|
Name : serS (MLC_0570) Accession : YP_004399764.1 Strain : Mycoplasma mycoides 95010 Genome accession: NC_015431 Putative virulence/resistance : Unknown Product : serine tRNA ligase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG0172 EC number : - Position : 73658 - 74926 bp Length : 1269 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGCTAGACATTAATTATATTGAACAGAATTTAGATGAAGTAATTCAAAGATTAAACAAGCGTAATCAGCAAGATTATAG TGAAGATTTAAAATATGCAGTAGAAAAAAATCTTAAAAGAAAAGAAATATTAGTTAAATCTGAAGCATTAAAATCTAGAA AAAATCAATTATCAAAAGAAATTGGAATATTGATTAAAGATAATAAAAACAAAGAAGCTGAAAAAGCAAAAGCTGAAGTT GTTAGTTTAAATGAACAAATTATCAAATTAGATGATGAATTAAGAATTGTTAATGAACAAATCTTAGAAAAACTATCATA TATTCCTAACTTACCTCATAAAGATATTTATTTTGGTAAAAGTGATGAGGATAATGTTGAAATTAGAAAAACAAAACACA GCCCTTTATTAACTCACTCAACTCCGCATTGAGAAATAGCTACAAAACTAGGTTTAGTTGACTTTGAAAAAGGTGTTAAA TTAAGTGGTTCAAGATTTTTAATTTACACTGGATTAGGTTCAAAATTAGTTAGAGTAATTGCTGATATTTTATTAAAAAG ACATGAAAAACATAACTATAAAGAAATTTTTTGTCCTTTAATTGTAAATAAAAGTGCTATGTTAGGAACAGGTCAATTAC CAAAATTTAGTGAAGATATGTATCAAGTTGGAGAACAATATTTAATTCCAACAAGCGAAGTTCCTTTAACTAATTTGCAT GCTAATGAAATTTTAACTTATGATATGTTACCTTTAAAATATACTTCTTTTACTCAATGTTTTAGACAAGAAGCGGGAAG TGCTGGAAGAGATACTAAAGGAATGATTAGATTACACCAATTTAATAAAGTTGAATTAGTAAAAATTGTTCATCCAGATC AGTCAATGAACGAATTAGAGTTATTAGTAAAAGATGCTGAAGATGTTTTAAATATGTTTGATTTACCTTATAGAGTAGTT GAATTATGTAGTGGAGATATTGGATTTAGTTCAGCTAAAACTTATGATTTAGAAGTATGATTTCCAGAACAAAACAAATA TAGAGAAATCTCTTCTTGTTCAAATTGTACTGATTTTCAAGCTAGAAACATTCAAACAAGATTTAAAGATAAAGATTCAA AAATTAAATTAGTTCATACATTAAATGGTAGTGGAGTAGCAGTTGATAGATTAATTGCAGCTATTTTAGAAAATTATTGA GATGGTGAAAAGTTAGTTTTACCAACTATTCTAAGACCTTATTTTGACAATAAAGAGTTTTTAAAATAA Protein sequence : MLDINYIEQNLDEVIQRLNKRNQQDYSEDLKYAVEKNLKRKEILVKSEALKSRKNQLSKEIGILIKDNKNKEAEKAKAEV VSLNEQIIKLDDELRIVNEQILEKLSYIPNLPHKDIYFGKSDEDNVEIRKTKHSPLLTHSTPHWEIATKLGLVDFEKGVK LSGSRFLIYTGLGSKLVRVIADILLKRHEKHNYKEIFCPLIVNKSAMLGTGQLPKFSEDMYQVGEQYLIPTSEVPLTNLH ANEILTYDMLPLKYTSFTQCFRQEAGSAGRDTKGMIRLHQFNKVELVKIVHPDQSMNELELLVKDAEDVLNMFDLPYRVV ELCSGDIGFSSAKTYDLEVWFPEQNKYREISSCSNCTDFQARNIQTRFKDKDSKIKLVHTLNGSGVAVDRLIAAILENYW DGEKLVLPTILRPYFDNKEFLK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| serS | YP_003446791.1 | seryl-tRNA synthetase | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 7e-89 | 46 |
