Gene Information

Name : Clole_1526 (Clole_1526)
Accession : YP_004308450.1
Strain : Clostridium lentocellum DSM 5427
Genome accession: NC_015275
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : ammonium transporter
Function : -
COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism
COG ID : COG0004
EC number : -
Position : 1707713 - 1708969 bp
Length : 1257 bp
Strand : +
Note : KEGG: cbe:Cbei_2061 ammonium transporter; TIGRFAM: Ammonium transporter; PFAM: Ammonium transporter

DNA sequence :
ATGAATTTACAAATTAATGCAGGAGATACAGGATTTATAATGATTTGCTCGGCACTGGTATTTTTAATGACACCAGGGCT
TGCTTTCTTTTATGCTGGGATGGTAAGAAGAAAAAATGCTTTAAACACACTTTTATCTTGTTTTTTTATTTGTGGTTTAG
CTTCATTAATGTGGATTATTTGTGGCTATTCTCTATCTTTTGGAACAGATCATGCAGGTGTTTTAGGCGGTCTTAATCAT
TTGTTCTTTAACGGTGTTGGGATGCAGCCCAATGGTGACTATTCAGGAACGATTCCCGAAACCTTATTTGCAGCTTTTCA
AATGATGTTTGCTATTATTACACCTGCTCTTATCTGCGGAGCTGTGGCAGAACGTATGAAGTTTTCTAGATTAGTTATTT
TTATAGGTATATGGTCTTTATTAGTATATTACCCATTAGCTCATATGGTTTGGGGTGCAGGTGGTTTCTTAAGAGAGTTA
GGTGCACTTGATTTTGCAGGTGGTAATGTTGTACACATTAGCTCAGGTGTAACAGGTTTAGTAGCATGTATCATTCTAGG
TAAACGCCGTGGTTATGGTATGCTTTCCTATAAACCACATAATATTCCTTTTGTTGTTTTAGGCGCAGGTTTATTATGGT
TTGGTTGGTTTGGTTTTAATGCAGGTAGTGCTTTAGCTGCCAGTCCTTTAGCGGTTCACGCTTTCCTTACAACCAATACT
TCAGCAGCAGCAGCACTTATTTCTTGGTTAATTGTTGAGAAGATTGTTTATAAAAAGGTAACGGTATTAGGTGCAGCAAC
AGGTGGTGTTATAGGACTTGTAGCCATTACACCAGGTGCAGGCTTTGTTCCTATTTGGGCTTCTATTATTATAGGCCTTG
TAGTAAGTCCACTTTGCTTCTTCTTTATGTCAAAGGTAAAAGGTAAATTTGCTTATGATGATGCATTAGATGCATTTGGT
TGCCATGGTATAGGTGGTATTTGGGGGGGGATTGCAACAGGTATTTTTGCACACCAATCTATTAATCCAGATGTCATTAA
ATGGAATGGTCTTATTTATGGAGAAACAAAATTATTTGGAGCACAACTTCTTAGTATTGTTGTAACAATCGTTATTGCAG
TAGTAGTAAGCTTTATTATCTTAAAGGTTATGAAATGTTTTGGGGATCTACGTGTAAGTGTGGAAGCTGAGGGTGTAGGA
CTTGACTTAGCAGAGCATAATGAAGCAGCTTATCCTGCTTATAATGGTTTAGATTAA

Protein sequence :
MNLQINAGDTGFIMICSALVFLMTPGLAFFYAGMVRRKNALNTLLSCFFICGLASLMWIICGYSLSFGTDHAGVLGGLNH
LFFNGVGMQPNGDYSGTIPETLFAAFQMMFAIITPALICGAVAERMKFSRLVIFIGIWSLLVYYPLAHMVWGAGGFLREL
GALDFAGGNVVHISSGVTGLVACIILGKRRGYGMLSYKPHNIPFVVLGAGLLWFGWFGFNAGSALAASPLAVHAFLTTNT
SAAAALISWLIVEKIVYKKVTVLGAATGGVIGLVAITPGAGFVPIWASIIIGLVVSPLCFFFMSKVKGKFAYDDALDAFG
CHGIGGIWGGIATGIFAHQSINPDVIKWNGLIYGETKLFGAQLLSIVVTIVIAVVVSFIILKVMKCFGDLRVSVEAEGVG
LDLAEHNEAAYPAYNGLD

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00287 YP_008207752.1 Ammonia permease Not tested AbaR25 Protein 6e-58 48
BJAB0868_00291 YP_008211617.1 Ammonia permease Not tested AbaR26 Protein 6e-58 48