Name : Celly_2652 (Celly_2652) Accession : YP_004263340.1 Strain : Cellulophaga lytica DSM 7489 Genome accession: NC_015167 Putative virulence/resistance : Virulence Product : ATP-dependent chaperone ClpB Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG0542 EC number : - Position : 3039590 - 3042178 bp Length : 2589 bp Strand : - Note : COGs: COG0542 ATPase with chaperone activity ATP-binding subunit; InterProIPR017730: IPR004176: IPR003959: IPR013093: IPR 019489: IPR003593; KEGG: fbc:FB2170_13261 heat shock ClpB protein; PFAM: ATPase, AAA-2; ATPase, AAA-type, core; Clp, N-terminal; Clp DNA sequence : ATGAACATTAATAATTTCACAATAAAATCTCAAGAGTCCTTGCAGCAAGCCCAACTGCTAGCTCAGGAGCTTGGCAATCA ACAAATAGAAAACGAACATTTATTTAAAGCATTAATTAAAGTAGATGAAAATGTAATGCCTTTTATATTAAAAAAGCTAA ATGTAAATGTTGCGTTATTAACACAAATTGTAGACAAAGAATTGCAAAGTTTACCAAAAGTAACAGGCGCAGATATAATG ATGTCTCGTGAAGCAGGTAAAACAGTTAACGAAGCTATAATAGTAGCTAAAAAAATGAATGATGAATACGTGTCTACAGA ACATTTGTTATTGGCTATTTTTAAATCTAAAAGTAAAATTTCTCAGATCTTAAAAGATCAAGGGGTAACAGAAAAAGATT TAAACGCAGCTATAGCAGAGTTAAGAAACGGTAACAATGTTACATCACAAAGTGCAGAAGAAAATTACAATTCACTTGAA AAATATGCTAAAAATTTAAACAGATTAGCAGATGAAGGCAAACTAGACCCTGTAATTGGGAGAGATGAAGAAATACGAAG AGTTTTGCAAATTTTATCTCGTAGAACAAAAAACAATCCAATGTTAGTTGGTGAGCCTGGTGTAGGTAAAACAGCAATTG CAGAAGGTATTGCACACCGTATTATTCAAGGAGATATTCCTGAAAACTTAAAAGGTAAAATTATATACTCATTAGATATG GGTGCCTTAATTGCTGGTGCAAAATATAAAGGTGAATTTGAAGAACGTTTAAAGTCGGTTATTAAAGAAGTAACCTCTGC AGATGGCGAAATTGTATTATTTATTGACGAAATACATACACTAGTTGGTGCTGGTGGCGGAGATGGTGCTATGGATGCAG CAAACATACTTAAACCTGCATTAGCACGTGGAGAATTACGTGCTATAGGTGCTACAACTTTAGACGAATACCAAAAGTAT TTTGAGAAAGACAAGGCCTTAGAGCGTAGATTTCAAAAAGTAATAGTAGATGAACCAAGTACAGAAAGTTCTATTTCTAT ATTAAGAGGAATAAAAGAAAAATACGAAGCACACCACAAAGTACGCATTAAGGATGAAGCTGTTATTGGTGCCGTAGAAT TATCGCAACGCTATATAACAAACAGATTTTTACCGGATAAGGCTATTGACTTAATGGATGAAGCTGCTGCAAAATTACGT ATGGAAATTAATTCTAAGCCAGAAGAATTAGACGTTCTTGACCGTAAAATAATGCAATTAGAAATTGAAATTGAAGCTAT TAAAAGAGAAAATGATAAGGATAAGCTAAAAATTTTAAACGTAGATCTTGCTAATATTAAAGAAGAACGTAATGAAATTT TTGCAAAATGGGATAGTGAAAAAACAGTTGTAGATAATATACAACAAGTAAAACAAGATATAGAAAATTATAAGTTAGAG GCAGAACGCGCAGAACGTAACGGTGATTATGGTAAAGTTGCTGAAATTAGATACGGTAAAATTAAAGAAGCCCAAGAAGC ATTAGAAAAACTACAAAACACACTTGCAGAGCAACAAAGTAATGGTACTTTAATACAAGAAGAAGTTACCTATGAAGACA