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Name : secA (CAR_c03610) Accession : YP_004374098.1 Strain : Carnobacterium sp. 17-4 Genome accession: NC_015391 Putative virulence/resistance : Unknown Product : preprotein translocase, subunit SecA Function : - COG functional category : U : Intracellular trafficking, secretion and vesicular transport COG ID : COG0653 EC number : - Position : 365932 - 368460 bp Length : 2529 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGCTAATTTTTTACGTAACTTAATTGAGAACGATAAAAAAGAATTAAAAAGCTTAAGCAAAATAGCTAAGCAAGTTGA AGAATTTGCAGATGTAATGGCTAATTTGTCAGATAATGAACTAAAAGCAAAAACACCTGCATTGAAGAAAAGATACCAAG ATGGAGAAACGTTAGATGCTTTACTGCCTGAATCTTTTGCGGTTGTCAGAGAAGCAGCTAAACGTGTACTAGGGTTGTAT CCATATCACGTACAATTAATGGGTGGGGTTACGCTACATCGTGGAAACATTCCTGAAATGAAAACTGGTGAAGGTAAAAC GCTAACCGCAACAATGCCTGTTTATTTAAATGCGTTAACAGGAGAAGGCGTACACGTTGTCACAGTAAATGAATATTTAT CTAGTCGTGATGCTACTGAAATGGGAGAGTTATATGAATGGTTAGGCCTAACAGTAGGCTTAAACTTAAATTCAAAATCT TCAGAAGAAAAACGTGAAGCTTATTTAGCGGATGTTATGTATAGTACGAATAACGAATTAGGATTTGATTATCTTAGAGA TAATATGGTTGTTTACAAAGAACAAATGGTGCAAAGACCATTAAATTATGCGATTGTCGATGAAGTCGATTCTATTTTAA TTGATGAAGCTAGAACACCATTGATCATCTCAGGTCAAGCAGCGAAATCGACAGCTCTATACAATCGAACAGATTTCTTT GTTAAAGGATTAAAAGAGGAAGAAGATTTCACAATTGACATTCCATCTAAAACGATTGCTTTAACGGAAACTGGAATTGA GAAAGCTGAAAAAACGTTTAGAATAGATAATTTATATGATGTGGAAAATCAAGCGCTGACACACCATATCGATCAAGCTT TAAGAGCTAACTTTATTATGCATCATGACGTAGATTACGTTATTCAAGATGGTAAAGTAATGATCGTAGACCAGTTTACT GGTCGTATTATGGAAGGTCGTCGCTATTCTGATGGTTTGCACCAAGCTATTGAAGCTAAAGAAAATGTAGAAATACAGAA TGAATCAAAAACAATGGCGAATATAACATTCCAAAACTACTTCCGTATGTACAGAAAATTAGCAGGTATGACAGGTACAG CTAAGACAGAAGAAGAAGAGTTCCGTGAAATTTACAACATTCACGTAGTGTCTATACCAACAAATAAACCATTGATTCGT GATGACAAACCAGATTTACTTTACCCAACATTGGAAAGCAAGTACCATGCTGTGGTTGCAGAAATCAAAGAACGGCATGC TAATGGCCAGCCAGTATTGGTAGGAACGGTAGCTGTTGAAACATCTGAACTAATATCCGGTTATTTAAGAAAAAATAACA TTCCTCATCAAGTTTTGAATGCTAAGAATCACTTTAAAGAAGCTGAAATTATTACAAATGCTGGTCAAAAAGGTTCAGTT ACAATTGCGACCAACATGGCTGGACGTGGAACAGATATTAAATTAGGTGCAGGTGTTCGTGAAGTAGGCGGACTATGTGT