCAGGCTGGTGTGAGATATTCTTTGGAAAATCCTTGGGCTTATGAATCATC
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CGGTTTATGGAGGGAATAAAAAGATTCCATTCAGTGAAGACGATAATGTAGATAAACCTGTTTCTTTGTATGCTGCAACA
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ATAATTATGGAAATATGGAGAGAGATTTTACCTATATATCGGATGTCGTAGATGGGATAAATTCAGCTATTAAAAAGGAT
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CAATAAAAGTGCAGAAAAGAATTTTTTGCCTATGCAGGATGGGGATGTTTTAAGAACCTATGCAGATTTAAGTAAAAGCA
GGAAATTGTTAAATTATAGTCCAAAGGTTTCTATTGAGGAAGGGCTAAAAAGGTTTTGCAATTGGTTTTTGGAAAATAAA
GAATGGTTGTTAAAAACATAA

Protein sequence :
MKYKNILITGSAGFIGFHLSKYLLENYNDIQIIGIDNLNNYYNPILKEKRNDILKNYENYNFIKMDFSNWHDLVNNLKNK
DIDLIIHLGAQAGVRYSLENPWAYESSNILGTLNIYELARKLNIEKVVYASSSSVYGGNKKIPFSEDDNVDKPVSLYAAT
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FDYEIFNLGNSRPIKLMYFVELIEQYLNKSAEKNFLPMQDGDVLRTYADLSKSRKLLNYSPKVSIEEGLKRFCNWFLENK
EWLLKT

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cap1I AAA64648.1 type 1 capsule synthesis gene Virulence SCCcap1 Protein 4e-68 48