Gene Information

Name : ribD (BVAF_235)
Accession : YP_004124307.1
Strain : Candidatus Blochmannia vafer BVAF
Genome accession: NC_014909
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : riboflavin biosynthesis protein RibD
Function : -
COG functional category : H : Coenzyme transport and metabolism
COG ID : COG0117
EC number : -
Position : 255806 - 256957 bp
Length : 1152 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGATAAAGAATGTTATTCCTGAAGATATAGGTTATTTATCCAGAGCATTTCAATTAGCTCGAAAAGGTCGATTTACGAC
GATGCCTAATCCTAATGTAGGGTGTGTTATTGTAAAAGATAATCATGTTATAGGAGAAGGGTATCATATGCGTGCTGGGG
AAAATCATGCTGAAATAAACGCATTAAGTGTTGCTGGAAATTTTGCGAAAGGTGCTACTGCATATGTTACATTAGAACCA
TGTAGTCATTATGGCCGTACCCCTCCTTGTACTACAGCTTTAATTAAATCGGGAATTAAACGTGTTGTTGTATCTATGTT
AGATCCTCATCCTGATTTAACGGGTCGTGGAATACAATTATTAAAGCAATCAGGTATTTTAGTGAGTCACAGTATTATGT
TATCAGAAGCTGAGTCGATCAACAAGGGTTTTATTAAACGCATACGCACAGGAATGCCTTGGATTAAACTAAAATTAGCT
TCATCCTTAGATGGTCGGGTTGCTATGTCTTCTGGGGAAAGCAAATGGATTACTTCTGTGCAATCACGACAAGATGTACA
ATGTTTTAGGGCAGAAAGTGACGTAATTCTTTCTACTGCTTCAACTGTACTAATGGATAATCCTAGGTTAAATGTACGAT
GGTCATGTTTTTCAAAAGAAATGAAAAATATATATATTAATGGTAATCAAATTAGACATCCACTACGGGTTATTATAGAT
AGTACTAATCGTATTTTACCGACTCATCGTTTTATACAAAATGAGGGAGGGGTCATTTTAGTTCGAATAAAGAAAGATAA
TTTGAATTGGCCTAAATCAGTAGAACAATTATTAGTTTCCCCAATCGTTAATAAGTCTGGATTAAATCAGATTAATTTGA
AAAAATTGATGCAGTACTTAGCGTGTTATTTAAAAATCAATAGTGTGTGGGTAGAATCTGGGCCAACTCTTTCTGGAGCG
TTATTAGATATAGGATTAGTAGATGAAGTAATTTTATATCAAGCTATAAAGTTTTTAGGGTCTAATGCAAAACCTTTATG
TTTGTTACCAAATCTAAATAAATTATCAGATATTAAAACTTTTAAATTAATTGATATAACAAGTATAGGCCCAGATATTC
GTTTGATATTGCAACCAAATACTGTTGTATAA

Protein sequence :
MIKNVIPEDIGYLSRAFQLARKGRFTTMPNPNVGCVIVKDNHVIGEGYHMRAGENHAEINALSVAGNFAKGATAYVTLEP
CSHYGRTPPCTTALIKSGIKRVVVSMLDPHPDLTGRGIQLLKQSGILVSHSIMLSEAESINKGFIKRIRTGMPWIKLKLA
SSLDGRVAMSSGESKWITSVQSRQDVQCFRAESDVILSTASTVLMDNPRLNVRWSCFSKEMKNIYINGNQIRHPLRVIID
STNRILPTHRFIQNEGGVILVRIKKDNLNWPKSVEQLLVSPIVNKSGLNQINLKKLMQYLACYLKINSVWVESGPTLSGA
LLDIGLVDEVILYQAIKFLGSNAKPLCLLPNLNKLSDIKTFKLIDITSIGPDIRLILQPNTVV

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB0868_00293 YP_008211619.1 Pyrimidine deaminase Not tested AbaR26 Protein 1e-58 45
BJAB07104_00289 YP_008207754.1 Pyrimidine deaminase Not tested AbaR25 Protein 1e-58 45