|
Name : tkt (MLC_3500) Accession : YP_004400057.1 Strain : Mycoplasma mycoides 95010 Genome accession: NC_015431 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0021 EC number : - Position : 460629 - 462599 bp Length : 1971 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAAAACTAGTAAAAATGATAATTTAAATGCATTACGTATATTAGGTGTAAGTGCAATTAATAAAGCAAAATCTGGTCA TCCTGGAATTGTTTTAGGAGCAGCTGGAATAGTTTATGTTTTATTTAATAAAATTATGAATTTTAATCCTAAAAATCCAG AATGATTTAATAGAGATAGATTTATTTTATCTGCTGGGCATGGTAGTGCGTTATTATATTCAGCTTTACACTTATCTGGA TATGATTTATCTATTGATGATTTAAAACAATTTAGACAATGAGATAGTAAAACTCCAGGACATCCTGAAAAAACTTTAAC ATGTGGAGTTGAAGTGACAACAGGTCCACTTGGTCAAGGTGTTGGAATGGGAGTTGGAATGGCTGTTGCTGAAGCTCATC TAGCAAGTGTTTATAATAAACACGATTTTAATTTGATTCATCATTATACTTATGTTTTATGTGGTGATGGTGATTTACAA GAAGGAATTAGTCAAGAAGCTATTTCTTTTGCTGGTAAACATAAGTTAAATAAATTAATTTTAATTCATGATTCAAATGA TGTGCAATTAGATTCAAATGTAGTTGATGTACAAATTGAAGATATGCACAAACGTTTTAAAGCATGTAATTGAAATACAA TAAAAGTTAGTGATGGAGAAGATTTAAACTCAATTTATAAAGCTATTAGAAAAGCTCAACTTTCAGATAAACCAACATAT ATTGAAGTTAAAACTGTTATTGGATTAGGTTCAACAAAACAAGGAACTAAAGATGTTCACGGTGCTCCTTTAAATGATGA TATAACTAAAGTAAAAAAATATTTTGATTGAGATTATGATGATTTTATTATTCCAGATTCAGTTTATAAACACTGATCAA TTAATGCTAAAAAAGGTGAAATTGAAGAAGAATATTGAAATCAATTAAAAGCTAAATATAGTTTAAAATATCCTGAATTA AGTACTTATTTAGATAATGCTATTAATAAAAATATCACTTTTGATTTTTCTAGTTTATTAAAAGATATACCAAGTAATGA TGAAGCAACAAGATTAAGTTCAGGAAAAATCTTTGAACAAATTGCAAATCATGAAAAAATGCTAATTGGGGGAAGTGCTG ATTTATCTAGTTCAACTAGAATTAAAGGCGCTGATAATCAATTTACTAGTTTAAATAAAACTGGTAGAAATATAATGTAT GGAGTAAGAGAATTTGGAATGGGTGCAATTAATAATGGAATTGCAGCTCATAAAGGATTAATTCCAATAGCTAGTGGGTT TTTTGTATTTGCAGATTATTTAAAACCAGCAATGAGATTAGCTTCAATTATGCAATTACAACAATTATATGTCTTTACTC ATGATTCTATTGCAGTTGGTGAAGATGGACCAACTCATCAACCAATTGAACAACTAGCAATGTTAAGAACTATTCCAAAT CATGTTGTTTTAAGACCAGCTGATTATAGTGAAACTATTGCTTGTTATAAAGTTGCTTTAACAAAACTAACTAAAACTCC TACTTCAATTATTTTAACTAGACAAAATGTAAGACAACTACAACACAATGATGTTTTAAATCAAGTTGAACGTGGAGCTT ATATAATTAGTGATCAAACTGATGCAACTGTTAGTTTAATTGCTAGTGGTAGTGAAGTTGGATTAGCAATTGATGTGCAA AAAGAATTATTAAATCACAATATTAAAGCAAAAGTGATTTCAATGGTTTCAACTAGTTTATTTGATAAACAAGATAAACA ATATCAAGATCTAATTATTAATAAAAATACTAAAAGAATTGCTATTGAAATGGGATCAAGTGCAATTTGATATAAATATG TTGGTGATGATGGTTTAGTGTTTGGAATTGATCGTTTTGGTGAATCAGCTCCTGCTAATAGTGTCATTAAAGAATTTGGA TTTACAAAAGAAAATCTAACAAATAAAATATTAGAATATTTAAATAAATAG Protein sequence : MKTSKNDNLNALRILGVSAINKAKSGHPGIVLGAAGIVYVLFNKIMNFNPKNPEWFNRDRFILSAGHGSALLYSALHLSG YDLSIDDLKQFRQWDSKTPGHPEKTLTCGVEVTTGPLGQGVGMGVGMAVAEAHLASVYNKHDFNLIHHYTYVLCGDGDLQ EGISQEAISFAGKHKLNKLILIHDSNDVQLDSNVVDVQIEDMHKRFKACNWNTIKVSDGEDLNSIYKAIRKAQLSDKPTY IEVKTVIGLGSTKQGTKDVHGAPLNDDITKVKKYFDWDYDDFIIPDSVYKHWSINAKKGEIEEEYWNQLKAKYSLKYPEL STYLDNAINKNITFDFSSLLKDIPSNDEATRLSSGKIFEQIANHEKMLIGGSADLSSSTRIKGADNQFTSLNKTGRNIMY GVREFGMGAINNGIAAHKGLIPIASGFFVFADYLKPAMRLASIMQLQQLYVFTHDSIAVGEDGPTHQPIEQLAMLRTIPN HVVLRPADYSETIACYKVALTKLTKTPTSIILTRQNVRQLQHNDVLNQVERGAYIISDQTDATVSLIASGSEVGLAIDVQ KELLNHNIKAKVISMVSTSLFDKQDKQYQDLIINKNTKRIAIEMGSSAIWYKYVGDDGLVFGIDRFGESAPANSVIKEFG FTKENLTNKILEYLNK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 3e-116 | 44 |
| APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 2e-118 | 44 |
