Gene Information

Name : nrdE (MLC_7810)
Accession : YP_004400489.1
Strain : Mycoplasma mycoides 95010
Genome accession: NC_015431
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : ribonucleoside diphosphate reductase subunit alpha
Function : -
COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism
COG ID : COG0209
EC number : -
Position : 972475 - 974646 bp
Length : 2172 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGGCAATAATGAAAGAAAATAAAAACACAATCGTTTTAGATGATGTTGATGATGAATATATTAAATTAAATGCTAGATC
TAAGATTTTTTCAAAAGATCAAGATAATTTTCAATTAGATGTTAAAGCAGCTGAATTATATTTAAAAAATTATATTGAAC
CTAGAATGAAAAAGTTTTCTAGTTTAAAAGAAAGATTAGATTATTTATTAGAAAATCAATATTATGATTCAGAAATAGTA
AATAAATATAGTTTTGATCAAATTAGTCAATTAAATGATTATGCTTATTCATTTAACCATCATTTTCCAAGCTTTATGGG
AGCTTTAAAATTCTTTAATGCTTATGGATTAAAAACTTTTGATACTACAATGTATTTAGAAACTTATACAGATAGAGTAT
TGATGAATGCTCTATTCTTAGGTAATGGTAATTTTACTAAAGCAAAAAACTTATTAAAAGATATGATGTTAGGTAGATTT
CAACCAGCAACTCCTACTTTTTTAAATGCAGCTAAAAAACATAGAGGAGAGTATGTTTCATGTTATTTATTAAGAACAGA
AGATAACATGGAATCAATTTGTAGAACAATTTCAACTTCACTACAACTTTCAAAAAGAGGTGGAGGAGTTGCAATTTGTT
TAACAAATTTAAGAGAAACAGGTTCTCCTATTAAAAATATTTCAGGTCTAAGTTCAGGACCAATTCCAGTAATGAAGATT
TTAGAAGATTCATTTACTTATGCTGATCAATTAGGTCAACGTCAAGGAGCTGGAGCTGTTTATATTTCAGCTCACCATCC
AGATATTATTTCAGTTTTAGATACTAAAAGAGAAAATGCTGATGAAAAGATTAGAATTAAATCTTTATCATTAGGATTAG
TAATTCCAGATATTACTTTTGAATTAGCTAGAGATAATAAAGATATGGCTCTATTTAGTCCTTATGATGTTCAAAAAGTA
TATAACAAGCCATTATCAGATATTTCAATTACTGAAAAATATTATGAAATTTTAGAAAATCCTAATATTAAAAAAACATA
TATTAGTGCTAGAAAATTCTTTTTAACTGTTGCTGAATTACATTTTGAAAGTGGATATCCATATATTTTATTTGAAGATA
CTGTTAATAGAAGAAATGCTCATGATAAAAAAGGAAGAATTATTATGAGTAATTTATGTAGTGAAATTGTTCAAGTAAGT
ACAGCAAGCGAATATAGTTCTGATTTATCATTTATAAAAACTGGAGAAGATATTTGTTGCAATTTAGGTAGTTTAAATAT
TGATAAGATGATGAAATCTGGAAAAGAATTTTCAGATTCTATTTATAATGCTATATCTGCTTTAGATATTGTGTCAAGAA
ACTCAGATTTAAGTGCTGCTCCTTCAATTCAAAAAGGAAATGCACAAAATCATGCTGTTGGATTAGGAGCTATGAATTTA
CATGGATTTTTAGCAACTAATAAAATTATGTATGATTCACCTGAAGCTGTTGATTTTACTAATATGTTCTTTTATACAGT
TGCTTATAATGCTTTTAAAGCTTCAAATAAATTAGCTCAAGAATTTGAAAAATTTGCTTCATTTGATGAATCAAGATTTG
CTGATGGTTCTTGATTTGATAAATATACTAAATGTGAATTTGATAAATGAACACCACAAACAAATAGAGTAAAAGAATTA
TTTAAAGATTATGATGTTCAAATTCCAAGTCAAACTGATTGAATAAAATTAGTTGAAGAAATTAAAAAAACAGGTTTAGC
AAATTCACATTTAATGGCAGTTGCTCCAACTGGATCAATTAGTTATTTATCATCATGTACTCCTTCACTACAACCAGTAG
TTTCAACTGTTGAAGTTAGAAAAGAAGGAAAATTAGGAAGAGTTTATGTTCCAGCATATCAAATTAATTTTGATAATATG
GGATATTATGCAATGGGTGCTTATGAATTAGGACCAGATCCAATTATTAATATTGTAGCAGCAGCTCAACAACATGTTGA
TCAAGCAATTTCACTAACTTTATTTATGACTGATAAAGCAACAACTAGAGATTTAAACAAAGCATATGTTAATGCTTTTA
AACAAGGTTGTTCTTCAATTTATTATGTAAGAATCCGTCAAGATGTTTTAGAAAATAGTGAAAACTATGAATGTGATGCA
TGTAAAATTTAA

Protein sequence :
MAIMKENKNTIVLDDVDDEYIKLNARSKIFSKDQDNFQLDVKAAELYLKNYIEPRMKKFSSLKERLDYLLENQYYDSEIV
NKYSFDQISQLNDYAYSFNHHFPSFMGALKFFNAYGLKTFDTTMYLETYTDRVLMNALFLGNGNFTKAKNLLKDMMLGRF
QPATPTFLNAAKKHRGEYVSCYLLRTEDNMESICRTISTSLQLSKRGGGVAICLTNLRETGSPIKNISGLSSGPIPVMKI
LEDSFTYADQLGQRQGAGAVYISAHHPDIISVLDTKRENADEKIRIKSLSLGLVIPDITFELARDNKDMALFSPYDVQKV
YNKPLSDISITEKYYEILENPNIKKTYISARKFFLTVAELHFESGYPYILFEDTVNRRNAHDKKGRIIMSNLCSEIVQVS
TASEYSSDLSFIKTGEDICCNLGSLNIDKMMKSGKEFSDSIYNAISALDIVSRNSDLSAAPSIQKGNAQNHAVGLGAMNL
HGFLATNKIMYDSPEAVDFTNMFFYTVAYNAFKASNKLAQEFEKFASFDESRFADGSWFDKYTKCEFDKWTPQTNRVKEL
FKDYDVQIPSQTDWIKLVEEIKKTGLANSHLMAVAPTGSISYLSSCTPSLQPVVSTVEVRKEGKLGRVYVPAYQINFDNM
GYYAMGAYELGPDPIINIVAAAQQHVDQAISLTLFMTDKATTRDLNKAYVNAFKQGCSSIYYVRIRQDVLENSENYECDA
CKI

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cur_1481 YP_001800875.1 ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha Not tested Not named Protein 3e-177 54