Name : STP_0789 (STP_0789) Accession : YP_004478909.1 Strain : Streptococcus parauberis KCTC 11537 Genome accession: NC_015558 Putative virulence/resistance : Unknown Product : thymidine phosphorylase Function : - COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism COG ID : COG0213 EC number : - Position : 831297 - 832574 bp Length : 1278 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAGAACAGTTGATTTAATTCAAAAAAAACGTGATGGTAAAGAGTTATCGACTCAAGAAATTGAGTGGTTAATTTCAGG ATATGCTGATGGCAGTGTTCCTGATTATCAAATGGCTGCCTTTGCAATGGCAGTTTACTTTAAAGGAATGTCTACTCGTG AAACTCGTGACTTAACAATGAGTATGGTTAAGACCGGAGATCAGATTGATTTGTCTGCTATTAACGGGATAAAAACTGAT AAACACTCAACAGGTGGTGTAGGGGATAAAGTTACCCTAATTTTAGCTCCATTAGTTGCAAGTTTTGGGGTACCCGTTGC AAAAATGAGTGGACGAGGTCTTGGTCACACTGGAGGTACACTTGATAAGCTTGAAGCTATTAAAGGTTATCAAATTGACC GAAGTCAAGATGAATTTATTAAACAAGTTCAAGAAATTGGTGTTTCTGTCATTGGACAGTCCGATCGGTTAGTAAAAGCA GATAAATTACTTTATGCTTTACGTGATGTAACAGCAACAGTTGACATTATTCCCCTTATCGCAAGTTCAGTAATGAGTAA AAAAATTGCAGCTGGAGCAGACAGCATCCTGCTAGATGTAACAGTTGGTGATGGGGCCTTTATGAAAACCATTGAGGATG CAGAAAAGCTATCGCGCCTTATGGTTGATTTAGGAAAAGAAGTTGGTCGCAAAACTATTGCTGTTATTACTAACATGAGT CAACCCCTAGGACAAGCAATCGGAAATCGTTTAGAAGTTCTGGAAGCAATTGACATCATGCGAGGAAAAGGTCGCGACGA TATCACTCATTTTATCTGTGAATTAGCACAATTGATGTTAGAATTAGCTGGAGTGGAGAAAAGTCTCGAAGAGATTAAAG ACCAATTAGTTAATGGAAAAGCACTAAAAAAATTCGAAGAGATGATTTCTTATCAAGGTGGGGATTTAGAAGATTTATAT CGTCCTTCTAATTCACCTGTTAAAACAGAAATTTTAGCAAAAGAGGAAGGCTATATTTCTGAATTGCCAGCTTTGGAATT TGGATTAATTGCTATGAGATTAGGTGCAGGTCGTGCAGTAAAGACAGACCCATTAGATTATGAAAGTGGAATTGTCTTTG AGAAAAAAGTTGGCGATTACATTACTATTGGACAAGTCATCGCAACGGTTTATTCTTGTGAAGATTTAGATCAAAATGTG CTTACAGATTTCGAAAAAAATGTTAAAATAAGTAAGGAACACTTTGATACAAAAGAGATTATTGAAATTATATCCTAA Protein sequence : MRTVDLIQKKRDGKELSTQEIEWLISGYADGSVPDYQMAAFAMAVYFKGMSTRETRDLTMSMVKTGDQIDLSAINGIKTD KHSTGGVGDKVTLILAPLVASFGVPVAKMSGRGLGHTGGTLDKLEAIKGYQIDRSQDEFIKQVQEIGVSVIGQSDRLVKA DKLLYALRDVTATVDIIPLIASSVMSKKIAAGADSILLDVTVGDGAFMKTIEDAEKLSRLMVDLGKEVGRKTIAVITNMS QPLGQAIGNRLEVLEAIDIMRGKGRDDITHFICELAQLMLELAGVEKSLEEIKDQLVNGKALKKFEEMISYQGGDLEDLY RPSNSPVKTEILAKEEGYISELPALEFGLIAMRLGAGRAVKTDPLDYESGIVFEKKVGDYITIGQVIATVYSCEDLDQNV LTDFEKNVKISKEHFDTKEIIEIIS |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
deoA | YP_005163381.1 | Thymidine phosphorylase | Not tested | Not named | Protein | 2e-88 | 46 |