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Name : polA (CAR_c07290) Accession : YP_004374439.1 Strain : Carnobacterium sp. 17-4 Genome accession: NC_015391 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : 2.7.7.7 Position : 752853 - 755516 bp Length : 2664 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGATGAGTGAGAAAAAAAAATTAGTATTGATTGATGGAAATAGTGTTGCATATAGAGCTTTTTTTGCATTACATTCTCA ATTAGAAAGAATGAAAAATAAAAATGGCTTACACACGAATGCACTATATGGGTTTCATAATATGATTGATAGTGTGTTAA CAAAAGAAAAGCCTACACATGTTTTGGTTGCTTTTGATGCTGGGAATACAACCTTTCGCCATAGTTTCTTTGATGAATAT AAAGCTGGTCGGTCAAAGACACCAAGAGAATTTTCAGAACAAATGCCTTATCTTAGAGAGTTATTGGATGGATTTGGAAT TAGACATTATGAATTAGAAAACTTCGAGGCAGATGATATTATTGGAACTTTGGCAACAAAAGTTGATCCAACAATATATG ATGTAGTGGTTATATCTGGTGATCGAGATTTAACACAATTGGCAAAAGAGAATGTTCGAGTGGATATTACAGTAAAAGGT GTTAGTGAGTTAAAAGAGTACACCACTGAATCAATTTATGAAGAGATGGGTATTAGCCCGCTTCAAATCATTGATATGAA AGGTTTAGCAGGGGACGCATCAGATAACATACCAGGTGTTACAAAGATTGGCGAAAAGACAGCCCTTAAGTTATTGAAAG AGTATGGATCGGTAGAAGGAATTTATGAAAATATTGATTTATTAAAGAAAAGTAAAATGAAAGAAAACCTAATAAATGAA AAAGAAACAGCATTACTAAGCAAACGACTTGCGACTATTGATACCGACTCTCCTATAAAAATTAGCGTTGAAGAGTTGAG TTTCAATGGACCGAACATGGAAAAACTTATTTCTTTTTATAAAGAAATGGATTTTAATTCTCATTTAAGTAAGCTTGATA CTGCGGAATATGATGCAGAACAAAATAGTCAAAAAGAAGCTATTTCATATACGATCGTTACGGAAATTACAGAGAATATG TTTAACGATAATATGGCTCTTTATGTAGAAATGTTAGGCGATAACTACCATACTTCTCCTGTTTTCTGTATTGGATGGGG AGATGACCAACAGATTTATGTTGCGGAACCAGAAGTAGTTTTTGCATCAGATGATTTTAAAAACTGGGCAAAAGATAAAG AAGCTCAAAAGCAAGTATTTGATGCTAAAAGGACCTATGTTGCATTAAAGAGACAAAATGTGGATATCGCATCAATCGAC TTTGATATCTTGTTGGCTTCTTACTTGCTAAATACAAAAGATAACAGTAAAGATCTATCTGAAGTAGCTACAGAACATGA GTATTATGAGGTTTCCTCAGATGAAAGTGTTTATGGAAAAGGAGCAAAAATCGCTATTCCAGAAGAGAAAACTATAATAT ACGATCATATTGCAAGAAAGATAAAAGCGATTCGTATATTAAGTAAACAATTAGGAGAAAACTTAGAAAAGAATGAGCAA ACCAAGTTGTTTAATGAAATGGAATTGCCTTTATCTATGGTTTTAGCTGAAATGGAACTCACTGGGGTAAAAGTAAACGA TAAACGATTAATGGAAATGAAAGAAGAATTTGCCATTCGTCTAACAGATATTGAACAACGAGTATATGAATTAGCCGGTG AAAAATTCAATTTAAACTCACCAAAACAATTAGGTGTTATTTTATTCGAGAAGATGGGCTATCCTGTGATTAAAAAGACT