Gene Information

Name : CbC4_4007 (CbC4_4007)
Accession : YP_004385583.1
Strain :
Genome accession: NC_015417
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : putative IS transposase (OrfB)
Function : -
COG functional category : L : Replication, recombination and repair
COG ID : COG0675
EC number : -
Position : 6516 - 7640 bp
Length : 1125 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGTTAAAAGCATTTAAATATAGGATTTATCCTAACGACAGCCAAAAGATTCAATTATCTAAAACATTTGGATGTGCAAG
ATTTATTTACAATTACTATTTAGCAAAGAAAATTGATTTATACAAAACAGACGGTAAATTTATATCTAAATATGATTGTA
ATTCACATTGTAATAAAGAATTAAAAAAATCAGAACAATTTAAATGGCTTAAAGATGTTGATAAATTTGCCTTGACTAAT
TCAATTTATAGTTTAGATAGTGCATATAAAAAGTTTTTTAAAGAACATTCAGGATTTCCTAAGTTTAAGAGTAAGAAAAT
ACATAATTATTCTTATACAACTAACTTTACAAATAATAATATACAAGCTGATTTTATGAATAATAAAATTAAGTTACCTA
AATTAAAATGGATTAAATGCAAACTACATAGAAAATTTGAAGGTAAAATTAAATCTGCTACAATAAGTCAAGTGCCTAGT
GGTAAATACTTTGTAAGCATATTAGTAGATGTAGAAAATATTCAATTACCTAAGAATAATAACCAAATCGCTTTTGATTT
AGGAATTAAAGAATTTTTAATAGATAGTAACAATAATCATATAGATAATCCAAAAACACTATACAAGTATGAACAAAAAC
TAACCAAATTGCAAAGACAAATTGCTCATAAAGAAAAAGGTAGTCAAAATTGGATTAAGCAAAGAATTAAAATTGCTAGG
TTACATGAGAAAATAACTAATATTAGAAAAGATTTTCTAAATAAATTATCATGTCAGATAACCAATGATTATGGAATAAT
TATTTCAGAAGATTTAAATATTAAAAATATGGTTAAAAATCATCATTTAGCAAAATCAATAAGTGATGTGTCTTGGGGAG
AATTCACAAGACAATTGGCTTATAAATCAGAATGGAAAGGTAGAATTTATCATAAAATTGATCCTTGGTTTGCTAGTTCT
CAACTATGTTCTAATTGTGGATATAAAAACAAAGAAGTAAGGAAATTATCTGTTAGAGAATGGATATGTTCAGAATGTGG
AACCATTCATCAAAGGGATGAAAATGCTAGTAAAAATATTCTTAAGCAAGGATTAAAAGAATTAGAATTACAAATTGCAA
TATAA

Protein sequence :
MLKAFKYRIYPNDSQKIQLSKTFGCARFIYNYYLAKKIDLYKTDGKFISKYDCNSHCNKELKKSEQFKWLKDVDKFALTN
SIYSLDSAYKKFFKEHSGFPKFKSKKIHNYSYTTNFTNNNIQADFMNNKIKLPKLKWIKCKLHRKFEGKIKSATISQVPS
GKYFVSILVDVENIQLPKNNNQIAFDLGIKEFLIDSNNNHIDNPKTLYKYEQKLTKLQRQIAHKEKGSQNWIKQRIKIAR
LHEKITNIRKDFLNKLSCQITNDYGIIISEDLNIKNMVKNHHLAKSISDVSWGEFTRQLAYKSEWKGRIYHKIDPWFASS
QLCSNCGYKNKEVRKLSVREWICSECGTIHQRDENASKNILKQGLKELELQIAI

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
CPR_0626 YP_697953.1 ISCpe2, transposase orfB Not tested Not named Protein 1e-67 46