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Name : UMN179_00606 (UMN179_00606) Accession : YP_004419537.1 Strain : Gallibacterium anatis UMN179 Genome accession: NC_015460 Putative virulence/resistance : Unknown Product : trehalose-6-phosphate hydrolase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : - Position : 645179 - 646843 bp Length : 1665 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGCAGCAGGTGTCTCAACAACAATGGTGGAAAACAGGGGTTATTTACCAAATTTACCCAAAAAGTTTTCAGGATACAAC CGGTTCTGGTACTGGCGATATTAATGGTATTACGCAGCGATTGGATTATTTAAAAAACTTGGGTGTGGATGCTATTTGGA TTACACCAATCTATGTTTCACCACAGGTTGATAATGGTTATGACGTTGCTGATTATTGTGCGATTGATCCGAGTTATGGC TCAATGGCAGACTTTGAAAATTTGGTTGAACAGGCACATCAGCGAAATATCAGAGTGATTATGGATATGGTGTTCAATCA TACTTCAACTGAACATCAATGGTTTAAACAGGCACAAGATATTAATAGTAAATATCACGATTTTTATATTTGGCGAGGCG AGCATAAAGATAAATTGCCGAATAATTGGCGTTCCAAATTCGGCGGTAATGCGTGGCAATGGAGCGAAAAAGTAGGCAAG CATTATTTGCATCTTTTTGCAACAGAACAGGCCGATTTAAATTGGGAAAATCAGAAAGTGCGTGCCGAATTGAAAAAGAT TTGCCACTTTTGGGCAGATAAAGGGGTTGACGGTTTAAGATTGGATGTGATTAATCTGGTCTCTAAAGATCAGCGTTTTC CGAATGATGATCAAGGTGATGGTCGCCGTTTTTATACCGATGGACCTCGTATTCACGAATTTATGCAGGAACTAAGTCGA GATGTTTTTCAACCAAGAGGCTTAATGACGGTTGGCGAAATGTCTTCAACCAGTTTGCAACATTGTCAACAATATGCCAA TTTGCAGGGAATGGAACTTTCAATGACCTTTAATTTCCATCATTTGAAAGTGGATTATCCAAACGGTGAAAAATGGAGCT ATGCTAAACCGGATTTCGTTGAATTAAAAAGGATTTTCCATTATTGGCAGTGCGGAATGAATGGCAAAGCGTGGAATGCT CTGTTTTGGTGTAATCACGATCAACCGCGGATTGTTTCCCGTTTCGGTGATGAAGGCGCATTGCGGACGGTTTCTGCAAA ATTATGGGCGATGATTTTACACGGTCTTCAGGGTACACCTTATATTTATCAGGGTGAGGAAATCGGGATGACCAATCCGA ATTTCACTTCACTCAATCAGTATCGTGATGTAGAAAGCCTAAATATGTATCAGGAATTACAGAACAAAGGTGTGCCTGAA GCGTTGTTACTGAAAATTTTAGCGCAAAAATCACGCGACAACAGCCGCACTCCAATGCAATGGAATCAAGATAAAAACGC CGGGTTCAGCGAGGGAGAAAGTTGGATTGAAGTTGCTGGAAATTATCAACAGCTGAATGCTCAACAGGCATTGGCAGATA AAAATTCCGTATTTTATTGCTATCAGCGCTTAATTGCATTGCGAAAACAGTATCCGATTTTTACCGAAGGCAATTATCGA GATTTATTACCGGAATCCGATGCTTTGTGGTGCTATCAACGTGAAAGTGAGAACAGCTGTTTATTTGTGTTAGCGAATTT AACCGACAAAGAGTTGGTGTTTAATTTTGATAGAGAAATTGATATCACACAGTATCAAATCTTGCTGAATAATTATGACG AAATTTGCTACCAGCCGGAAACAGTCAAGTTAAAACCTTATCAGGCTATCTATTTATTAAGATAG Protein sequence : MQQVSQQQWWKTGVIYQIYPKSFQDTTGSGTGDINGITQRLDYLKNLGVDAIWITPIYVSPQVDNGYDVADYCAIDPSYG SMADFENLVEQAHQRNIRVIMDMVFNHTSTEHQWFKQAQDINSKYHDFYIWRGEHKDKLPNNWRSKFGGNAWQWSEKVGK HYLHLFATEQADLNWENQKVRAELKKICHFWADKGVDGLRLDVINLVSKDQRFPNDDQGDGRRFYTDGPRIHEFMQELSR DVFQPRGLMTVGEMSSTSLQHCQQYANLQGMELSMTFNFHHLKVDYPNGEKWSYAKPDFVELKRIFHYWQCGMNGKAWNA LFWCNHDQPRIVSRFGDEGALRTVSAKLWAMILHGLQGTPYIYQGEEIGMTNPNFTSLNQYRDVESLNMYQELQNKGVPE ALLLKILAQKSRDNSRTPMQWNQDKNAGFSEGESWIEVAGNYQQLNAQQALADKNSVFYCYQRLIALRKQYPIFTEGNYR DLLPESDALWCYQRESENSCLFVLANLTDKELVFNFDREIDITQYQILLNNYDEICYQPETVKLKPYQAIYLLR |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 1e-117 | 43 |
