|
Name : treA (STP_1776) Accession : YP_004479896.1 Strain : Streptococcus parauberis KCTC 11537 Genome accession: NC_015558 Putative virulence/resistance : Unknown Product : trehalose-6-phosphate hydrolase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : - Position : 2041091 - 2042716 bp Length : 1626 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGCTATTGACAAAAGAAAAGTTGTCTATCAAATTTATCCAAAATCATATAAAGATACTGATGGAAGTGGCGTAGGTGA TTTACGTGGCATTATTGAAAAAATTCCTTATTTGCGTGAATTAGGAATTGACATGGTTTGGCTAAATCCCTTTTATCCAA GTCCACAACGAGATAATGGTTACGATGTAGCAGATTACACTGCTGTAAACCCTGATTTTGGAACTATGGAAGATTTTGAA GAACTAATCCGAGTTGGTCAGGAAAATAAGATTGACTTTATGTTAGATATGGTGTTAAACCATTGTTCTACGGAACACGA GTGGTTCCAAAAAGCATTAGCTGGTGATAAATACTATCAAGATTTCTTCATTTTAAGAGATCAACCAACAGATTGGTTAT CAAAATTTGGTGGTAATGCATGGGCACCGTTTGGTGATACTGGCAAATATTATCTTCATTTATTTGATGTGACACAGGCT GACTTGAATTGGAGAAATCCTAATGTTCGCGAAGAACTCTTTAAAGTTGTTAATTTCTGGAAAGATAAAGGCGTAAAAGG TTTCCGTTTTGATGTTATTAACTTGATTGGTAAAGATGAAGTCTTAGAAGATTGTGCTATCAATGATGGTAAACCTGCTT ACACTGACCGACCAATTACTCACGAATACCTAAAGATGATGAATAATGCCAGCTTTGGTAAAGATGATTCCTTTATGACA GTTGGTGAAATGTCTGCAACGACTATTGAAAATTGTATTCTTTATACAGCTCCTGAACGGGAAGAATTATCAATGGCATT TAATTTCCACCATTTAAAAGTTGACTACAAAGATGGTCAAAAATGGACCTTAATGGATTTTGATTTTATTACCTTGCGTG ACCTTTTCCATTCTTGGGGTGAAGGAATGAGTGTTGGTAATGGTTGGAATGCTTTATTCTACAATAACCACGACCAACCA CGTGCATTGAATCGTTTTGTAGATATACAAAACTTCCGTGAGGAAGGTGCGACAATGCTTGCTGCTTCAATTCACTTATC ACGTGGAACACCTTATATTTATATGGGTGAAGAAATTGGTATGGTTGATCCTGATTATGATACCATGACTGACTACGTTG ATATTGAAAGTTTAAATGCCTATCAAATGCTTCTAGATGAAGGTAAGACTGAAGAAGAAGCTTTTACAATTATTAGTGCA AAATCTCGGGACAATTCACGTACACCAATGCAATGGGATGCCAGTAAAAATGCTGGATTTACTACTGGAATTCCATGGCT CAAAGCAGGTAAGACTTACAAAGAAATTAATGTTGAAGCAGAGAAGAATGGAAAGATTTTCCCATTCTATCAAAAATTAA TTCAATTACGTAAAGAAATGCCATTAATCTCTGAGGGAGATTATAAAGCAGCTCTCAAAGATAGTGAGCGCATTTATGCC TTTGAACGTGAGTTGGATGGACAAAAATTATTAGTCCTAAATAATTTCTATTCTGATCAAGCTCAAGTTGAACTGCCAAT TGAGTATCAAAATGGACGAGTGTTAATTAGTAATTATGAGGTCGATTTAGTTGGTACAAATCTAACTTTAGAAGCTTATC AAACAATTGCAATTCTCGCTAAATAA Protein sequence : MAIDKRKVVYQIYPKSYKDTDGSGVGDLRGIIEKIPYLRELGIDMVWLNPFYPSPQRDNGYDVADYTAVNPDFGTMEDFE ELIRVGQENKIDFMLDMVLNHCSTEHEWFQKALAGDKYYQDFFILRDQPTDWLSKFGGNAWAPFGDTGKYYLHLFDVTQA DLNWRNPNVREELFKVVNFWKDKGVKGFRFDVINLIGKDEVLEDCAINDGKPAYTDRPITHEYLKMMNNASFGKDDSFMT VGEMSATTIENCILYTAPEREELSMAFNFHHLKVDYKDGQKWTLMDFDFITLRDLFHSWGEGMSVGNGWNALFYNNHDQP RALNRFVDIQNFREEGATMLAASIHLSRGTPYIYMGEEIGMVDPDYDTMTDYVDIESLNAYQMLLDEGKTEEEAFTIISA KSRDNSRTPMQWDASKNAGFTTGIPWLKAGKTYKEINVEAEKNGKIFPFYQKLIQLRKEMPLISEGDYKAALKDSERIYA FERELDGQKLLVLNNFYSDQAQVELPIEYQNGRVLISNYEVDLVGTNLTLEAYQTIAILAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 1e-106 | 43 |