AAAACGGGTTATTCTACTGCAGTGGATGTTTTAGAGCAATTAAGAGAACAAGCTCCGATTGTTGAGCACATTCTAGACTA TCGTCAAATCGCAAAAATACAATCTACTTATATAGAAGGTTTATTGAAAGTAATCGATAAAAAAACCGGGAAAATTCATA CACGATACATGCAGACAATTGCTCAAACGGGACGTTTAAGTTCAGTTGATCCTAACTTACAAAATATTCCGATTCGATTA GAAGAAGGCCGAAAGATTAGACAAGCGTTTGTTCCTAGTCATGAAGGTTGGGAAATATTTGCATCCGATTACTCGCAAAT TGAATTGCGTGTATTGGGTCATGTTTCAGACGATAAATTACTAAAAGAAGCCTTTATTGAGGGACAAGACATCCATTCAA GTACAGCTATGCAAGTATTTGGTATTGGATCTCCAGAAGAAGTTTCTTCTGAAATGCGCCGTAGAGCTAAAGCTGTTAAC TTTGGGATTGTTTATGGCATAAGTGATTATGGTTTATCACAAAACTTAGGAATTAGCCGAAAAGAAGCGCAGCATTTTAT TGATACGTACTTTGAAAAATACCCTGGTGTAAAAACGTATATGGAAGATATAGTGAGAGAGGCAAAAGATAAAGGGTTTG TTGAAACGCTCTTCCAACGTCGTCGTTATTTACCAGAAATCAATTCTCGAAATTTCAATTTGCGCTCATTTGCTGAAAGA ACAGCTATCAATACACCTATCCAAGGTAGTGCAGCAGATATTATAAAAATTGCTATGATTAAAATGGACCAAAAATTAAA AGAATCAACTATGAAAGCAACTATGCTGCTACAAGTACATGATGAACTAATTTTTGAAGCACCTAAAGAAGAAATTGAAC AATTAAGAGCATTAGTTGTTGAAGTTATGGAAGGTGCAGTAGAATTATCTGTTCCATTAAAAGTTGATAGCAACAGTGGA AAAAGCTGGTATGAAGCGAAATAA Protein sequence : MMSEKKKLVLIDGNSVAYRAFFALHSQLERMKNKNGLHTNALYGFHNMIDSVLTKEKPTHVLVAFDAGNTTFRHSFFDEY KAGRSKTPREFSEQMPYLRELLDGFGIRHYELENFEADDIIGTLATKVDPTIYDVVVISGDRDLTQLAKENVRVDITVKG VSELKEYTTESIYEEMGISPLQIIDMKGLAGDASDNIPGVTKIGEKTALKLLKEYGSVEGIYENIDLLKKSKMKENLINE KETALLSKRLATIDTDSPIKISVEELSFNGPNMEKLISFYKEMDFNSHLSKLDTAEYDAEQNSQKEAISYTIVTEITENM FNDNMALYVEMLGDNYHTSPVFCIGWGDDQQIYVAEPEVVFASDDFKNWAKDKEAQKQVFDAKRTYVALKRQNVDIASID FDILLASYLLNTKDNSKDLSEVATEHEYYEVSSDESVYGKGAKIAIPEEKTIIYDHIARKIKAIRILSKQLGENLEKNEQ TKLFNEMELPLSMVLAEMELTGVKVNDKRLMEMKEEFAIRLTDIEQRVYELAGEKFNLNSPKQLGVILFEKMGYPVIKKT KTGYSTAVDVLEQLREQAPIVEHILDYRQIAKIQSTYIEGLLKVIDKKTGKIHTRYMQTIAQTGRLSSVDPNLQNIPIRL EEGRKIRQAFVPSHEGWEIFASDYSQIELRVLGHVSDDKLLKEAFIEGQDIHSSTAMQVFGIGSPEEVSSEMRRRAKAVN FGIVYGISDYGLSQNLGISRKEAQHFIDTYFEKYPGVKTYMEDIVREAKDKGFVETLFQRRRYLPEINSRNFNLRSFAER TAINTPIQGSAADIIKIAMIKMDQKLKESTMKATMLLQVHDELIFEAPKEEIEQLRALVVEVMEGAVELSVPLKVDSNSG KSWYEAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 56 |
