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Name : lysS (BVAF_265) Accession : YP_004124337.1 Strain : Candidatus Blochmannia vafer BVAF Genome accession: NC_014909 Putative virulence/resistance : Virulence Product : lysyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG1190 EC number : - Position : 288785 - 290332 bp Length : 1548 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTCTAAATATATTGATTTAAAAAAAAGTTTGAATCGAGAAGAATTAAATATTAATTATGATGAATTAAAAATTCGTCA AAAAAAATTGTTGAAAATACGAAAATTAGGGATTGCATTTCCTAACAAATTTCGGCGTAATTATACTTCTTCTCAATTAC ACAAGGAATTTTCTTATAAAACCCATGAAGATTTAGTTGCGCTTAATATTCAAGTTAATATTTCAGGACGTATAATGACT CGACGAATTATGGGGAAAGCGTCTTTTATTGTATTAAAAGATGGAGAGGGTTCTATTCAATTATATATTACTATTAATTC ATTGTTATCTAAACAAATATATGTCAATCATCTGAAACAGTTAGATTTAGGAGATATAATTGGAGCACAAGGTATTTTAT TTAAAACTCGTACTGGAGAATTATCTATACGTTGTTATAATGTTATGTTGCTTTCTAAATCTTTACGTCCGTTGCCAAGT AAATTTTATGGGTTAAATAATTCAGAAAAAAAATACCGACAAAGATATTTAGATTTAATAGTGAATGATAAGTCTAGTAA AATTTTCAAAAAACGTTCTTTGATTATATATAAAATACGTCAATTTATGAAGAAATATGATTTTATAGAGGTAGAAACTC CAATAATGCATACAATTCCAGGAGGTGCTATAGCTCGTCCTTTTGTTACTTACCATAATAAATTAGGAATGCATATGTAT CTTCGTATTGCGCCGGAATTATATTTGAAAAAATTAATAATAGGTGGATTTGAACGAATATTTGAAATAAATCGTAATTT TCGTAACGAAAGTATATCTCCATATCATAATCCGGAGTTTACTATGATGGAGGTGTATATAGCTTATTCTGATTACAAAG ATATGATATCTTTTACTCAAAAGTTATTATCAAAATTAGCAGAACAAATTTTTAAAAGTAATACTATTCAGTATGGTGAA TATTGTTTAAATTTTAAAGAACCTTTTACAAAAATGAGTGTAAAAGAAGCTATTATATATTATTTACCAGAGGTAAAATT AAATAATATAAATGATATGTCAATTATTGTTGATATTTTGAAAAAATTTGAAATTCAATTTAATAAAAAATGGTCTTTAG AGAAGTTACATATGCTCTTATTTGAAGAGATAATAACTAAAAAAATTATTCAACCAACTTTTATTACGCATTATCCAACA GAATTATCACCACTAGCGCGATGCAATGATAATGATTCAAAACTTGCTGATCGTTTTGAACTATTTATTGCTGGATTTGA AATAGGTAATGGCTTTTCAGAATTGAATGATCCAGACGATCAAAGAGATAGATTTTTAAAACAAATACAAGAAAAAAGAA TGAATAGTAAAAATACGGATAATACAGATATTGTTCATTGTTATGATGAAGATTATTTAACCGCATTAGAATATGGCTTA CCTCCTACCTCAGGAATAGGAATAGGTATTGATCGGTTAGTTATGTTGTTGACTAATCAACATAATATTCGTGATGTGAT TTTATTTCCTACTTTGCGTCCAAAATAG Protein sequence : MSKYIDLKKSLNREELNINYDELKIRQKKLLKIRKLGIAFPNKFRRNYTSSQLHKEFSYKTHEDLVALNIQVNISGRIMT RRIMGKASFIVLKDGEGSIQLYITINSLLSKQIYVNHLKQLDLGDIIGAQGILFKTRTGELSIRCYNVMLLSKSLRPLPS KFYGLNNSEKKYRQRYLDLIVNDKSSKIFKKRSLIIYKIRQFMKKYDFIEVETPIMHTIPGGAIARPFVTYHNKLGMHMY LRIAPELYLKKLIIGGFERIFEINRNFRNESISPYHNPEFTMMEVYIAYSDYKDMISFTQKLLSKLAEQIFKSNTIQYGE YCLNFKEPFTKMSVKEAIIYYLPEVKLNNINDMSIIVDILKKFEIQFNKKWSLEKLHMLLFEEIITKKIIQPTFITHYPT ELSPLARCNDNDSKLADRFELFIAGFEIGNGFSELNDPDDQRDRFLKQIQEKRMNSKNTDNTDIVHCYDEDYLTALEYGL PPTSGIGIGIDRLVMLLTNQHNIRDVILFPTLRPK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | CAD66193.1 | putative lysil-tRNA synthetase LysU | Not tested | PAI III 536 | Protein | 3e-121 | 52 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| lysS | YP_004124337.1 | lysyl-tRNA synthetase | VFG1668 | Protein | 2e-121 | 52 |
