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Name : Clole_2063 (Clole_2063) Accession : YP_004308975.1 Strain : Clostridium lentocellum DSM 5427 Genome accession: NC_015275 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : - Position : 2277743 - 2280391 bp Length : 2649 bp Strand : + Note : TIGRFAM: DNA polymerase 1; PFAM: DNA-directed DNA polymerase, family A, palm domain; 5'-3' exonuclease, alpha-helical arch, N-terminal; 5'-3' exonuclease, SAM-fold domain; KEGG: cth:Cthe_0886 DNA polymerase I; SMART: 5'-3' exonuclease, N-terminal; DNA-dir DNA sequence : ATGAAACAAAAATTATTATTATTTGATGGGCATAGTATTGCCAACCGTGCCTTTTATGGGGTGCCTTTATTAACGAATAA AAGCGGTCAATATACCAATGCGATATATGGTTTTTTAAATATGATGTTAAGTATTATGGAAAAAGAAAAACCTGATTACT TAGGTATTACCTTTGATTTAAGTGTACCAACCTTTAGACATGAATTTTCAGCAGATTATAAAGGGAATCGAAAAGGTATG CCAGAAGAGCTTAGGGTACAGATTCCGTTGCTTAAAAAGGTACTCAAAGCAATGCATATTCACATTATTGAAAAAGAAGG TTTTGAAGCAGATGATGTTTTAGGGACCTTGGCTAAAGCTGGAGAAAAAGCAGGGATGCAAGTAACTGTTGTGTCTGGAG ATCGAGATTTATTCCAAATTACATCGGATATGATTGAGATTAAGATACCTCGTACAAAAAAGACAGGAACAGAAATCGAA AGCTTTTTTGCCAAAGACGTTGTAGAAACCTATGGTGTATCACCAATAGCTTTTGTGGATGTTAAAGGGCTTATGGGAGA TGCTTCTGATAATATTAAAGGAGTACCAGGTATTGGTGAAAAAACAGCTATTAAACTTATTAAGGAATACGGTAGTATTG AGAATCTTCTAGATCAGGTGGATCAAATTACACAAAAGAAACTTAAGGAAAATTTAATGACTTATGCGCAGGATGCTAGG GACAGTAAAATGTTGGCTACTATTATTTGTGATGTTCCCTTAGTTTATAAATGGAGCGATTTTGAGTTTGATTTAGCTCT AGATAGTGAAGCAACAGCACTATTTAGAGATTTAGAGCTTAAGTCCCTTTTAACAAAACTACCCAAGATGGAAAATGAAG CTATAGCAGAAGCAGAAGAAGTTAAAGTAGAGCAGTGGAAGACAACAGATTTTGAAAAGTTTTTACAGGAAAGCAAGGAC CAAATGGTCGGGATAGCTTATTTTGTAGAAGATAATACATTAGGTTTGGGTGTTGCTATAGGAGAGCGAGTAGGGTATAG TGAGTGGGACTTAACAGATACAGAAGCTAAAGCTGTTTTGATAGAGTTTCTAGAAAGTGCGACTTATCAAAAAATCGTTC ATGATAGTAAAAATTTCAAACATGAACTTTTAAAAGTAGGATTGGGATTAAATGGTGTTTGCTTTGATACTTTCATTGCA GCGTATTTATTACATCCAACTAATAAAAGCTATGATCTAGCAGAACTAGAAGAACTTTTCATTAATAAACAAAGCTTAAT GAATTTAGAAAACCTATTAGGGAAAGGAAAGAGCCAAAAAACATGGTTACAGCTAGAAGATGAGGAACGTATAAATAATT TAGGAAAGAGGTCGCAGTTAGCTTTAAGTGTAACAGAAGCTATGAAAGAAGCACTTCAAGAACAAAACATGACTAGATTA TTTTATGATATAGAAATGCCACTTATTGATGTTCTTTTTGATATGGAGGTTGAGGGAATTAAAGTAGATCCAGAAGGGCT