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Name : SerAS12_1558 (SerAS12_1558) Accession : YP_004500002.1 Strain : Serratia sp. AS12 Genome accession: NC_015566 Putative virulence/resistance : Unknown Product : capsular exopolysaccharide family protein Function : - COG functional category : M : Cell wall/membrane/envelope biogenesis COG ID : COG3206 EC number : 2.7.10.2 Position : 1678061 - 1680214 bp Length : 2154 bp Strand : + Note : TIGRFAM: Exopolysaccharide synthesis protein; KEGG: pwa:Pecwa_3034 tyrosine kinase; PFAM: Lipopolysaccharide biosynthesis DNA sequence : ATGATTGAAAATAAGAGAGCTGGCGCTACTGGCAGTAGCCATGATGACATCGATCTCGGAAGGTTATTTGGTATATTGAT TGATCATCGTTGGTTGATTATAGGGATAACCCTTTTATTCTCTGTTGCAAGCATGATATATGTCATGTTCGCGACTCCTA TTTATCAATCAGACGCATTGATTCAGGTAGAGAATAAGACAGGGAATGCTATCCTTAGCGATCTGTCACAAATGATATCG AGCAGTGATGCAAGCTCGTCTTCTACAGAGATTGAATTAATTCAATCTCGTATGGTTGTGGGTAAGACGGTTGATGACCT CGGACTTGATACTATAATCGCTGTTAAGCGATTTCCTATTTTTGGTAATGGTTGGGCTAAGCTAACGTCAAGTGAAACAC CTAAAATAGCGCTATCACGTTTAAGTGTCAGAGATAGTATCATTGGTTCCGAAATGGAGCTAAAAGTCGTGGATAAAGAA AATTATATTTTATCCTCTGACGGTGTTGAAATTCTTAAAGGAAAAATTGGGCAACTAGCAAGCTCTGACTATGTAACTAT GTTGGCAACTGATATTGATGCCGAACCTGGCACCGTATTCTTGGTTACAAAGCTATACCAAATTAATGCAATTAATAATG TTCTTAAGAACCTTACGGTTGTTGATAAGGGTAAAGACACAGGTGTTTTAAATTTAAGCTACCTGAATGCGAACCCAGTA CTAGCTAAAAAAATATTGCAGAGCATTAGCAATAATTATTTGTTGCAAAATGTTGAAAGAAAATCTGAAGAAGCGGCAAA AAGCTTAGCGTTCCTGAAAGAACAACTGCCGATAGTTCAAGAGTCATTAGATACGGCAGAAAATAAATTAAATCTATTTC GGCAGCAAAACTCGTCTGTTGATTTGTCACTTGAAGCTAAGTCAATGCTCGATACGATTGTATCGACGGAGTCACAGCTT AACGAATTGACTTTCAAAGAAGCTGAAATCTCAAAGCTTTATACTAAAGAGCATCCTGCATATCGTGCATTGTTGGAAAA AAGAAAAACACTTGAAGATGAGCGCGGTAATTTAAACAAAAAAATTAATAGCATGCCAAAAACTCAACAAGAAATCATTC GACTAACGCGTGATGTTGATGCTGGAAAAGAAATTTATATGCAGTTGCTGAATAAGCAACAAGAGTTAAGTATAACGAAA GCGAGTACTGTAGGGAATGTACGAGTTGTTGACCCTGCGATAACTCAAATTAAACCCGTCCAACCTCGGACTCTATTGAT AATTATCATTGCCACAATTTTGGGCATGTTGATTTCTGTAACTATTGTTTTACTCAAGACCATGCTGCATAAAGGCATTG AAAGCCCTGAACAATTGGAGCAAGAAGGTGTCAACGTTTACGCGAGCATTCCGTTCTCTGAATGGCAGCAAAAGAAAGAT AAAGAAACATTTGCTAATTACAAAAAACGACATCAACCTGGGAAGGGTAATCTTCTATCGACTGAAAACCCTGCAGACCT TGCAATCGAGGCGATTAGGAGCCTGAGAACAAGTTTGCATTTTGCCATGATGGAAGCTAAGAATAATGTTCTGATGATTT CAGGTGCTAGTCCAAATATTGGTAAAACTTTTGTTAGCATTAACTTAGCTGCGGTTATTTCTCAAACTGGACAAAAAGTT CTTGTCATCGATGCGGATATGCGAAAGGGGTATTCGCATAGTTTGTTAGGTTTTGAAGGGAACAACGGCCTTTCTGATAT CTTGTCAGGTAAAATAGAAATAGAAAAGGCCATTAAAAAAACCGAAATTTCCGGAATGGATTTTATTTCACGTGGGCAAG TCCCCCCAAATCCTGCTGAACTATTAATGACCTCTCGATTTGAGACATTAATCAGTTGGGCCACGGAAAACTATGATTTA GTCTTGATAGATACGCCGCCGATATTGGCTGTAACAGATGCAGCTATTATAGGGCACCATGTTGGGACGTCATTGATGGT AGCTCGCTTCGCAATGAATACTGTTAAAGAAATTGAAGTAAGTATGCGCCGCTTTGAACAAAATGGGATCGAAATTAAAG GTGTCATCTTGAACGCAGTCGAAAGACGTGCTGCAAACTATTATGATTACTATCAGTACGAATATAAAAGTTAA Protein sequence : MIENKRAGATGSSHDDIDLGRLFGILIDHRWLIIGITLLFSVASMIYVMFATPIYQSDALIQVENKTGNAILSDLSQMIS SSDASSSSTEIELIQSRMVVGKTVDDLGLDTIIAVKRFPIFGNGWAKLTSSETPKIALSRLSVRDSIIGSEMELKVVDKE NYILSSDGVEILKGKIGQLASSDYVTMLATDIDAEPGTVFLVTKLYQINAINNVLKNLTVVDKGKDTGVLNLSYLNANPV LAKKILQSISNNYLLQNVERKSEEAAKSLAFLKEQLPIVQESLDTAENKLNLFRQQNSSVDLSLEAKSMLDTIVSTESQL NELTFKEAEISKLYTKEHPAYRALLEKRKTLEDERGNLNKKINSMPKTQQEIIRLTRDVDAGKEIYMQLLNKQQELSITK ASTVGNVRVVDPAITQIKPVQPRTLLIIIIATILGMLISVTIVLLKTMLHKGIESPEQLEQEGVNVYASIPFSEWQQKKD KETFANYKKRHQPGKGNLLSTENPADLAIEAIRSLRTSLHFAMMEAKNNVLMISGASPNIGKTFVSINLAAVISQTGQKV LVIDADMRKGYSHSLLGFEGNNGLSDILSGKIEIEKAIKKTEISGMDFISRGQVPPNPAELLMTSRFETLISWATENYDL VLIDTPPILAVTDAAIIGHHVGTSLMVARFAMNTVKEIEVSMRRFEQNGIEIKGVILNAVERRAANYYDYYQYEYKS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf41 | AAO18066.1 | Orf41 | Not tested | TTSS locus | Protein | 2e-156 | 49 |
