Gene Information

Name : UMN179_00332 (UMN179_00332)
Accession : YP_004419266.1
Strain : Gallibacterium anatis UMN179
Genome accession: NC_015460
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : TraG-like protein, N-terminal region protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 339737 - 341317 bp
Length : 1581 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGGACGGTATTCCTATTTATACTAATAGTTATTTTGAATATTACCTGACTGTGTTGGGTTGGTTTATCAACAATGGCAT
ATGGGATCTTCTTGTTGAAACAGGTTTGTTTGCTACACCCTTCTTTGCACATTTAATAAGACTGTGGTTAAAAGTGCGTG
AAGAGGGGGACGATGAGGGCAATAAAGGCAAATTATTGCTAAATCGTATTGAGCACGCTTTTTATCTGAGTATTGTTGTT
ATTTTATTTACCTGTATGCCGTTATTCACGATTAATGTGAATAACATCACTTATGATGAAACTCGTTCTAAACAGTGCAA
AGTCAGCATTATCTCGCCTCAACAAAGCTCAATGAGCTATATGCAGACAACGTTAGACGGGCAACAGGCAAAAATGCCCC
TTTGGTGGGCGTTTACGACTGTTGTAAGTAAAGCCGTAACACAAGCAGCTATTACGACAATCCCTTGTAGCCCTGACATT
AGACAACTGCGGTTTGAGGTTAATAATACGCTTATTACTAGTGCAGTTTTGCGACAAGAAGTGCAAGACTTTTTTGAGCA
ATGTTATGTTCCAGTTCGCAAAAAAATTAAACGCAAAAACGTTAAAACCAATGAGGTTCAAGATAGAGATCTTGACTGGA
TTGGTTCACGCTTAATGGTCGAAACACCAAATTTATATGATTCCTATCGAGCTAAAATGCCACGTCCGGAATTCCCTTAT
GATCCGAAGCGTGATCAGGCGTTGCCGAATACCGGCAAAGGCGGATTCCCGAAATGCAATGAATGGTGGGATAAACCAGG
CGTAGGATTAAAAGCGAGATTGTTAGAGCAGTATAGCCCAAGCACTATTGCTAGTTTTAAACAGACTTATGATTTAGATA
AAAACTACTACAATGCCAATCCAAAACGGATTTCAGATTCTGAAATGGCAGATGTTTTAGTCCGGAATTTAGTGAAGCCA
GAAAAAATGGCAGTATCTAATGGGAAAATCTATTCTAACTTAAGTAGTGACATTATTTCTGATGATGCGAGCGGCTTTTT
TTCAGGGCTTCGATCAGGGCTATCTAAACTGGTTGCCGGAGCAGGTACAACAACAACGCTTGCAGTGGCAACACCCGGTT
TTGACGCAATGCGGCAAGCGTTGCCAATGATTCAAGGATTGCTATCCGTTGTGTTTGTAATTTCCATTCCGTTTGTAATG
GTGTTCAGTGGTTACAGTATGAAAGCGGCGATGGTGATGACTTTTATTCAATTCGGTCTGTATTTCTTAACATTCTGGTG
GGAGCTCGCGAGATGGCTTGACAGCTCGTTACTTAGTGGACTTTATGGCAGCGATACACACAGTTATTTTAATCTCTATG
GATTAGAAAACACGGAAGATGACACGGTAGTTAAACTGGTCATTGGCGCGATGTATATCGTTTTTCCGGGCTTCTTTATG
ATGGCAATGGGGAAGGCTGGGGTGGCTATGGGGGATATATATAATATGCTTATTACTAGCAAAGCAAAAACAGAATCGGG
AGGGGAAAAAGCAGGACAAATGGGAATTAGTTTAGCTACAAAAAGTTCTCCAGTTAAATGA

Protein sequence :
MDGIPIYTNSYFEYYLTVLGWFINNGIWDLLVETGLFATPFFAHLIRLWLKVREEGDDEGNKGKLLLNRIEHAFYLSIVV
ILFTCMPLFTINVNNITYDETRSKQCKVSIISPQQSSMSYMQTTLDGQQAKMPLWWAFTTVVSKAVTQAAITTIPCSPDI
RQLRFEVNNTLITSAVLRQEVQDFFEQCYVPVRKKIKRKNVKTNEVQDRDLDWIGSRLMVETPNLYDSYRAKMPRPEFPY
DPKRDQALPNTGKGGFPKCNEWWDKPGVGLKARLLEQYSPSTIASFKQTYDLDKNYYNANPKRISDSEMADVLVRNLVKP
EKMAVSNGKIYSNLSSDIISDDASGFFSGLRSGLSKLVAGAGTTTTLAVATPGFDAMRQALPMIQGLLSVVFVISIPFVM
VFSGYSMKAAMVMTFIQFGLYFLTFWWELARWLDSSLLSGLYGSDTHSYFNLYGLENTEDDTVVKLVIGAMYIVFPGFFM
MAMGKAGVAMGDIYNMLITSKAKTESGGEKAGQMGISLATKSSPVK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
STY4579 NP_458664.1 putative membrane protein Not tested SPI-7 Protein 5e-86 42
t4276 NP_807874.1 hypothetical protein Not tested SPI-7 Protein 5e-86 42
Pmu_03040 YP_005176203.1 TraG-like domain-containing protein Not tested ICEPmu1 Protein 8e-89 41