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Name : YE105_C0912 (YE105_C0912) Accession : YP_004297111.1 Strain : Yersinia enterocolitica 105.5R(r) Genome accession: NC_015224 Putative virulence/resistance : Unknown Product : general secretion pathway protein D Function : - COG functional category : N : Cell motility COG ID : COG1450 EC number : - Position : 1079532 - 1081478 bp Length : 1947 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTGCCAAAATAATATAAACATACTTTGTAATTCAATTTTGTTTTTATTTAAAATTATTATTTTAGCTGCTATTTTTCC TATAGTAGGATATGGAGAGAACTTCTCTGCATCTTTTAGAGATGCTGATATAAAAGAATTTATTAATACTGTAAGTAAAA ATATAAATAAAACTATAATTATAGACCCAAAAGTACAAGGGTTAGTCAGCGTTCGTAGCTATGAACTACTAGATGAGGAA AAATACTATCAATTTTTTTTAAATGTATTGGATGTTTATGGTTATACCGTGGTAGAAATGCCAAATAATATCTTAAAAGT TATTCCGGCAAAACGTGCAAAAGGTTCCGTTGTTCCTCTACAAAATAATGCGGAAAACCCCCAAGGTGATGAGTTAATTA ACCGCGTATTTAAACTTAAACATCTACTAGCTAAAAACTTAGCTCCATTACTACGTCAGTTAAATGATAATTCGGAATCG GGCAGTATTGTTAATTATGACCCTTCAAATGTAATATTAATTACAGGGCGTGCAGCAGTAGTAAACCGTTTATACGCTAT TATTAGTACATTAGATCAACCGGGAGAGACAGAAGTTGAACTCTACCAACTGAATCATGCTGTCGCCACTGATATTATTA AATTAGTTAATCAAGTTATTAATCCAGTAAATACCATAGCCAAACAAGGGTCATTCAATACTGCAACAGTGGTTGCGGAT GGCAGAACGAATTCAGTGATAATTAGCGGTGATCGCCATATCAGGAAAAAAACTCTTCAAATGATAAAGAGGCTGGATCA TCAACAAGAAAGTTATGGCAGTACTAAAGTTGTTTATATGAAATATGCGCAGGCATCAAAGTTATTGGATGTGTTGAACG GTGTCAGTCAGGGGAGCCAAAGTGATAAGACTAAAAAAAATTCGGGGAAGAGTCACATCAAGAATGTTTCAATTAAGGCT TATGACCAAACCAATGCCTTAGTGATTACTGCTGATCCAAAAGTAATGAAAGAATTGGACCAAGTTATTGAAAGATTGGA TATTAGACGGGCCCAGGTTCTGGTAGAAGCCATTATAGTTGAGACTCAAAATGGAGAAGGCCTAAATCTTGGCATTCAAT GGGCTAATAAACTTTATGGTGGAACCAATTTCCTTCAAAAAACAAACAGTATACAAACAAATAATAACAGTGGAAACCCT ATACCAATGATGATGGCAGGGTTGACGGCCGGTTTTTATAAAGGAAACTGGGATGGTCTTTTCACTGCCCTGGCAACTAA TTCAAATAATAATATTCTTGCTACTCCGAGTATTGTCACTCTGGATAATATGGAGGCAGAGTTTAATGTAGGTCAAGAGG TTCCAGTCCTTACCTCAACACAAACTACAGCGACAGACAAAGTCTATAACTCGATTTCGCGGCAATCTGTGGGGGTCATG TTGAAGGTCAAGCCACAGATAAATAAAGGTGATTCAGTTCTACTAGAAATTCGGCAAGAGGTATCAAGTGTTGCTGATAG TTCTGATGTTAATGCAAATAATCTAGGTTCGGTCTTTAACAAAAGGGTTGTTAATAATGCTGTATTAGTTAAAAGTGGAG AGACCGTGGTAGTGGGGGGATTACTGGATAAAAAAATAAATAAAATAATCAATAAAGTTCCTTTATTGGGTGATATCCCC TTTATCGGCGGTTTGTTTAGACAGAGCAAAGAAAAGATTGAAAAAAGTAACTTAATTCTATTTATTAGGCCAACAATACT CAGGGAAACAAGTGATTACAGTCAAGTTACAGTAGATAAATATGATGAATATAATAACTCATATTCTATTAATTCCGGTA TGGAAAGACCAATTGATATTGTATCTGATAGAATTAACTATGATGCTTTTAATACACTTAAGAGTGACATAATAAAGTTT TATGAGTTGGTTGAGATGAAAATATGA Protein sequence : MCQNNINILCNSILFLFKIIILAAIFPIVGYGENFSASFRDADIKEFINTVSKNINKTIIIDPKVQGLVSVRSYELLDEE KYYQFFLNVLDVYGYTVVEMPNNILKVIPAKRAKGSVVPLQNNAENPQGDELINRVFKLKHLLAKNLAPLLRQLNDNSES GSIVNYDPSNVILITGRAAVVNRLYAIISTLDQPGETEVELYQLNHAVATDIIKLVNQVINPVNTIAKQGSFNTATVVAD GRTNSVIISGDRHIRKKTLQMIKRLDHQQESYGSTKVVYMKYAQASKLLDVLNGVSQGSQSDKTKKNSGKSHIKNVSIKA YDQTNALVITADPKVMKELDQVIERLDIRRAQVLVEAIIVETQNGEGLNLGIQWANKLYGGTNFLQKTNSIQTNNNSGNP IPMMMAGLTAGFYKGNWDGLFTALATNSNNNILATPSIVTLDNMEAEFNVGQEVPVLTSTQTTATDKVYNSISRQSVGVM LKVKPQINKGDSVLLEIRQEVSSVADSSDVNANNLGSVFNKRVVNNAVLVKSGETVVVGGLLDKKINKIINKVPLLGDIP FIGGLFRQSKEKIEKSNLILFIRPTILRETSDYSQVTVDKYDEYNNSYSINSGMERPIDIVSDRINYDAFNTLKSDIIKF YELVEMKI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| gspD | YP_854407.1 | type II secretion protein GspD | Not tested | PAI I APEC-O1 | Protein | 4e-107 | 41 |
