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Name : Celly_2642 (Celly_2642) Accession : YP_004263330.1 Strain : Cellulophaga lytica DSM 7489 Genome accession: NC_015167 Putative virulence/resistance : Virulence Product : polysaccharide biosynthesis protein CapD Function : - COG functional category : M : Cell wall/membrane/envelope biogenesis COG ID : COG1086 EC number : - Position : 3029642 - 3031573 bp Length : 1932 bp Strand : + Note : COGs: COG1086 nucleoside-diphosphate sugar epimerase; InterPro IPR003869; KEGG: rbi:RB2501_13474 capsular polysaccharide biosynthesis protein; PFAM: Polysaccharide biosynthesis protein CapD-like; SPTR: capsular polysaccharide biosynthesis protein; PFAM: P DNA sequence : ATGATTAAGAATTACTTAAATAATAATGTTACTAGATATGCCTCAAAATGGCTAGTTCTAGCAATTGATATTGTAATTAT GGTAGTTGCTTTTATTCTATCATATTTAATAAGATATAACTTAACATTAGAATTTGATGTGGCTCAGTTGCCATATCAAA TTCCGATTGTAGCAGTGGTTGCAGCATTAGCTTTTTTAATTACAGGATCTTATAAGGGGGTTGTTAGACATACAGGTGTT AAGGATGTCTATAATATTTTTAATGCAATATGTTTATCTAGTATACTAATGATTTTAATGGTTTTGGCAAACAAAAAACT AGATTTGTTTAGCTGGACAACCATACCATTACAAATTATTATAGTACACAGTTTAATTGCTTTTTTAGCATTATCTGCAT CTAGATACCTTTTTAAGTCTTTATACAATAGTATTGTAAATAAGAGCTTGCACAACACAAAAAGAGTTTTAATATATGGA GCTGGTGAATCTGGTATTATTACGCACAGTGCTATTACAAACCACTCTAAATCTAATGTTAAGGTTGTAGGTTATGTAGA TAATAATAGTAAAAAGGTTGGTAAAAGTATAAACGGAGTTAATGTTTATGCTAAAGATGATTTAAACGAAGAATTTTTAG TAAATAATGGTATTTCTGAAGTTATTTTTTCAATTCAGAATATTAATCCAACTGCACTTAGGGAGCTTGTAGAAAGTATG GTTGACTTTCCTGTAAAAGTTAAAATTGTACCACCTGTAGAAGATTGGATAAACGGTGAACTTAAATTCTCACAAATAAA GCAAGTTCAAATTGAAGATTTACTAGATAGAGCACCAATTAACATTGAAAACTCTAAAATATCTGGTGAATTAAAAGACA AAGTGGTAGTTGTAACCGGAGGGGCTGGATCTATAGGGAGTGAGTTAGTAAGGCAAATATGTAAATACAATTACAAATCA TTAATAGTTATAGACCAGGCAGAGTCTGCACTTTATGATTTACAGCAAGAATTAAAACAAAATGGATATCATAATTTTTT TCCAATAGTAGGTGATATTAGGGATAAAAACAGGTTGAATTATCTTTTTAATGAGTATAAGCCTAATATTGTGTTTCATG CTGCTGCTTATAAACATGTTCCTTTAATGGAGTATAATTCTTATGAAGCTATAAAAATTAATGTTGCAGGAACCAAAGTT CTTGCAGATTTATCTATACAGCACAATGTTGATAAGTTTGTGTTTGTTTCTACAGATAAGGCTGTTAACCCTACAAATGT TATGGGTGGTACTAAACGTATAGCAGAGATGTATATTAGTTGTATGCAGCAAGAAAACAAAACAAAGTTTATTACTACAA GGTTTGGAAATGTTTTGGGGTCTAACGGTTCTGTAATTCCACTATTTAAAAAACAAATTGATAAAGGAGGGCCTTTAACA GTAACTCATAAAGATGTGACTCGTTTTTTTATGACAATTCCAGAAGCGTCTCAATTAGTTTTAGAGGCTGGAGCAATGGG AGAAGGAGGAGAGATTTTTATATTTGATATGGGGAAATCTGTTAAGATATTTGATCTTGCTAAAAATATGATTAAACTTT GTGGTTTAAAATATCCTGAAGAAATGGATATTAAAATCACAGGTTTAAGACCAGGAGAAAAGTTATATGAGGAGCTTTTA GCTAATGGAGAAAATACAATGCCTACATATCATAAAAAAATTATGATTAGCAAAGTAAGAGAGTTAGATTATGTTAAAAC TCGCTCATTGATAGATGAGTTGTGTGTAAATAATATGTTTTTTAAATCTAATACCATAAGCTTAATGAAGGATATTGTTC CTGAATTTATTTCTAGTAATTCAGATTTATGCAAAATAGATATTGAAAAACAAAAAGAGGAAGAAAAAAATATACTAACA AACATTAACTAA Protein sequence : MIKNYLNNNVTRYASKWLVLAIDIVIMVVAFILSYLIRYNLTLEFDVAQLPYQIPIVAVVAALAFLITGSYKGVVRHTGV KDVYNIFNAICLSSILMILMVLANKKLDLFSWTTIPLQIIIVHSLIAFLALSASRYLFKSLYNSIVNKSLHNTKRVLIYG AGESGIITHSAITNHSKSNVKVVGYVDNNSKKVGKSINGVNVYAKDDLNEEFLVNNGISEVIFSIQNINPTALRELVESM VDFPVKVKIVPPVEDWINGELKFSQIKQVQIEDLLDRAPINIENSKISGELKDKVVVVTGGAGSIGSELVRQICKYNYKS LIVIDQAESALYDLQQELKQNGYHNFFPIVGDIRDKNRLNYLFNEYKPNIVFHAAAYKHVPLMEYNSYEAIKINVAGTKV LADLSIQHNVDKFVFVSTDKAVNPTNVMGGTKRIAEMYISCMQQENKTKFITTRFGNVLGSNGSVIPLFKKQIDKGGPLT VTHKDVTRFFMTIPEASQLVLEAGAMGEGGEIFIFDMGKSVKIFDLAKNMIKLCGLKYPEEMDIKITGLRPGEKLYEELL ANGENTMPTYHKKIMISKVRELDYVKTRSLIDELCVNNMFFKSNTISLMKDIVPEFISSNSDLCKIDIEKQKEEEKNILT NIN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cap1D | AAA64643.1 | type 1 capsule synthesis gene | Virulence | SCCcap1 | Protein | 2e-84 | 42 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| Celly_2642 | YP_004263330.1 | polysaccharide biosynthesis protein CapD | VFG1300 | Protein | 2e-80 | 42 |
