|
Name : Clole_1004 (Clole_1004) Accession : YP_004307934.1 Strain : Clostridium lentocellum DSM 5427 Genome accession: NC_015275 Putative virulence/resistance : Virulence Product : pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0674 EC number : 1.2.1.51 Position : 1145266 - 1148811 bp Length : 3546 bp Strand : + Note : SMART: pyruvate-flavodoxin oxidoreductase, EKR domain; TIGRFAM: pyruvate-flavodoxin oxidoreductase; KEGG: cdl:CDR20291_2570 pyruvate-flavodoxin oxidoreductase; PFAM: pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase, N-terminal; pyruvate-flavodoxin oxidoreduc DNA sequence : ATGGGAAAAACAATGATGACTGTAGATGGTAACACAGCGGCAGCATATATCGCTTATGCGTATACTGATGTGGCAGCTAT CTATCCAATTACGCCATCTACACCTATGGCTGAACAAGTAGATGAATGGGCCGCACAAGGCAAGAAAAATATATTTGGAC AAACTGTCAATGTAGTAGAAATGCAATCTGAAGCAGGGGCTTCAGGGGCTTTTCATGGTTCACTTCAAGCAGGTGCGTTA ACAAGTACCTTCACTGCTTCACAAGGCTTGTTACTTATGATTCCAAATATGTATAAGGTATCCGGAGAGCTTTTACCAGG TGTTTTTCATGTGAGTGCTAGAGCAATAGCTGCGCAGGCTCTTTCGATTTTTGGTGATCACCAAGATGTTATGGCTACAA GACAAACCGGATGTGCGTTATTTGCAACTAGTTCTGTTCAAGAGATTATGGACCTAGCACCAGTAGCACATCTTGCGGCT ATTAAAGGACGTGTACCCTTTGTTCATTTCTTTGATGGTTTTAGAACTTCACATGAGATTCAAAAAGTAGAAGCAATTAA CTATGAAGATTTAGCAAAGCTAATGCCCATAGAAGAGCTTCAAGCTTTTAGAGATAGAGCTTTATCTCCTAATCATCCCG TTATTCGTGGTACAGCGCAAAATCCAGATATTTATTTCCAAACAAGGGAGGCAAGTAATAAATTTTATGAAGCTCTAGTA CCTATTGTAGAAGAATATATTGAAAAGATGAATGCCCTTACTGGCAGAAAATACGGCCTCTTTGATTATTATGGGGCAGA GGATGCAGAAAATATTATTGTAGCTATGGGGTCTGTAACAGCTACCATTGCGGAAACTATAGATGCCTTAAATGCTAAAG GACAAAAGCTAGGTCTTGTTAAAGTGCATCTTTATAGACCTTTTTCAGTAGAACACTTTCTTAAAGCGGTGCCAAAGAAT GTTAGGCGTATATGTGTACTGGATCGTACTAAAGAGCCAGGTGCTATAGGGGAACCACTTTATTTAGATGTACGTGCTGC TTTCTATGAAAAAGAAGATGCACCCATGATTATTGGTGGTCGTTATGGATTAGGCTCTAAAGATACCACGCCAACAGATA TTAAGGCAGTAGTAGAAAATCTTTTAAGTAGTACACCTAAAAATCAATTCACTGTGAGCATTGATGATGATGTTACGCAT ACTTCTATTAATACAAAAGAACCACTTAAGCTTCAAGTGCCGGATTTAGTACGTTGCAAATTCTGGGGACTAGGTTCAGA TGGTACAGTTGGGGCTAATAAGCAAGCTATAAAAATTATTGGTAATTATACGGATATGTATGCTCAAGCTTATTTTGACT ATGACTCTAAAAAGTCTGGTGGCTTAACCATGTCACATCTTCGTTTTGGTAAAGAACCGATTAATGCACCTTATCTTATT GATGAAGCAGATTATATTGCTTGCCATAATCAATCTTATATACATCAGTATGATGTTTTAAAAGGACTTAAAAAGGGAGG CATATTCGTTCTTAACTGCTTATGGGATGAAAAAGAATTAGAAGAGAATTTATCAACTACCATGAAGCGCACCATCGCAG AAAATGACATCCAATTCTACACTGTAAATGCTGTTAAAATTGCTTCTGAAATAGGACTGGGTAACCGTATTAATATGATT ATGCAAGCAGCCTTCTTTAAGTTAACAGATATTATACCAGAGGCCCAGGCAGCTCAGTATTTAAAAGAAGCAGTGGTTAA AGCTTATGGGAAAAAAGGTGAAAAGGTCATTAATATGAACTATGCTGCTATTGATAGGGGGCTTGAGGCAGCGATAAAAG TTAATGTGCCAGAAAATTGGAAAAAGGGAACAAGTGTAGATGAAAGAGGTTTTGACGAACCTGAATTTGTAACGAAGATA TTACGCCCTATGAGTAGACAAGAAGGCGATAGCCTTCCAGTAAGTACATTTAATGGGATTGAAGATGGTACTTTTCCAAG TGGTAGTGCAGCTTATGAAAAGCGTGGGGTAGCTATTAATGTACCAGAGTGGGTTCCCGAGAACTGTATTCAATGTAACC AATGCTCATTTATTTGTCCGCATGCTACAATTAGACCTTATCTTTTAAATACCGAAGAGGAAAGCGAAAAGCCAGGTAGT