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Name : Celly_0677 (Celly_0677) Accession : YP_004261382.1 Strain : Cellulophaga lytica DSM 7489 Genome accession: NC_015167 Putative virulence/resistance : Virulence Product : Lysyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG1190 EC number : 6.1.1.6 Position : 768804 - 770495 bp Length : 1692 bp Strand : + Note : COGs: COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II); HAMAP: Lysyl-tRNA synthetase, class II; InterPro IPR002313: IPR004365: IPR004364; KEGG: cat:CA2559_05510 lysyl-tRNA synthetase; PFAM: Aminoacyl-tRNA synthetase, class II (D/K/N); Nucleic acid binding, OB-fol DNA sequence : ATGCAGCTTTCGGAACAAGAAATCATCAGAAGGGAAAAATTAGGCAAGCTAAGAGAAATGGGCATTAACCCATATCCGGC AGATTTATACCCAGTTAACACTACCTCTAAACAAGTTAAAGAAAATTTTGAAGAGGGTAAACAGGTGGTAATTTCTGGTA GATTAATGTCTAGAAGAATACAAGGAAAAGCTTCTTTTGCAGAGTTACAAGATGGTGAAGGCAGAGTACAAGTTTACTTT AACAGAGATGAAATTTGTACAGGTGATGATAAAACTTTGTATAACGATGTTTACAAGAAATTATTAGACATTGGAGACAT TATTGGCATTGAAGGTGATTTGTTTACAACACAAGTTGGCGAAAAAACAGTAATGGTTAAAAAGTTTACAATACTTAGTA AATCTTTACGTCCATTACCGTTACCAAAAGTAGATTCTGAAGGTAAAGTTTTTGACGAATTTAATGACCCAGAGTTACGC TACCGTCGTAGATATGCAGATTTAGTTGTAAATCCGCACGTTAAAGAAGTGTTTGTTAAACGTACCAAGCTTTTTAATGC TATGCGTAGTTTTTTTAACGACGCTGGTTATTTTGAAGTAGAAACTCCTATTTTACAACCTATTCCTGGTGGTGCTGCTG CAAGGCCGTTTATTACTCACCACAATAGTTTAGATATTCCGTTGTATATGAGAATTGCTAACGAGCTTTATTTAAAGCGT TTAATTGTTGGTGGTTTTGATGGAGTTTATGAGTTTTCTAAAAACTTTAGAAACGAAGGAATGGACAAAACACATAACCC AGAGTTTACAGCTATGGAAATTTATGTGTCTTACAAAGATTATAATTGGATGATGGATTTCTGTGAGAAATTATTAGAAC ATTGTGCAATTGCTGTTAACGGTACAAGTGAAGCTACATTTGGTGAGCATAAAATTGATTTTAAAGCTCCTTATGCACGT GTAACTATGGCAGATTCTATTAAACATTTTACTGGTTTTGATATTACTGGTAAAACTGAAGCTGAAATTTTTGAAGCTGC TAAAGGTATGGGGATAGAAGTTGATGCCACAATGGGTAAAGGAAAACTTATTGATGAAATTTTTGGCGAAAAATGTGAGG GCAATTATATACAACCTACATTTATTACAGACTACCCAAAAGAAATGAGTCCGCTTTGTAAAGAGCATAGAGATAACCCA GAACTTACAGAGCGTTTTGAGCTAATGGTTTGTGGTAAAGAAATTGCAAATGCATACTCTGAGCTTAATGACCCAATAGA CCAAAGAGAACGTTTTGAGCACCAATTAAAACTTGCTGCTAAAGGTGATGATGAAGCTACAGAATTTATTGATGAGGACT TTTTACGTGCTTTAGAATACGGTATGCCTCCTACATCTGGTATGGGAATAGGAATGGACAGGTTAATTATGTTTTTAACC AACAACCAATCTATACAAGAAGTATTGTTTTTTCCTCAAATGAAGCCAGAGCGTAAAGCTGTTGCTTTAAGTGATGAAGG AAAAACTGTTTTAGCTCTTTTAAAAAAGGCTGAAAAACTACCTTTGGATGAATTAAAATCTTCATCTGGTTTAAGCAATA AAAAATGGGATAAAACTATTAAAGAATTAACCAAAAATGGTGTTGCTAAAGTGAATAAAACTGATGATGGTTTATTTGTA GAAATAGTATAA Protein sequence : MQLSEQEIIRREKLGKLREMGINPYPADLYPVNTTSKQVKENFEEGKQVVISGRLMSRRIQGKASFAELQDGEGRVQVYF NRDEICTGDDKTLYNDVYKKLLDIGDIIGIEGDLFTTQVGEKTVMVKKFTILSKSLRPLPLPKVDSEGKVFDEFNDPELR YRRRYADLVVNPHVKEVFVKRTKLFNAMRSFFNDAGYFEVETPILQPIPGGAAARPFITHHNSLDIPLYMRIANELYLKR LIVGGFDGVYEFSKNFRNEGMDKTHNPEFTAMEIYVSYKDYNWMMDFCEKLLEHCAIAVNGTSEATFGEHKIDFKAPYAR VTMADSIKHFTGFDITGKTEAEIFEAAKGMGIEVDATMGKGKLIDEIFGEKCEGNYIQPTFITDYPKEMSPLCKEHRDNP ELTERFELMVCGKEIANAYSELNDPIDQRERFEHQLKLAAKGDDEATEFIDEDFLRALEYGMPPTSGMGIGMDRLIMFLT NNQSIQEVLFFPQMKPERKAVALSDEGKTVLALLKKAEKLPLDELKSSSGLSNKKWDKTIKELTKNGVAKVNKTDDGLFV EIV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | CAD66193.1 | putative lysil-tRNA synthetase LysU | Not tested | PAI III 536 | Protein | 1e-86 | 42 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| Celly_0677 | YP_004261382.1 | Lysyl-tRNA synthetase | VFG1668 | Protein | 8e-87 | 42 |
