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Name : polA (SSUST3_0604) Accession : YP_004401251.1 Strain : Streptococcus suis ST3 Genome accession: NC_015433 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : - Position : 602993 - 605629 bp Length : 2637 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAAAAAAAATAAATTATTATTAATTGATGGCTCTTCGGTAGCCTTCCGTGCTTTCTTTGCACTTTATAATCAAATTGA TCGTTTTAAGAGTCCGACAGGTCTTCACACCAATGCTATCTACGGCTTTAACCTCATGCTGGACCACATGATGAAGCGGA TTGAACCGACCCACATTCTCGTGGCTTTTGATGCTGGAAAGACCACCTTCCGTACGGAGATGTACGCCGATTATAAGGCA GGTCGTGCCAAGACACCAGACGAGTTCCGTGAACAATTCCCCTTCATCCGTCAGATGCTGGATGCTATGGGGGTCAAGCA TTATGAGCTGGCTCAGTACGAGGCAGACGATATTATCGGTACCTTGGACAAAATGGCAGAGCGGACAGAGATTCCTTTCG ATGTGACCATTGTTAGCGGTGATAAGGACTTGATCCAGCTGACAGACGAAAACACCGTAGTTGAGATTTCTAAGAAAGGC GTAGCCGAATTCGAAGAATTTACTCCAGCCTACCTCATGGAAAAAATGGGGATTACCCCTACTCAGTTTATTGACCTCAA GGCTTTGATGGGAGATAAGTCCGATAACATTCCTGGCGTGACCAAAATCGGTGAAAAAACAGGTCTAAAACTCCTGACAG AATTTGGTTCTTTGGATGGTATCTACGAAAACATTGACAGCATGAAGGCTTCTAAGATGAAAGAAAACCTGATTGCTGAT AAGGAGAAGGCCTTCCTATCTCGTACACTTGCTACCATTGATACTCAGGCACCAATCGAAATTGGTCTGGATGACATTGT TTATCAAGGCCCCAAGGTGGATGAACTAGGACAATTTTATGATGACATGGGCTTCAAACAATTAAGGGCTCAGTTAGGTA CGACCAGCTCGCAAGAGGAAGCGGTACTCGATTTCCAAATCGTAACGGAAATCAGCCCCGCTATGCTCAAACAAGACCAG TTTTTCTATTTTGAAATCTTGGGTGAAAATTATCACCGAGAGGATTTGGTTGGTTTAGCTTGGGGGGATAAGGAGAAAAT CTATGTCGGAGGGCCTGAGCTACTTGATAGTCCAGTCTTGCGTGACTTTTTAGAAAACCAAACTATAAAAACCTATGACT TTAAGCGTGGAAAAGTTCTTCTCGACCGAAAAGAGATTACGCTACCTCCAGCCACTTTCGATAGCCGTCTAGCCAAATAC TTGCTTTCCACCGTTGAGGACAATTCCCTAACAACCATTGCCAACCTCTATGGTCAGACCAGTCTTGTTCCAGATGAGGC AATTTATGGCAAGGGTGCTAAGTTAGACTTGCCAGAACGCGAGATCTTTTTCCCACACTTGGCACGTAAGGTTCAGGTTT TGATTGAGACAGAAGAGCCGATGTTGACCAAATTAGAAGAAAATCAGCAATTAGATCTTTTGTTTGACATGGAGTTGCCA CTGGCAAATGTTTTAGCTAAGATGGAAATTGCTGGTATTAAGGTGGAAGCTGAGACTCTCAAAGCTATGCAATCTGAAAA CGAAGTTTTGATTGACCAGTTGACCAAGGAAATCTATGAACTAGCTGGTCAGGAATTTAATATCAATTCGCCTAAGCAGC