Gene Information

Name : traG (UMN179_p00003)
Accession : YP_004421434.1
Strain :
Genome accession: NC_015461
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : putative conjugal transfer pilus assembly protein TraG
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 2193 - 3752 bp
Length : 1560 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGGACGGTATTCCTATTTATACTAATAGTTATTTTGAATATTACCTGACCGTGTTGGGTTGGTTCATCAACAATGGCAT
ATGGGATCTTCTTGTCGAAACAGGTTTGTTTTCTACGCCATTCTTTGCGCATTTAATAAGATTTTGGCTAAAAGTGCGTG
AAGAGGGGGACGATGAAGGCAATAAAGGCAAATTATTGCTAAATCGCATTGAACACGCTTTTTATTTGAGTATGGTTGTT
ATTTTATTTACCTGTATGCCACTATTCACGATTAATGTGAACAACATCACTTATGATGAAACTCGCTCTAAACAGTGCAA
AGTCAGCATTATCTCGCCTCAACAAAGCTCAATGAGCTATATGCAGACAACGTTAGACGGGCAACAGGCAAAAATGCCAC
TTTGGTGGGCGTTTACGACTGTTGTAAGTAAAGCCGTAACACAAGCAGCTATTACGACAATCCCTTGCAGTCCTGACATT
AGACAACTGCGATTTGAAGTTAATAACACGCTTATTACTAGTGCAGTTTTGCGACAAGAAGTGCAAGACTTTTTTGAGCA
ATGTTATGTTCCAGCTCGCAAAAAAATTAAACGCAAAAACGTTAAAACCAATGAGGTTCAAGATAGAGATCTTGACTGGA
TTGGTTCACGCTTAATGGTCGAAACACCAAATTTATATGATTCCTATCGAGCTAAAATGCCACGTCCGGAATTCCCTTAT
GATCCGAAGCGTGATCAGGCGTTGCCGAATACCGGCAAAGGCGGATTCCCGAAATGCAATGAATGGTGGGATAAACCAGG
CGTAGGATTAAAAGCGAGATTGTTAGAGCAGTATAGCCCAAGCACTATTGCTAGTTTTAAACAGACTTATGATTTAGATA
AAAACTACTACAATGCCAATCCAAAACGGATTTCAGATTCTGAAATGGCAGATGTTTTAGTCCGGAATTTAGTGAAGCCA
GAAAAAATGGCAGTATCTAATGGGAAAATCTATTCTAACTTAAGTAGTGACATTATTTCTGATTTTTTTTCAGGGCTTCG
ATCAGGGCTATCTAAACTGGTTGCCGGAGCAGGTACAACAACAACGCTTGCAGTGGTAACACCCGGTTTTGACGCAATGC
GGCAAGCGTTGCCAATGATTCAAGGATTGCTATCCGTTGTGTTTGTAATTTCCATTCCGTTTGTAATGGTGTTTAGTGGT
TACAGTATGAAAGCGGCAATGGTGATGACTTTTATTCAGTTTGGACTGTATTTCTTAACATTCTGGTGGGAGCTCGCGAG
ATGGCTTGACAGCTCGTTACTTAGTGGACTTTATGGCAGCGATACACACAGTTATTTTAATCTCTATGGATTAGAAAACA
CGGAAGATGACACGGTAGTTAAACTGGTCATTGGGGCGATGTATATCGTTTTTCCGGGCTTCTTTATGATGGCAATGGGG
AAAGCTGGGGTGGCAGTTGGAGAGGTTGCAGGATATTTAGGTTCAGCAGCGCAAAAAACTAAAAAAGGAGGTGAATCAGC
AGCCGATTCTATTAAGAATAGAATAAAAAACAATATGTGA

Protein sequence :
MDGIPIYTNSYFEYYLTVLGWFINNGIWDLLVETGLFSTPFFAHLIRFWLKVREEGDDEGNKGKLLLNRIEHAFYLSMVV
ILFTCMPLFTINVNNITYDETRSKQCKVSIISPQQSSMSYMQTTLDGQQAKMPLWWAFTTVVSKAVTQAAITTIPCSPDI
RQLRFEVNNTLITSAVLRQEVQDFFEQCYVPARKKIKRKNVKTNEVQDRDLDWIGSRLMVETPNLYDSYRAKMPRPEFPY
DPKRDQALPNTGKGGFPKCNEWWDKPGVGLKARLLEQYSPSTIASFKQTYDLDKNYYNANPKRISDSEMADVLVRNLVKP
EKMAVSNGKIYSNLSSDIISDFFSGLRSGLSKLVAGAGTTTTLAVVTPGFDAMRQALPMIQGLLSVVFVISIPFVMVFSG
YSMKAAMVMTFIQFGLYFLTFWWELARWLDSSLLSGLYGSDTHSYFNLYGLENTEDDTVVKLVIGAMYIVFPGFFMMAMG
KAGVAVGEVAGYLGSAAQKTKKGGESAADSIKNRIKNNM

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
t4276 NP_807874.1 hypothetical protein Not tested SPI-7 Protein 3e-89 42
STY4579 NP_458664.1 putative membrane protein Not tested SPI-7 Protein 3e-89 42
PMI2570 YP_002152289.1 hypothetical protein Not tested Not named Protein 3e-83 41