CAGAAGTTATGGAGAAGAATTACAGGGGTTATTAGATACTTTGACAACTTCTATCTATGAAGCAGCTGGTGAAAGTTTTA ATATTAATTCACCTAAACAATTAGGCGTTATTTTATTTGAAAAACTAGGTATTCCATGTGCTAAAAAAACGAAAACAGGC TATTCTACAGCAGCAGAGGTGTTAGAAGCTTTAAAAAATGACTATCCTATTGTGGCACAGATTCTAGAATACCGTCAGTA TGCTAAATTAAAATCCACGTATGTAGATGGGCTGTTAAATGTACTAACTGAACAAAATAAGATTCATTCTACCTTTAATC AGACTATTACAGCTACAGGACGCTTAAGTAGCACAGAACCTAATTTACAAAATATCCCTGTTAAATTTGAAATGGGTAAG AAAATTCGTCAGCTATTTGTACCTAGCTCAGAAAACCATATTTTTTTAGATGGAGATTATTCTCAAATCGAACTAAGAGT GCTTGCCCATATGTCGGGAGATCCAACGCTTATCAAAGCTTTTAAAGAAAATATTGATATTCATGCACTAACAGCTTCGC AAGTTTTTCATGTGCCTTTTGAAGACGTGACAAGTATGCAGCGTAGTAATGCAAAAGCTGTTAATTTTGGTATTGTATAT GGTATTAGTGCCTTTGCATTGTCAGAGGATCTTAAAATTAGCCAAAAAGAAGCTCAAAAATATATCGATGGCTATTTTGA AAAATATCCTTGTATTAAAGCCTACTTAGATGAGATTATTGATTTCGCTATGCAAAATGGTTATGTAGAAACCTTATATC ATCGAAAAAGAGAGATTCCAGAGATATTAGCAAGCAATTATAATATGAGGGAGTTTGGGAAGCGTGTTGCTATGAACACA CCTATTCAAGGAACCTCGGCTGATATTATTAAGATTGCTATGATTCGTGTACATCAAAAACTTAAAGAACACAGTCTTAA GTCAAAACTTATTTTAACAGTTCATGATGAACTTTTAATTGATGCCCATAAAGATGAAGTTGAAATTGTTAAAAAACTTT TAAAAGAAGAGATGGAACATGCAGCTGATTTAAGCGTGCCACTTGTAGTAGATGTACATCAGGGGGCCAATTGGTTAGCA GTAAAATAG Protein sequence : MKQKLLLFDGHSIANRAFYGVPLLTNKSGQYTNAIYGFLNMMLSIMEKEKPDYLGITFDLSVPTFRHEFSADYKGNRKGM PEELRVQIPLLKKVLKAMHIHIIEKEGFEADDVLGTLAKAGEKAGMQVTVVSGDRDLFQITSDMIEIKIPRTKKTGTEIE SFFAKDVVETYGVSPIAFVDVKGLMGDASDNIKGVPGIGEKTAIKLIKEYGSIENLLDQVDQITQKKLKENLMTYAQDAR DSKMLATIICDVPLVYKWSDFEFDLALDSEATALFRDLELKSLLTKLPKMENEAIAEAEEVKVEQWKTTDFEKFLQESKD QMVGIAYFVEDNTLGLGVAIGERVGYSEWDLTDTEAKAVLIEFLESATYQKIVHDSKNFKHELLKVGLGLNGVCFDTFIA AYLLHPTNKSYDLAELEELFINKQSLMNLENLLGKGKSQKTWLQLEDEERINNLGKRSQLALSVTEAMKEALQEQNMTRL FYDIEMPLIDVLFDMEVEGIKVDPEGLRSYGEELQGLLDTLTTSIYEAAGESFNINSPKQLGVILFEKLGIPCAKKTKTG YSTAAEVLEALKNDYPIVAQILEYRQYAKLKSTYVDGLLNVLTEQNKIHSTFNQTITATGRLSSTEPNLQNIPVKFEMGK KIRQLFVPSSENHIFLDGDYSQIELRVLAHMSGDPTLIKAFKENIDIHALTASQVFHVPFEDVTSMQRSNAKAVNFGIVY GISAFALSEDLKISQKEAQKYIDGYFEKYPCIKAYLDEIIDFAMQNGYVETLYHRKREIPEILASNYNMREFGKRVAMNT PIQGTSADIIKIAMIRVHQKLKEHSLKSKLILTVHDELLIDAHKDEVEIVKKLLKEEMEHAADLSVPLVVDVHQGANWLA VK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 1e-147 | 41 |
