Gene Information

Name : ambt_14160 (ambt_14160)
Accession : YP_004468150.1
Strain : Alteromonas sp. SN2
Genome accession: NC_015554
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : superfamily II DNA/RNA helicase
Function : -
COG functional category : S : Function unknown
COG ID : COG4951
EC number : -
Position : 3195525 - 3197882 bp
Length : 2358 bp
Strand : -
Note : COG4951 Uncharacterized protein conserved in bacteria

DNA sequence :
GTGTCCAGTTCGTTATCAGATAGACTCTTAGAAATTGATAATCAGCTTCAGCGACTCGCTGAAGAAAAAGAGTCGTTGTT
AAATGAACGTAATAGTATTCTTGCACAACAAGAAGTCGAGCTAGCCAAACACTTTAACCAACACGTTTCACCTGAAGCTA
AAGTCGATTTATTCATTTCTTATTTTAAAGGTCGAAATGACGTTTATCCGTTTCGTTGGGAATCGCAAAATGGTCGAAGT
GGTTATTCGCCAGCGTGTTGGAATGAATGGAAACCTAAAGTTTGTAATAAACCACGGATTAGTTGCACAGAATGCTCAAA
TAAACAATTCAAGCATTATGATGGTCAAGCGATATTTGATCACCTAAAAGGGAATCAAACGATTGGTATTTACCCACTTC
TAGAGAATAATACAACCCACATTCTTGCTGCTGATTTTGATAAAGACGATTGGATTCACTCCGTTAAAGCTTTTTCTGAA
GCCTGTGATTTTTATAAAGTACCTCACATTATCGAACGCTCTAGAAGCGGCAATGGTGGACATGTATGGATCTTCTTTTC
GCAAGCTATTGAAGCAGCCAAAGCTAGAAAGTTGGGTAATGGGCTATTAACGAAAGCGATGGAAATGTACCCTGCGCTCT
CATTTACTTGCTTTGATCGTTTGTTTCCGAATCAAGATGTTATGCCAGAAGGTGGCTTTGGTAACTTGATAGCATTACCT
CTTCAACTAGAGCCAAGAAAACTTGGCAATAGTGTATTCATAAATTCCTCAGGGATAGCTTATAAAGACCAGTGGGCTAA
GCTCGCTTCAATTCAAAAAATTAATAGTACGACACTTGATAGCTTGCTGGATGAAATAACGTTAATTGATGAAAAAGCTA
ATAATGACTTGGCAGACACACCTTGGAAGAAACTCTCTTCTATTGATAATGATGTGATTGCCAATTGCCCAGAAGAAATA
ACCTTAGTTATTGCAGATCAGATTTATATTCCTATAGATAAACTTCCCGGCAAATTAACATCAAGACTTAAACAGTTAGC
AGTATTTTCTAATTCTGAGTTTTATAAACGGCAAGGCCTTCGCTTATCTACTATTGGCATTCCAAGATATATTTGCGCCG
CTCATGTTGAAGGTACATTTTTAATTTTACCCAGAGGGTGTTTATCATCTGTAGAAGCTCAATTAACTGAACAAAAAATT
GAAATCATTTTCGATGATAAGCGGTTTTCAGGTGACAACCTTGCCAAAGTTAAGTTTACTGGAAAGCTGAAAAGTCAGCA
GAATAAGGCGGTTAATGCGTTATTAGAATCATCGGTTGGCATACTGGAAGCTTCTACTGGCTTTGGTAAAACTGTCACGG
CACTAGCATTGGTTGCTAAACGTAAAGTAAACACATTGATATTAGTTCACAGTCGGCAACTGGCTGAACAGTGGTTAGAA
CGTATTAATGTTTTTCTAAAAGATACTGAAGTTGGTTCATTACTTGGTGGTAAGGAAAAGCTGTCGTATCAGGTTGATGT
AGCCACATATCAAAGTTTAGTTAGTCGAAACGGCATGGATATAAAGCCATACATTGAAAAATATGGGCAAATTATTGTTG
ATGAATGCCACCATTTACCAGCATCAAACTATGAAAGCTTGATCAAGTCCAGTCACGCAAAATTCATTCATGGATTCACT
GCAACACCAAAACGCCAAGATGGCTTAGAAAAGCTGATGATGTTTCAACTTGGAGATATTGTTTATAAAGGCGTTAAATC
AGGTTCAATGCTTAATCAGCAAGTGATAGCACATGAAACAGATACAACGTTTCCTAAGGAGTGGCTAGAGCCTGATACTA
AGCCTCATATTTCACAAATTTATAAGCACCTAGTAAACAGTGATTGCAGAAACCAAAAGATCGTCGACGATATTCTCAGT
TGTATTGATGATAAACGTGCTGTAATGGTGTTAACCGAAAGAAAAGAGCACATCGAGCTTTTGTCAGCTTTACTAACGAA
GAAAGAGCTAATGGTTGTAGAGTTGCATGGTGGAATATCAGCTAAACAGCGGCAAGAGCGTATCGCTATGCTCGAAGAAA
ATGTAGATCTAAGTAACGATAAACAGGTAATTCTTGCAACGGGTAAGTATGTTGGCGAAGGGTTTGATTTACCATACTTG
GATACGTTGTTCATCACCTTACCGATAGCATGGAAGGGTATATTAGCTCAATATGCCGGACGAATAGGACGAGAGTGGAG
TAACAAAAATTCAGTTCAGGTTTATGATTACCTCGATACCTTCCCAACACTGAAGCGAATGTTTTCAAAACGTGAAAAGG
GATACAAAGCATTGGGTTATGAAATCACATACCGTTAA

Protein sequence :
MSSSLSDRLLEIDNQLQRLAEEKESLLNERNSILAQQEVELAKHFNQHVSPEAKVDLFISYFKGRNDVYPFRWESQNGRS
GYSPACWNEWKPKVCNKPRISCTECSNKQFKHYDGQAIFDHLKGNQTIGIYPLLENNTTHILAADFDKDDWIHSVKAFSE
ACDFYKVPHIIERSRSGNGGHVWIFFSQAIEAAKARKLGNGLLTKAMEMYPALSFTCFDRLFPNQDVMPEGGFGNLIALP
LQLEPRKLGNSVFINSSGIAYKDQWAKLASIQKINSTTLDSLLDEITLIDEKANNDLADTPWKKLSSIDNDVIANCPEEI
TLVIADQIYIPIDKLPGKLTSRLKQLAVFSNSEFYKRQGLRLSTIGIPRYICAAHVEGTFLILPRGCLSSVEAQLTEQKI
EIIFDDKRFSGDNLAKVKFTGKLKSQQNKAVNALLESSVGILEASTGFGKTVTALALVAKRKVNTLILVHSRQLAEQWLE
RINVFLKDTEVGSLLGGKEKLSYQVDVATYQSLVSRNGMDIKPYIEKYGQIIVDECHHLPASNYESLIKSSHAKFIHGFT
ATPKRQDGLEKLMMFQLGDIVYKGVKSGSMLNQQVIAHETDTTFPKEWLEPDTKPHISQIYKHLVNSDCRNQKIVDDILS
CIDDKRAVMVLTERKEHIELLSALLTKKELMVVELHGGISAKQRQERIAMLEENVDLSNDKQVILATGKYVGEGFDLPYL
DTLFITLPIAWKGILAQYAGRIGREWSNKNSVQVYDYLDTFPTLKRMFSKREKGYKALGYEITYR

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
Z1129 NP_286664.1 helicase Not tested TAI Protein 1e-139 42
Z1568 NP_287072.1 helicase Not tested TAI Protein 1e-139 42