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Name : kdpD (CAR_c22780) Accession : YP_004375951.1 Strain : Carnobacterium sp. 17-4 Genome accession: NC_015391 Putative virulence/resistance : Unknown Product : sensor protein Function : - COG functional category : T : Signal transduction mechanisms COG ID : COG2205 EC number : 2.7.13.3 Position : 2391846 - 2394443 bp Length : 2598 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGATGGAATGAACCAGAAAACTGAAAAAATATTAAGAAAAATTCAATTTGAAGATACAAAACGTGGTAAATTGAGAGT GTTCTTTGGTTTTGCAGCTGGAGTAGGCAAAACCTATGGAATGCTATCGGAAGCCCATGAGTTAATACTCATGGGTAAAA CTGTTGTTATAGGATATATTGAACCTCATAACCGACCAGATACAAATCGATTGGTGGAAGGTATTCCTACAGTTCCAGTG AAAAAACTGTCTTATAAACAATTAACGCTTTGCGAACCAGATATTGATAAGCTAATTGAGTTGTCTCCGGATATTGTCTT GATTGATGAATTAGCGCATACGAATGCAGAAGGTTCTAGAAATAAGAAGCGGTATCAAGATGTAGATGAGTTATTGAATG CTGGAATCAATGTATTCACAACTATTAACGTTCAACATGTAGAAAGCCTAAATGATATTGTTGAAGAAGTAACTGGGATT GAAATGAAAGAAACAGTTCCAGATACATTTTTCACGCATGCTGTTTTAAAAGTGATCGATGTTGAACCAAATGAATTGAT TGAGCGTCTTGAACAAGGGAAAATATATTCCAATGAGAGCGCAATACAAGCGCTGAGAAATTTCTTTATCATTGAAAAAC TAGATCAACTTAGAGGTTTAGCGATTCAACGAGCGTCTGATCATATTAATCGTGTTAGTGCAAAAACAATCGGAATCCAA AGTAAACTATTGACGATTATTGAGGATACCTATCCTAAGATGGCAGAAAAATGTATCCGTTGGAGTTCCAGGCTGGCTCA AGGGGTGGGTGCTGAGTGGGTGGTTATCCAGATTCGCTCCTTAGATGAAACTCCTGATACGATTCCTCTTGCCGAAAAAC TGGGTGCCGAAGTCATTAGTATTGAAGCGGAAGATAGTTTTGAGACCATCGTGGAATATTCTAAAATGATTGGTGCTACA GATATCATAATAGGAAAAAATCTCACGAAGAAGTGGTACCAAGGGGTCTTTTTTGAATCATTTGAAGATCGACTCATTAA ACGACTAGTTGAAACTGAGATTCATCTTATTCCTTATAAGGAAAAAAAAAATCAGCCCATTTTCTCTTTTGATGAAGTCA TTGAAGGTGGAGTAAGGGACTTTGCTATCGCGTTTGGTGGAGTCATTGCTGCGACCTTAATCACAGAAATTTTACATTAT TTGCACTTTGGTGAACAAAATCTGATGCTGGTTTTTATTTTATGTGTTTTAGTGACAGCTCGGTTGACTTCCGGTTATTT CTGGAGTGCATTGTCTTCTATTGTGAGTGTATTATCGTTCAACTGGTTCTTTGTTGAACCCTTGTATTCGTTGACCGTTT ATAAAGAGGGATACCCTATAACGCTTTTTATCATGCTGATGGTAGCATTGATGGTCAGTAACTTAATGGTACGCTTAAAG AAACGAGCCCTTACCTCGAAAGAAAAAGAGCAACAGATGGAAATACTGTATGAGTTGAATAAACGTTATATCATAGCAAC AACCAATCAGCAGATCTTTAATAGCACCACTATTTTTTTATCACGCTTATTAAATCACGAAGTCATTGTCTATGATAATA ATGGTCATAAAAAAAGTCTTAAAACACTTGAGGATACCGCGTCGGTATTGGATTCTACAGATGAAGCAGCTGTCGCTTTT