|
Name : CKC_02045 (CKC_02045) Accession : YP_004062648.1 Strain : Candidatus Liberibacter solanacearum CLso-ZC1 Genome accession: NC_014774 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0021 EC number : - Position : 438227 - 440209 bp Length : 1983 bp Strand : + Note : COG0021 Transketolase DNA sequence : ATGCGGTGCGATGGATATAAAAAGATGGCTAATGCCATTAGGTTTTTGTCAATGGATGCTATAGAGAACGTCAATTCTGG GCATCCAGGATTGCCTATGGGAATGGCAGATGTGATCACTGTTCTTTTCTCACAATTCATGGCGTTTGATCCTAAATGTC CATCATGGCCAAATCGTGATCGTTTTGTTTTGTCAGCGGGGCATGGCTCCATGTTGTATTACTCATTGCTCTATCTTTTA GGGTATCAGGACATAACAATTGATGACATCAAAAAATTTCGAACAATTGGCTCTAAAACAGCAGGGCATCCTGAATATGG ATTTCTTTCTGGAATTGAGGCTACTACCGGACCTTTAGGGCAAGGAATTGCCAATGCTGTCGGCATGGCTATTGCCGAGC GTAAATTAAGAGATGAATTTAGTGATGCATTGATCAATCATTATACTTATGTATTGGTCGGTGATGGTTGTTTGATGGAA GGTATTAGTCAAGAAGCGATTTCTTTAGCAGGGCATCTTGGATTAAATAAACTGATCGTTCTTTGGGATAATAATGGTAT TTCAATTGATGGTTCTATTTCCTTAGCTGATTCTACAGATCAGCATGCTCGTTTCCGTGCGTCTGGATGGAATACATTGT CTGTTAATGGACATGATTATAATGCTATTGCATCTATCTTGAGAGAAGCCCAAGAATCCAACAAACCTACGATGATTGCT TGTGAGACGGTTATTGGTTTTGGATCTCCAAATAAAGCGGGGACGAATAAAGTCCATGGTTCTGCTTTGGGTAAAGAAGA AATAAAAGCTACTCGTAAGGCTCTGAATTGGAATTTAGATCCTTTTTTGATTCCTGATGAAATAATGAAAGAATGGCGTT CGGTTGGATTACGCTCTTCTCAAATAAGGGCAGATTGGCAATCCCATCTTTCTTCTATTGAGAGTGATGTGCAAAAAGAA TTTAATCGTCGTTTTTCAGATGAATTGCCTGATTGTTTTGATAATACTATTATGCAATTGAAGAAAAAGATTGGGGAATC TAAGCCAGAAGTTGCTACACGCAAATCTTCTGAAATGGTACTAGAAGTGATTAATGATTGTTTGCCAGAGATCATCGGAG GATCGGCAGATCTTACTGGTTCTAACGGCACGAAAACCAGTCAAATGAAATCTATTTCTAGGAGTGATTTTTCAGGTCGT TACTTACACTATGGTGTGCGTGAACATGCTATGGCTGCGGTGATGAATGGCATAGCATTGCATAAGGGATTAGTGCCATA CTCGGGAACGTTTATGGTATTTTCTGATTACAGTCGCCCTTCTATAAGGTTGGCGTCTTTAATGGGAATAAGGGTTGTTC ATGTTTTAACACATGATTCTATAGGGGTAGGTGAAGATGGACCTACACATCAACCCGTAGAACATATGGCGGCATTGAGA GCTATACCTAATCTTCTTGTTTTTAGACCTGCGGATTCGATAGAAACATTAGAATGTTGGCAGGTAGCTCTTAAGAAGAA AAGTTGTCCATCTGTATTATCTTTGTCTAGACAAAATTTGCCTTTTCTCCGTACTCAATATGAAGAAAAAAATTTATGTT CTTTAGGTGCTTATGATTATATTGCTTGTCCTAATGCACAAGTAGCGATTTTTGCTTCAGGTTCTGAATTAAAGATTGCT GTAGAAGCGCGTAATCTTTTATCTGCTAGGAATATTTCTGCTCGTGTGATTTCAGTTCCTTGTTTTGAATTGTTTTTTGA ACAATCAGACGCATACCGTGCACAAATTATAGGGACATCTCCCGTTAAGATTGCTGTTGAGGCAGGATTGCGTCAAGGGT GGGATTCTTTGATAGGAAGTGATGGGGATTTTGTTGGCATGAAAGGTTTTGGATCTTCAGGATCTTGCGATCTTCTTTAT CAACATTTTGGTATAACTGCTACTGCAATAGTGGCTTTGGTGGAGAGGAAATTATTAACATAA Protein sequence : MRCDGYKKMANAIRFLSMDAIENVNSGHPGLPMGMADVITVLFSQFMAFDPKCPSWPNRDRFVLSAGHGSMLYYSLLYLL GYQDITIDDIKKFRTIGSKTAGHPEYGFLSGIEATTGPLGQGIANAVGMAIAERKLRDEFSDALINHYTYVLVGDGCLME GISQEAISLAGHLGLNKLIVLWDNNGISIDGSISLADSTDQHARFRASGWNTLSVNGHDYNAIASILREAQESNKPTMIA CETVIGFGSPNKAGTNKVHGSALGKEEIKATRKALNWNLDPFLIPDEIMKEWRSVGLRSSQIRADWQSHLSSIESDVQKE FNRRFSDELPDCFDNTIMQLKKKIGESKPEVATRKSSEMVLEVINDCLPEIIGGSADLTGSNGTKTSQMKSISRSDFSGR YLHYGVREHAMAAVMNGIALHKGLVPYSGTFMVFSDYSRPSIRLASLMGIRVVHVLTHDSIGVGEDGPTHQPVEHMAALR AIPNLLVFRPADSIETLECWQVALKKKSCPSVLSLSRQNLPFLRTQYEEKNLCSLGAYDYIACPNAQVAIFASGSELKIA VEARNLLSARNISARVISVPCFELFFEQSDAYRAQIIGTSPVKIAVEAGLRQGWDSLIGSDGDFVGMKGFGSSGSCDLLY QHFGITATAIVALVERKLLT |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 2e-134 | 47 |
| APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 2e-129 | 44 |