TATTGGTACAGAACGACATGAGTCACGTCGTATTGATAATCAATTGCGTGGACGTTCTGGACGACAAGGAGATCCTGGGG TTACTCAATTTTATCTTTCATTAGAAGACGAATTAATGAAGAGATTTGGTTCAGAACGTATCCAAGCTGTTCTTGAAAGA CTTAAAGTGAGTGAAGAAGATGCTGTAATCCAAAGTAAAATGATTTCACGCCAAGTTGAATCTGCTCAAAAACGTGTGGA AGGAAATAACTATGATACACGTAAAAATGTTTTGCAGTATGATGATGTCATGCGTGAGCAACGCGAAATTATGTACAATC AACGACTAGAAGTGATCATGGCTGAAGATTCATTGAAACATGTCACTGTTCCAATGATCCAACGTACGATAGCACGTATT GTACAAATCAATACTCAAGGACCAAAAGAAGAGTGGAAATTACAAACTATTCTTGATTTTGCACAGGCTTCTCTAGTTCA CCCAGATGATATTGCCATGAGTGATTTAGAAGGTAAAACAGTTGAAGAAATTGAAACAGTCTTATTGGACGCTGCAAAAT CAATCTATGCTGAAAAAGAGAAACAATTAAATGGTAAAGAACAAGTTCTAGAATTTGAAAAAGTTGTTATTTTACGTGTA GTGGATAGCAAATGGACAGAGCACATTGATACAATGGAACAACTGCGCCAAGGTATTGGTCTGCGTGCATATGGACAAAG CAATCCATTAGTTGAGTACCAAGCAGAAGGGTTCAAATTGTTTGAAGAAATGATTGGTTCTATTGATTACGAAGTGACTC GTCTATTAATGAAATCACAAATTCGTCAAAACTTACAAAGAGAACAAGTTGCCAAAGGAACAACGGCACGTTCAACAGGT GACGGACAAGTTGTTAAAGAAGCACAAAAAAAACCAATGAAAATAGATAGTTCAAAAGTAGGGCGTAATGATCCTTGTCC ATGTGGAAGCGGTAAAAAGTATAAAAATTGTCATGGAAAATTGGATTAA Protein sequence : MANFLRNLIENDKKELKSLSKIAKQVEEFADVMANLSDNELKAKTPALKKRYQDGETLDALLPESFAVVREAAKRVLGLY PYHVQLMGGVTLHRGNIPEMKTGEGKTLTATMPVYLNALTGEGVHVVTVNEYLSSRDATEMGELYEWLGLTVGLNLNSKS SEEKREAYLADVMYSTNNELGFDYLRDNMVVYKEQMVQRPLNYAIVDEVDSILIDEARTPLIISGQAAKSTALYNRTDFF VKGLKEEEDFTIDIPSKTIALTETGIEKAEKTFRIDNLYDVENQALTHHIDQALRANFIMHHDVDYVIQDGKVMIVDQFT GRIMEGRRYSDGLHQAIEAKENVEIQNESKTMANITFQNYFRMYRKLAGMTGTAKTEEEEFREIYNIHVVSIPTNKPLIR DDKPDLLYPTLESKYHAVVAEIKERHANGQPVLVGTVAVETSELISGYLRKNNIPHQVLNAKNHFKEAEIITNAGQKGSV TIATNMAGRGTDIKLGAGVREVGGLCVIGTERHESRRIDNQLRGRSGRQGDPGVTQFYLSLEDELMKRFGSERIQAVLER LKVSEEDAVIQSKMISRQVESAQKRVEGNNYDTRKNVLQYDDVMREQREIMYNQRLEVIMAEDSLKHVTVPMIQRTIARI VQINTQGPKEEWKLQTILDFAQASLVHPDDIAMSDLEGKTVEEIETVLLDAAKSIYAEKEKQLNGKEQVLEFEKVVILRV VDSKWTEHIDTMEQLRQGIGLRAYGQSNPLVEYQAEGFKLFEEMIGSIDYEVTRLLMKSQIRQNLQREQVAKGTTARSTG DGQVVKEAQKKPMKIDSSKVGRNDPCPCGSGKKYKNCHGKLD |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secA2 | YP_006310687.1 | preprotein translocase subunit SecA2 | Not tested | FWisland_3 | Protein | 3e-141 | 41 |
