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Name : Celal_3148 (Celal_3148) Accession : YP_004165920.1 Strain : Cellulophaga algicola DSM 14237 Genome accession: NC_014934 Putative virulence/resistance : Unknown Product : polysaccharide biosynthesis protein capd Function : - COG functional category : M : Cell wall/membrane/envelope biogenesis COG ID : COG1086 EC number : - Position : 3613422 - 3615374 bp Length : 1953 bp Strand : + Note : COGs: COG1086 nucleoside-diphosphate sugar epimerase; InterPro IPR003869; KEGG: rbi:RB2501_13474 capsular polysaccharide biosynthesis protein; PFAM: Polysaccharide biosynthesis protein CapD-like; SPTR: capsular polysaccharide biosynthesis protein; PFAM: P DNA sequence : ATGATTCAAAATTATTTAAATGCAACCGCAAGTAGATACGCCTCTAAATGGCTGGTACTTATAGTTGATGTTATTTTAGT ATCCTTTTCCTTTGTATTGGCTTATTTTATCTTATTCAATTTAACGATGAATTTTGATATTCATAAGTTATTTGTGCAAT TGCCTTTTGTGGCTCTTATTTCTTTAGTATCCTTTTTAATTATTGGGTCTTATAAAGGGGTAGTGCGCCATACCGGTGTC AGAGATGTGTATAACATCTTTAATGCCATTTGTTTGTCGAGTATTATTACCATTGTTATTGTCGTAGCCAATAGAGCATA TAATTTTTTTGATGGCTTTACGGTTCCTTTAACCATCATTATTATTCATAGCTTATTAAGTTTTATAGCCTTAACAGCAT CTCGTTATGTGTTTAAAGCCTTGTACTTTAATATTGTAATGAATAATTACAATTCAGCTTCAAAAAATGTGTTGATCTAT GGTGCTGGAGAATCTGGAATTTTAACCCATAGCGCATTGACAAATGCGTCTAAAAGTAAAGTAAAGGTTGTTGGGTATAT TGATAAGGATCAACAAAAAGTTGGAAAGCACATAAACGGCGTTAAAGTATATCATAATGATGCGCTAACCGAAAGTTTTA TCTTGAAAAAGGATATTTCAGAAGTTATTTTTTCAATCCAAAACATAGATCATAAAAAGTTACGTGTTTTAGTAGAAAGT CTGGTAGACTATCCTGTATTAGTTAAAATTGTTCCTGCGGTTGAAGATTGGATCAATGGAGAATTAAAACTGTCTCAGAT TAAACAAGTACAGATTGAAGATCTACTGGATAGAGCAACTATTGATATTAAAAACTCCAATATTGCCGAAGAATTAAAAA ATAAAACGGTTTTAGTTACGGGTGGTGCAGGATCTATTGGAAGTGAAATTGTAAGACAAGTATGTACCTATGGTTATAAA TCTTTAATTGTAATAGACCAAGCAGAATCTGCACTATATGATTTGCAGCAAGAATTAAAGCAAAATGGCTTTCATAATTT TATTCCTATTGTAGCAGATGTAAGAGATAAGAATAGAATGAATATTGTTTTTCAGGAGTATGCTCCGAATATTGTTTTTC ATGCAGCAGCTTATAAGCATGTTCCTTTAATGGAATACAATTCTTATGAAGCTATAAAAATTAATGTAGCCGGAACCAAA GTGTTGTGTGATTTGTCTGCGCATTACAATGTAGATAAATTTGTATTTGTTTCTACAGACAAAGCCGTTAACCCAACAAA TGTAATGGGAGCAACAAAGCGAATTGCAGAGATGTATATTAGCTGTATGCAACAATTAAAGAAAACGAAATTTATTACCA CCCGTTTTGGAAATGTATTGGGCTCTAATGGTTCTGTAATTCCGTTGTTTAAAAAACAAATAGAAAAAGGCGGACCTTTG ACCGTTACCCATGAAGATGTAACACGTTTTTTTATGACGATTCCGGAAGCCTCACAATTGGTGTTGGAAGCAGGAGCAAT GGGAGAAGGTGGTGAGATTTTTATATTTGATATGGGAGAATCTGTTAAAATATTTGACCTAGCCAAGAATATGATTAAAC TTTCTGGTTTAAAATATCCAGAAGATATTGATATTAAAGTTACGGGATTACGACCAGGGGAAAAATTGTATGAAGAACTT TTGGCTAATGGTGAAAATATTTTACCTACCTACCACAAGAAGATTATGATTAGTAAGGTTCGGGAGTTAGACTATACCAC CATCCGTTCTAATATTAACCAACTTTGTGTGTCAAATATGTTTTTTGATGCTGATGTGGTGCGCTTAATGAAAGAGATTG TGCCTGAATATATCTCAAAAAATTCTGACCTTTGTAAAATAGATGATCAGATTGAAGAGAAGACTAAAAAAAATGATGCG TCTAGCTTAGAAAAAAATATTTTGCAATCATAA Protein sequence : MIQNYLNATASRYASKWLVLIVDVILVSFSFVLAYFILFNLTMNFDIHKLFVQLPFVALISLVSFLIIGSYKGVVRHTGV RDVYNIFNAICLSSIITIVIVVANRAYNFFDGFTVPLTIIIIHSLLSFIALTASRYVFKALYFNIVMNNYNSASKNVLIY GAGESGILTHSALTNASKSKVKVVGYIDKDQQKVGKHINGVKVYHNDALTESFILKKDISEVIFSIQNIDHKKLRVLVES LVDYPVLVKIVPAVEDWINGELKLSQIKQVQIEDLLDRATIDIKNSNIAEELKNKTVLVTGGAGSIGSEIVRQVCTYGYK SLIVIDQAESALYDLQQELKQNGFHNFIPIVADVRDKNRMNIVFQEYAPNIVFHAAAYKHVPLMEYNSYEAIKINVAGTK VLCDLSAHYNVDKFVFVSTDKAVNPTNVMGATKRIAEMYISCMQQLKKTKFITTRFGNVLGSNGSVIPLFKKQIEKGGPL TVTHEDVTRFFMTIPEASQLVLEAGAMGEGGEIFIFDMGESVKIFDLAKNMIKLSGLKYPEDIDIKVTGLRPGEKLYEEL LANGENILPTYHKKIMISKVRELDYTTIRSNINQLCVSNMFFDADVVRLMKEIVPEYISKNSDLCKIDDQIEEKTKKNDA SSLEKNILQS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SSP0063 | YP_300153.1 | capsular polysaccharide biosynthesis protein | Not tested | SCC15305cap | Protein | 3e-82 | 42 |