TTTGTAACACTTAAGGCCATGGGAAAGGATATGAATGAGTTTGGTTATCGCATTCAAGTTGATACAATGGACTGTACAGG CTGTGGTAACTGTGCTGATATTTGTCCAGGTAAAAAAGAAGGTAAGGCCCTTATTATGAAACCACTCCATACTCAGGTAG AAAAGGAAGTACCTAACTGGGAATATGCAGTTTCTAAAATTGCCAATAAGGGAGATGTTATGGCACCACATACCGTCAAA GGTAGCCAGTTCAGACAACCTCTTCATGAGTTCTCAGGTGCTTGCGCAGGCTGTGGTGAAACAGCGTATATTAAAGTCAT TACACAGCTTTTCGGAGATCGTATGATGATTGCTAATGCCACTGGTTGTTCTTCTATTTGGGGGGCATCTGCGCCTGTTA CACCATATACGGTCAATGAAAAAGGCCAAGGACCATCATGGGCCAACTCTTTGTTCGAAGATAATGCTGAATATGGATTA GGAATGTATCTAGGTGTGAAACAAATGCGAAATAAAATCGAAGACAATATGAGGTCTTTACTAGAACTGCCTATTGGTGA AGATATGAAATCAGCATTTAATGAATGGTTAAGTACAAAAGAATCTGGGGCTGAATCTAGAAGAATAAGTGAGCAGGTTC TAGCGGTATTAGAAAAAGACACAACGGCTGACGAAGCTACTAAAACTTTAATTAATGAGATTAAGGAAAGAAAGGATTAT CTTGTTAAACGTTCACAATGGATATTAGGTGGTGACGGCTGGGCTTATGATATTGGTTATGGTGGTCTTGACCAAGTCAT GGCCTCAGGTGAAGATGTTAATGTGCTTGTATTCGATACTGAGATTTACTCTAATACAGGTGGTCAAGCTTCTAAATCTA CACCAGCAGCAGCTATTGCCAAATTCGCTGCCTCTGGTAAAAAATCTCGTAAAAAAGACTTAGGTTTAATGATGATAACC TATGGTAATGTGTATGTAGCTCAAGTATCTATGGGAGCAGATAAAAATCAATTTATGAAAGCTGTTATAGAAGCAGAAGC ACACCCAGGACCATCTATTATTATTGCTTATGCCCCATGTATTAGTCATGGACTAAGAGAAGGTATGGGCAGAACAACAG CTAATCAGGAACAAGCTGTTAAATGCGGTTACTGGCATTTATATCGTTTTAATCCATTGCTTAAAGAACAAGGTAAAAAT CCATTTACTTTAGATTCGAAAGAAGCAAAAGAAAGTTTTAGAGATTTCATAATGGCGCAGGTGCGTTATTCAGCTTTAAT GAAACAGTTCCCAGAACATGCTGAGCATTTATTTGAGCTTACTGAGCAATATGCAAAGGAACGTTATGAAAATTATAAAC GTTTAGCTGAACAGGTATACAGCTAG Protein sequence : MGKTMMTVDGNTAAAYIAYAYTDVAAIYPITPSTPMAEQVDEWAAQGKKNIFGQTVNVVEMQSEAGASGAFHGSLQAGAL TSTFTASQGLLLMIPNMYKVSGELLPGVFHVSARAIAAQALSIFGDHQDVMATRQTGCALFATSSVQEIMDLAPVAHLAA IKGRVPFVHFFDGFRTSHEIQKVEAINYEDLAKLMPIEELQAFRDRALSPNHPVIRGTAQNPDIYFQTREASNKFYEALV PIVEEYIEKMNALTGRKYGLFDYYGAEDAENIIVAMGSVTATIAETIDALNAKGQKLGLVKVHLYRPFSVEHFLKAVPKN VRRICVLDRTKEPGAIGEPLYLDVRAAFYEKEDAPMIIGGRYGLGSKDTTPTDIKAVVENLLSSTPKNQFTVSIDDDVTH TSINTKEPLKLQVPDLVRCKFWGLGSDGTVGANKQAIKIIGNYTDMYAQAYFDYDSKKSGGLTMSHLRFGKEPINAPYLI DEADYIACHNQSYIHQYDVLKGLKKGGIFVLNCLWDEKELEENLSTTMKRTIAENDIQFYTVNAVKIASEIGLGNRINMI MQAAFFKLTDIIPEAQAAQYLKEAVVKAYGKKGEKVINMNYAAIDRGLEAAIKVNVPENWKKGTSVDERGFDEPEFVTKI LRPMSRQEGDSLPVSTFNGIEDGTFPSGSAAYEKRGVAINVPEWVPENCIQCNQCSFICPHATIRPYLLNTEEESEKPGS FVTLKAMGKDMNEFGYRIQVDTMDCTGCGNCADICPGKKEGKALIMKPLHTQVEKEVPNWEYAVSKIANKGDVMAPHTVK GSQFRQPLHEFSGACAGCGETAYIKVITQLFGDRMMIANATGCSSIWGASAPVTPYTVNEKGQGPSWANSLFEDNAEYGL GMYLGVKQMRNKIEDNMRSLLELPIGEDMKSAFNEWLSTKESGAESRRISEQVLAVLEKDTTADEATKTLINEIKERKDY LVKRSQWILGGDGWAYDIGYGGLDQVMASGEDVNVLVFDTEIYSNTGGQASKSTPAAAIAKFAASGKKSRKKDLGLMMIT YGNVYVAQVSMGADKNQFMKAVIEAEAHPGPSIIIAYAPCISHGLREGMGRTTANQEQAVKCGYWHLYRFNPLLKEQGKN PFTLDSKEAKESFRDFIMAQVRYSALMKQFPEHAEHLFELTEQYAKERYENYKRLAEQVYS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | AFJ97267.1 | pyruvate ferredoxin | Virulence | Not named | Protein | 0.0 | 55 |