TGGTCAGTGAAAAATCAAAAAGAAGCTGGACATGGTACGGACACGTTAACGGGTGCTAAAGGGTTTTATTTGCCTATTGT GTTAAATGGAAAAAGTCTAGGTGTTTTAGGGATTGAAAAAAGTGAAGATAAAGAAATAAAAAACAGTCATTTGAACTATT TAAAACTGATAGTTACTCAATTGGCTATTGTGCTTGAACAATCCTATTTGAAAGAAGAAACAAAAAGAATACAGATTGAG AATGAGCGTGAAAAAGTCAGGAGCAATTTATTACGAGCGATTTCTCATGATTTACGGACTCCTTTGACAGCTATTTCAGG AATAGCAGAGACACTTGGAGATGAAGATCTAGAAATAAAACAAGAAACGAAAAAAAAATTGTTATTGGATATCCAGGAAG AATCTCAATGGCTAATACGAATGGTAGAAAACTTACTATCGATAACGCGTATTAACATGGATACGATGAAAGTGAAAAAA ACCAATGAATCATTAGAAGAAATCATCGAAGCTGTTTTAAATCGATTAAAAAAGGTGTACCCGGTTCAAAAATTAGCTGT TTCATTACCGGAAGAATTAATATTTGTTAATGTAGATCCGATTTTAATCGAACAGGCACTGTTTAATTTAGTTGAAAATG CATTTAGGCATGGAGATAAAATGAAAGAGGTCTCTTTGATCATCAAGAAAAGTGGAGAATTTGTGCAGTTTGAAATTGTG AACTATGGTGAAATTCCTTCGAGTCAATTTCAAAAACTGCAGAATAACTTAGTGATGAATGAAGAAGTTCCAGTTGATTC AAAAAACGGATTGGGAATAGGGCTAAGCATCGTCAAAACAATCATCCATGCGCATAACGGGAAACTTGAAATAGAGAAAG AACAAGGAAAAACGATTTTTAGATTTTATGTCAGTTAA Protein sequence : MDGMNQKTEKILRKIQFEDTKRGKLRVFFGFAAGVGKTYGMLSEAHELILMGKTVVIGYIEPHNRPDTNRLVEGIPTVPV KKLSYKQLTLCEPDIDKLIELSPDIVLIDELAHTNAEGSRNKKRYQDVDELLNAGINVFTTINVQHVESLNDIVEEVTGI EMKETVPDTFFTHAVLKVIDVEPNELIERLEQGKIYSNESAIQALRNFFIIEKLDQLRGLAIQRASDHINRVSAKTIGIQ SKLLTIIEDTYPKMAEKCIRWSSRLAQGVGAEWVVIQIRSLDETPDTIPLAEKLGAEVISIEAEDSFETIVEYSKMIGAT DIIIGKNLTKKWYQGVFFESFEDRLIKRLVETEIHLIPYKEKKNQPIFSFDEVIEGGVRDFAIAFGGVIAATLITEILHY LHFGEQNLMLVFILCVLVTARLTSGYFWSALSSIVSVLSFNWFFVEPLYSLTVYKEGYPITLFIMLMVALMVSNLMVRLK KRALTSKEKEQQMEILYELNKRYIIATTNQQIFNSTTIFLSRLLNHEVIVYDNNGHKKSLKTLEDTASVLDSTDEAAVAF WSVKNQKEAGHGTDTLTGAKGFYLPIVLNGKSLGVLGIEKSEDKEIKNSHLNYLKLIVTQLAIVLEQSYLKEETKRIQIE NEREKVRSNLLRAISHDLRTPLTAISGIAETLGDEDLEIKQETKKKLLLDIQEESQWLIRMVENLLSITRINMDTMKVKK TNESLEEIIEAVLNRLKKVYPVQKLAVSLPEELIFVNVDPILIEQALFNLVENAFRHGDKMKEVSLIIKKSGEFVQFEIV NYGEIPSSQFQKLQNNLVMNEEVPVDSKNGLGIGLSIVKTIIHAHNGKLEIEKEQGKTIFRFYVS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| kdpD | NP_814336.1 | sensor histidine kinase KdpD | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 68 |
| ef0090 | AAM75293.1 | EF0090 | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 68 |
