|
Name : PSM_A0717 (PSM_A0717) Accession : YP_004067817.1 Strain : Genome accession: NC_014803 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA topoisomerase III Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0550 EC number : - Position : 769127 - 771067 bp Length : 1941 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAAACTTTATATTGCTGAAAAACCTTCATTAGGACGCGCTATTGCAGATGCGCTTCCAAAACCTCATAAAAAACACGA TGGTTATATTGAAGTGGCGAATGGTGATTGTGTGTCTTGGTGCATAGGTCATTTGCTCGAGCAAGCAGAACCCGATGACT ATGATGAGCGTTTTAAAAAATGGCAATTTGAGCATTTACCTATTGTGCCTGAACACTGGCAATTAAAAGCTAAAACAAAA ACCCGTAAGCAGCTTACCATTTTAAAAAAATTAATTAAGCAGGCTACAACACTCGTGCATGCTGGCGATCCTGATCGTGA GGGTCAGCTACTGGTTGATGAAGTAATCGAGCAAACAAAAATTAGTCAAACCAAAAAGCAAAGTATTCAACGCTTATTGA TCAGTGATTTAAACTTAACTGCGGTAAAAAAATCACTCAACGCTATGCGGGCTAACCGTGATTTTATCCCTTTAAGTGTA TCTGCTTTAGCGCGGTCTCGTGCTGATTGGTTGTTTGGTATGAATTTAACGCGAGCTTATACGCTAGCTGGGCAAAAAGC GGGCTTTGGTAATGTGTTGTCGGTTGGGCGAGTACAAACACCTATTTTAGGTTTAGTTGTAAATCGTGATAATGAAATCG CAAATTTTGTATCCAAACCATTTTATGAAGTACTTGCTCATCTTGTTACACCTGAGCAGCAATCATTTACTGCTAAGTGG ATACCGAGTAAAGCGTGCGAACCATATCAAGATGAAGAGGGCAGAGTACTTAATAAAGCCTTAGCCGAAAATGTGACTTC ACGCATTGCTAATCAGCCCGCAAATGTAACAGCGCTTGAGCAAAAGCAAAAAAAACAAACCGCGCCGCTTCCTTATAACT TATCTGCTTTACAAATAGATGCTGCTAAAGCTTTTGGGATGCCAGCACAAAAAGTACTCGATATTTGCCAAGTTTTATAT GAACGTCATAAATTAATTACCTACCCACGCTCAGATAACCGTTACTTACCGAGAGAGCATCACCAAGATGCACCTGCTAT TTTAAAAGCGATAGCCGTAAATGGTGGGCAGTCAGTAGAGCTGGTAAATGAGGCAAATGCAAAACAACGTAGTAAATGTT TTAATGATGCAAAAGTGGCCGCTCATCACGCCATTGTGCCGACAGCTAAACAGTTAAAAAGTGTGAGTTTAGCCAATGAT GAAGCAAAAATTTATCAGTTAATAAGTCGACACTATTTAATTCAGTTTTATCCCGACTACATTTACAACGAAAGCAAAGT AGAGGTAACCATAGCCGGAGGTTTATTTAAAGCAAGTGCAAAGCAAGATGTAAGCTTAGGTTTTAAATTGCTCATGGGTA AGTCGGAACTCAAAGAAGAAGCTACATTGCCTTATTTAGAAAAAGGTATGGCACTTACTTGTACTAAAGGTGAAGTGGTG CAAAAGCATACATCTCCTCCGGCTCATTTTACCGATGCAACCTTACTTGCTGCTATGACGGGAATTAGCCGTTATGTAAA AGACCTGCAAATCAAAAAAATATTAAAAGAAACAGATGGCCTCGGTACAGAAGCAACGCGTGCAGGTATTATTGAGCTGT TATTTAAACGTCGCTTTTTAAAACGTGAGGGAAAAGCAATTAAAGCAACTGAAACAGGTCTGGCATTAATTAGTGTATTA CCAGAGGGATTATCAAGCCCCGACTTAACTGCAAAATGGGAGTCGAGTTTAGGTGATATTGCACAGCAAGCAATGAGTTA TCAGCAGTTTATACAACCTTTATTAGCCGATTTAACTAATTTTGTAAGTCAAGCGGCGAACTGCAATAGTCAGGCATTTG CACTGTTACCTAAAACGTCACCTAAAAAGCGCTTTGCCAAACGTACAAAAAAAGCGCCGTATAAAAAGTCGAGTTATAAA AAAAGCCCTGCGGTAAATTAA Protein sequence : MKLYIAEKPSLGRAIADALPKPHKKHDGYIEVANGDCVSWCIGHLLEQAEPDDYDERFKKWQFEHLPIVPEHWQLKAKTK TRKQLTILKKLIKQATTLVHAGDPDREGQLLVDEVIEQTKISQTKKQSIQRLLISDLNLTAVKKSLNAMRANRDFIPLSV SALARSRADWLFGMNLTRAYTLAGQKAGFGNVLSVGRVQTPILGLVVNRDNEIANFVSKPFYEVLAHLVTPEQQSFTAKW IPSKACEPYQDEEGRVLNKALAENVTSRIANQPANVTALEQKQKKQTAPLPYNLSALQIDAAKAFGMPAQKVLDICQVLY ERHKLITYPRSDNRYLPREHHQDAPAILKAIAVNGGQSVELVNEANAKQRSKCFNDAKVAAHHAIVPTAKQLKSVSLAND EAKIYQLISRHYLIQFYPDYIYNESKVEVTIAGGLFKASAKQDVSLGFKLLMGKSELKEEATLPYLEKGMALTCTKGEVV QKHTSPPAHFTDATLLAAMTGISRYVKDLQIKKILKETDGLGTEATRAGIIELLFKRRFLKREGKAIKATETGLALISVL PEGLSSPDLTAKWESSLGDIAQQAMSYQQFIQPLLADLTNFVSQAANCNSQAFALLPKTSPKKRFAKRTKKAPYKKSSYK KSPAVN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| pph56 | CAI36097.1 | Topoisomerase IA | Not tested | PPHGI-1 | Protein | 8e-96 | 41 |