TTGGGACCATTCTCTTTGAAGAGATGGGACTACCGTTGGAATATACCAAGAAAACCAAGACAGGCTATTCAACAGCAGTA GATGTCTTAGAACGATTAGCGCCAATTGCACCAGTTGTTTCAAAAATCTTGGAATACCGTCAGATTACCAAACTTCAATC AACTTATGTAGTCGGCTTGCAGGATGCCATTTTAGAAGATGGTAAGATCCATACCCGCTATGTGCAGGATTTGACACAAA CAGGTCGTCTATCTTCGACGGACCCTAACTTGCAAAATATTCCTGTTCGTCTAGAACAAGGGCGCTTGATTCGTAAGGCA TTTGTGCCATCGCTTGAAAATAGTGTCCTTTTGGCATCGGACTATTCACAGATTGAATTGCGCGTCTTGGCTCATATTTC TCAGGACAAGCATTTGATTGAGGCCTTCCAGCAAGGTGCAGATATTCACACTTCGACAGCTATGCGGGTCTTCGGTATCG AAAAAGCTGAGGATGTGACACCAAATGACCGTCGGAATGCCAAGGCTGTAAACTTCGGTGTCGTCTATGGTATTTCAGAT TTCGGTCTATCCAATAACTTGGGGATTACACGTAAGGAAGCTAAAGCCTATATCGATACCTATTTTGAACGCTTCCCAGG AATTAAGAATTACATGGAAACCATTGTTCGTGAGGCACGTGATAAGGGTTATGTAGAGACGATTTACAAACGCCGTCGTG AATTACCAGATATAAACTCTCGCAATTTCAATGTCCGTAATTTTGCGGAGCGAACAGCTATCAACTCACCAATTCAAGGT TCGGCCGCAGATATTCTCAAAGTAGCCATGATTAATCTTGACAAGGCTTTGACTGAAGCAGGTCTTGCGACACGTATGTT ATTGCAAGTACACGATGAGATTGTTTTGGAAGTCCCAGTGGCAGAGCTAGAAACGGTAAAAGCCATGGTAAAAGAGACCA TGGAATCGGCGATTAGCCTGTCTGTGCCATTGATTGCGGATGAAAATGAAGGTTCAACATGGTATGAAGCAAAGTAA Protein sequence : MKKNKLLLIDGSSVAFRAFFALYNQIDRFKSPTGLHTNAIYGFNLMLDHMMKRIEPTHILVAFDAGKTTFRTEMYADYKA GRAKTPDEFREQFPFIRQMLDAMGVKHYELAQYEADDIIGTLDKMAERTEIPFDVTIVSGDKDLIQLTDENTVVEISKKG VAEFEEFTPAYLMEKMGITPTQFIDLKALMGDKSDNIPGVTKIGEKTGLKLLTEFGSLDGIYENIDSMKASKMKENLIAD KEKAFLSRTLATIDTQAPIEIGLDDIVYQGPKVDELGQFYDDMGFKQLRAQLGTTSSQEEAVLDFQIVTEISPAMLKQDQ FFYFEILGENYHREDLVGLAWGDKEKIYVGGPELLDSPVLRDFLENQTIKTYDFKRGKVLLDRKEITLPPATFDSRLAKY LLSTVEDNSLTTIANLYGQTSLVPDEAIYGKGAKLDLPEREIFFPHLARKVQVLIETEEPMLTKLEENQQLDLLFDMELP LANVLAKMEIAGIKVEAETLKAMQSENEVLIDQLTKEIYELAGQEFNINSPKQLGTILFEEMGLPLEYTKKTKTGYSTAV DVLERLAPIAPVVSKILEYRQITKLQSTYVVGLQDAILEDGKIHTRYVQDLTQTGRLSSTDPNLQNIPVRLEQGRLIRKA FVPSLENSVLLASDYSQIELRVLAHISQDKHLIEAFQQGADIHTSTAMRVFGIEKAEDVTPNDRRNAKAVNFGVVYGISD FGLSNNLGITRKEAKAYIDTYFERFPGIKNYMETIVREARDKGYVETIYKRRRELPDINSRNFNVRNFAERTAINSPIQG SAADILKVAMINLDKALTEAGLATRMLLQVHDEIVLEVPVAELETVKAMVKETMESAISLSVPLIADENEGSTWYEAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 74 |
