|
Name : serS (BVAF_387) Accession : YP_004124454.1 Strain : Candidatus Blochmannia vafer BVAF Genome accession: NC_014909 Putative virulence/resistance : Unknown Product : seryl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG0172 EC number : - Position : 432784 - 434097 bp Length : 1314 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGTTAGATCCTAAACTATTATATAATAATACAGATTGGGTTTATAAAAGATTAGCTCGTAAGCAATTTTTATTAAATAC AAGTGAATTAAGACAACAAAATAATTTACGTAAGGTTTTGCAAAAAAAAATAGAAAAAATACAATCTGATAAAAAATCTA TTTCTAAAATTATTGGGAAAATTAAATCTCAACAGGAAGATATTCAATCTTTGTGTAAACAAGCTAATTTATTGAATGAT CAGCTAACCTCAATTAAATTCAAAATTAAGGTTTTGCAAAAAAAAATAAAACAATATCAATTATCCTTACCTAATATCCC TGATGATAATATTCCTAATGGCACTACAGAGCAGGATAATGTGGAGATTATGCGTTGGGGGAATTTAAATAGATACGATG ATTTTAAGCCAATTGATCATGTAACATTAGGTAAATTAATAGGGGAAATAGATTTATCGAGTGCATCAAAAATTGCTGGC AGTCGTTTTATTGTGTTAAAAGGAAAAATAGCCCGTTTATATAGGGCATTATCTCAATTTATGATGGATACACATATTAA AAATCACGGATATCAAGAATATTATGTACCTTATTTAGTAAATACAGATTCGTTATATGGAGCAGGTCAATTGCCTAAAT TTTATAAAGATTTGTTTCATACTCAGTCTATCGTTGATATCAATTGTAGTAAAATCAAAAATAAATCATATACATTAATA CCGACAGGAGAAGTACCGTTGATTAATTTAATGAGAGACATCATTGTTAATGAAGATGAATTACCTATTAAAATGGTGGC TCATACTCCATGTTTTCGATTGGAAGCCGGCACATACGGTTATCGTACACATGGATTAATTCGAACTCATCAATTTGATA AGGTTGAATTAGTGCAAATGGTTCATCCAAATAAATCTACTCAGGCATTAGAAGAAATAACTAATCATTCAGAACAAGTA TTACAATTACTTGAATTACCGTATAGAAAAACGTTATTATGTGCAGGAAATATTAGTTTTTCTTCATGTAAAACGTATGA CTTAGAAGTTTGGTTACCTACTCATAATTCTTATTGTGAAATCGCTTCTTGTTCAAATGTAAAAGATTTTCAAGCACGCC GTATAAAAGCTCGTTTTAGAAATAAAATTTATAAAAAAACAATGTTATTACATACATTAAATGCATCTGGATTGGCTGTA GGTAGAACATTAGTAGCAATTCTAGAGAATTGTCAATTACAAAAAGATAGATGCATTAAAATACCTAAGGTATTACATTC ATATATGCATGGCATTACTCATATTCATTATTAA Protein sequence : MLDPKLLYNNTDWVYKRLARKQFLLNTSELRQQNNLRKVLQKKIEKIQSDKKSISKIIGKIKSQQEDIQSLCKQANLLND QLTSIKFKIKVLQKKIKQYQLSLPNIPDDNIPNGTTEQDNVEIMRWGNLNRYDDFKPIDHVTLGKLIGEIDLSSASKIAG SRFIVLKGKIARLYRALSQFMMDTHIKNHGYQEYYVPYLVNTDSLYGAGQLPKFYKDLFHTQSIVDINCSKIKNKSYTLI PTGEVPLINLMRDIIVNEDELPIKMVAHTPCFRLEAGTYGYRTHGLIRTHQFDKVELVQMVHPNKSTQALEEITNHSEQV LQLLELPYRKTLLCAGNISFSSCKTYDLEVWLPTHNSYCEIASCSNVKDFQARRIKARFRNKIYKKTMLLHTLNASGLAV GRTLVAILENCQLQKDRCIKIPKVLHSYMHGITHIHY |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| serS | YP_003446791.1 | seryl-tRNA synthetase | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 2e-73 | 50 |
