Gene Information

Name : Celly_2652 (Celly_2652)
Accession : YP_004263340.1
Strain : Cellulophaga lytica DSM 7489
Genome accession: NC_015167
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : ATP-dependent chaperone ClpB
Function : -
COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones
COG ID : COG0542
EC number : -
Position : 3039590 - 3042178 bp
Length : 2589 bp
Strand : -
Note : COGs: COG0542 ATPase with chaperone activity ATP-binding subunit; InterProIPR017730: IPR004176: IPR003959: IPR013093: IPR 019489: IPR003593; KEGG: fbc:FB2170_13261 heat shock ClpB protein; PFAM: ATPase, AAA-2; ATPase, AAA-type, core; Clp, N-terminal; Clp

DNA sequence :
ATGAACATTAATAATTTCACAATAAAATCTCAAGAGTCCTTGCAGCAAGCCCAACTGCTAGCTCAGGAGCTTGGCAATCA
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AAACACTTGCTTCCTACTTGTTTGATGATGAAAATGCTTTAACCAGAATTGATATGAGTGAGTACCAAGAACGCCACTCT
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GAGGCTGTTGGCTTTTTAGCATTAAAAGGCTATGATCCGCAATATGGTGCAAGACCTGTAAAACGTATAATACAAAAAGA
AGTACTTAATAATTTATCTAAAGAAATATTATCTGGCAATATTACCACAGATAGCATTGTTTTAATAGATAGTTTTGATG
ATAAATTGGTATTTAGAAACAATAATTAA

Protein sequence :
MNINNFTIKSQESLQQAQLLAQELGNQQIENEHLFKALIKVDENVMPFILKKLNVNVALLTQIVDKELQSLPKVTGADIM
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EAVGFLALKGYDPQYGARPVKRIIQKEVLNNLSKEILSGNITTDSIVLIDSFDDKLVFRNNN

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
aec27 YP_851418.1 ATPase Not tested PAI II APEC-O1 Protein 5e-102 41
aec27 AAQ96721.1 Aec27 Not tested AGI-1 Protein 3e-102 41

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
Celly_2652 YP_004263340.1 ATP-dependent chaperone ClpB VFG2084 Protein 3e-110 41