TTGCAGATGTTGTTGCTAAATGGACCGGTATACCGGTAACAAAAATGCTACAAAGTGAAAGAGAAAAACTATTAGACTTA GAGTCTGTATTACACAAGCGTGTAGTAGGGCAAGAAGAAGCTATAGAGGCTGTAGCTAATGCTATTAGAAGAAGTAGATC TGGTTTACAAGATGCTAAGCGTCCAATAGGCTCATTCTTATTTTTAGGAACAACAGGTGTAGGTAAAACAGAACTTGCTA AAACACTTGCTTCCTACTTGTTTGATGATGAAAATGCTTTAACCAGAATTGATATGAGTGAGTACCAAGAACGCCACTCT GTAAGCAGATTGGTTGGTGCACCTCCTGGGTATGTTGGTTATGATGAAGGCGGACAATTAACAGAAGCTGTAAGACGTAG ACCTTACTCTGTTATTTTATTAGATGAAATTGAAAAGGCACATCCAGATACTTTTAATATTTTACTACAGGTTTTAGATG AAGGTAGATTAACAGACAACAAGGGTCGTGTTGCAGATTTTAAAAACACCATTATTATTATGACAAGTAATATGGGAAGC AGTATAATACAAGAAAGTTTTAACACACATAAAGATGCTACAATAGCTACTGAAGCAGCTAAAACAGATGTATTAGGCTT GCTAAAAGCAAGTATTAGACCAGAGTTTTTAAACAGAATTGATGACATTGTTATGTTTACACCGTTATCTAAGGATAACA TTAAAAAAATTGTACGTTTACAATTAAACGCGCTTAAAAAACTTGTTGCCGAGCAAAATATTACAATAGATGCTACAGAT GAGGCTGTTGGCTTTTTAGCATTAAAAGGCTATGATCCGCAATATGGTGCAAGACCTGTAAAACGTATAATACAAAAAGA AGTACTTAATAATTTATCTAAAGAAATATTATCTGGCAATATTACCACAGATAGCATTGTTTTAATAGATAGTTTTGATG ATAAATTGGTATTTAGAAACAATAATTAA Protein sequence : MNINNFTIKSQESLQQAQLLAQELGNQQIENEHLFKALIKVDENVMPFILKKLNVNVALLTQIVDKELQSLPKVTGADIM MSREAGKTVNEAIIVAKKMNDEYVSTEHLLLAIFKSKSKISQILKDQGVTEKDLNAAIAELRNGNNVTSQSAEENYNSLE KYAKNLNRLADEGKLDPVIGRDEEIRRVLQILSRRTKNNPMLVGEPGVGKTAIAEGIAHRIIQGDIPENLKGKIIYSLDM GALIAGAKYKGEFEERLKSVIKEVTSADGEIVLFIDEIHTLVGAGGGDGAMDAANILKPALARGELRAIGATTLDEYQKY FEKDKALERRFQKVIVDEPSTESSISILRGIKEKYEAHHKVRIKDEAVIGAVELSQRYITNRFLPDKAIDLMDEAAAKLR MEINSKPEELDVLDRKIMQLEIEIEAIKRENDKDKLKILNVDLANIKEERNEIFAKWDSEKTVVDNIQQVKQDIENYKLE AERAERNGDYGKVAEIRYGKIKEAQEALEKLQNTLAEQQSNGTLIQEEVTYEDIADVVAKWTGIPVTKMLQSEREKLLDL ESVLHKRVVGQEEAIEAVANAIRRSRSGLQDAKRPIGSFLFLGTTGVGKTELAKTLASYLFDDENALTRIDMSEYQERHS VSRLVGAPPGYVGYDEGGQLTEAVRRRPYSVILLDEIEKAHPDTFNILLQVLDEGRLTDNKGRVADFKNTIIIMTSNMGS SIIQESFNTHKDATIATEAAKTDVLGLLKASIRPEFLNRIDDIVMFTPLSKDNIKKIVRLQLNALKKLVAEQNITIDATD EAVGFLALKGYDPQYGARPVKRIIQKEVLNNLSKEILSGNITTDSIVLIDSFDDKLVFRNNN |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
aec27 | YP_851418.1 | ATPase | Not tested | PAI II APEC-O1 | Protein | 5e-102 | 41 |
aec27 | AAQ96721.1 | Aec27 | Not tested | AGI-1 | Protein | 3e-102 | 41 |
Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
Celly_2652 | YP_004263340.1 | ATP-dependent chaperone ClpB | VFG2084 | Protein | 3e-110 | 41 |