Name : Celly_2760 (Celly_2760) Accession : YP_004263448.1 Strain : Cellulophaga lytica DSM 7489 Genome accession: NC_015167 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent DNA helicase RecG Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG1200 EC number : - Position : 3166689 - 3168794 bp Length : 2106 bp Strand : - Note : COGs: COG1200 RecG-like helicase; InterProIPR014001: IPR001650: IPR004365: IPR011545: IPR 004609; KEGG: fbc:FB2170_12226 ATP-dependent DNA helicase RecG; PFAM: DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal; Nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase- DNA sequence : ATGAATCCTAATTATTTACAAACTCCTATTGCATATCTAAAAGGTGTTGGGCCAAGTAGAGCTCAAACCTTACAGAGTGA GCTGGGCGTGTATACCTATCAGGATTTACTTAATCTTTTTCCTAACAGGTATTTAGATAAAACCCAATATTACAAAATTA GCCAATTGCAACGCAACAGTGCAGAAGTACAAGTAATTGGAAAAATAATACACTTAAAAGAAGTTGGTCAAAAAAGAGGA AAAAGACTAGTTGCCACTTTTGTAGATGATACAGGTAAAATGGAACTAGTTTGGTTTAGAGGCCAAAAATGGATTAAAGA AAATATTAAACTAAATGTGCCATATGTAATTTATGGCAAAACAAATTGGTTTAATGGTACATTTTCTATGCCTCACCCAG AAATGGAATTATTAGAAGACCATAAAAACGGTTTAAAGGTTAGTATGCAGCCTATATACCCTTCTTCAGAAAAACTAACT AACAAAGGCATTACAAATAAAGTAACAAGCAAACTTTTACAGCAGTTATTTATAGATACTAAAGCTCAATTTGCAGAAAC ATTACCTGTTTATTTACTAAAAGAGTTAAAGTTAATAGGCAAGAGTGATGCGCTACTAAACATACATTTTCCTAAAAGTC AGCAAGATTTAGCAAAAGCACAATTTAGGCTAAAGTTTGAAGAATTGTTTTATATACAATTACAACTTATTGCTAAAAAA ATGGTGCGTAAAAACAAAATTAAAGGCTTTCCTTTTAACGCTGTTGGCACCTATTTTAGTGACTTTTATAATAATTATTT ACCTTTTGAGCTTACCAATGCTCAAAAACGCGTAGTTAAAGAAATTAGGGCAGACTTAGGTAGTAACGCACAAATGAATA GGCTTTTACAAGGAGACGTTGGCTCTGGTAAAACCATTGTGGCATTAATGACAATGTTATTGGCTTTAGACAACGGTTTT CAGGCTTGTTTAATGGCTCCTACCGAAATTTTAGCTACACAACATTACAACGGAATAACAGAATTATTACAAGGCTTAAA AATTAAAGTATCATTACTAACAGGTTCTGTAAAAAAATCTGCCCGAAGAATTATACATGAAGAACTAGAGAGTGGCGAGT TACACATTTTAATTGGCACACACGCACTCTTAGAAGACAAGGTACAATACAAAAATTTAGGGTTAGCTATTATAGATGAG CAACATAGATTTGGAGTAGCACAACGAGCAAAATTATGGCGTAAAAACACAATGCCTCCTCATATTTTGGTAATGACGGC CACACCAATCCCTAGAACATTAGCTATGAGTTTGTATGGTGATTTAGATATTTCTGTAATAGATGAACTACCACCAGGAC GTAAACCAATAAAAACTGTGCATAGGTTTGATGCAAACCGTTTAAAAGTTTTTAGATTTTTAAAAGATGAAATAAATATA GGAAGACAAGTGTATGTGGTATATCCATTAATAAAAGAATCTGAAGCTTTAGATTATAAAGATTTAATGGATGGTTATGA GAGTATTGCTAGAGATTTTCCGGCTCCAAAATACCAAATATCTATTGTACACGGGCAAATGAAACCAGATGATAAAGAGT TTGAAATGCAACGCTTTATTAAAGGAGAAACTCAAATTATGGTTGCCACTACTGTTATAGAGGTTGGTGTAAATGTACCT AATGCATCTGTAATGATTATAGAAAGCGCAGAGCGTTTTGGCTTATCTCAATTACACCAATTGCGTGGTAGAGTTGGTAG AGGTGCAGACCAAAGTTATTGTATTTTAATGACTGGTCACAAATTATCTGAAGACGCAAAAACAAGACTAGAAACTATGG TACGTACCAATGATGGTTTTGAAATTGCAGAAGTAGATTTAAAACTACGTGGTCCTGGAGATATTATGGGCACACAACAA AGTGGAGTTTTAAATCTTAAAATAGCAGATATTGTAAAAGACAACGACATTTTACAAACGGCTAGGCATTATGCTATTAA AATTTTAAAAGAAGACCCTAGTCTTAGCCACCCCAATAATAACGTGGTTTCACAAGCTTACGCGCAACTTGTAAAGCATA AAAACATATGGACCTACATAAGTTGA Protein sequence : MNPNYLQTPIAYLKGVGPSRAQTLQSELGVYTYQDLLNLFPNRYLDKTQYYKISQLQRNSAEVQVIGKIIHLKEVGQKRG KRLVATFVDDTGKMELVWFRGQKWIKENIKLNVPYVIYGKTNWFNGTFSMPHPEMELLEDHKNGLKVSMQPIYPSSEKLT NKGITNKVTSKLLQQLFIDTKAQFAETLPVYLLKELKLIGKSDALLNIHFPKSQQDLAKAQFRLKFEELFYIQLQLIAKK MVRKNKIKGFPFNAVGTYFSDFYNNYLPFELTNAQKRVVKEIRADLGSNAQMNRLLQGDVGSGKTIVALMTMLLALDNGF QACLMAPTEILATQHYNGITELLQGLKIKVSLLTGSVKKSARRIIHEELESGELHILIGTHALLEDKVQYKNLGLAIIDE QHRFGVAQRAKLWRKNTMPPHILVMTATPIPRTLAMSLYGDLDISVIDELPPGRKPIKTVHRFDANRLKVFRFLKDEINI GRQVYVVYPLIKESEALDYKDLMDGYESIARDFPAPKYQISIVHGQMKPDDKEFEMQRFIKGETQIMVATTVIEVGVNVP NASVMIIESAERFGLSQLHQLRGRVGRGADQSYCILMTGHKLSEDAKTRLETMVRTNDGFEIAEVDLKLRGPGDIMGTQQ SGVLNLKIADIVKDNDILQTARHYAIKILKEDPSLSHPNNNVVSQAYAQLVKHKNIWTYIS |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 2e-96 | 42 |