|
Name : tkt (MSB_A0615) Accession : YP_004047354.1 Strain : Mycoplasma leachii PG50 Genome accession: NC_014751 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0021 EC number : 2.2.1.1 Position : 700929 - 702899 bp Length : 1971 bp Strand : - Note : identified by match to protein family HMM PF00456; match to protein family HMM PF02779; match to protein family HMM PF02780; match to protein family HMM TIGR00232 DNA sequence : ATGAAAAACAGTAAAAATGATAATTTAAATGCATTGCGTATATTAGGTGTAAGTGCAATTAATAAAGCAAAGTCTGGTCA TCCTGGAATTGTTTTAGGAGCAGCTGGAATTGTTTATGTTTTATTTAACAAAATTATGAATTTTAATCCTAAGAATCCAG AATGATTTAATAGAGATAGATTTATTTTATCTGCTGGTCATGGTAGTGCTTTATTATATTCAGCTTTACATTTATCTGGA TATGATTTATCTATTGAAGACTTAAAACAATTTAGACAATGAGATAGTAAGACTCCAGGTCATCCTGAAAAAACTTTAAC TAGTGGAGTTGAAGTAACCACTGGGCCACTTGGCCAAGGCGTTGGAATGGCCGTTGGAATGGCCGTTGCTGAAGCTCATT TAGCTAGTGTTTATAATAGACCTAATTTTGATTTAATTGATCATTATACTTATGTTTTATGTGGTGATGGTGATTTACAA GAAGGAATTAGTCAAGAAGTAATTTCATTTGCTGGTAAAAACAAATTAAACAAATTAATTTTAATTCATGATTCAAATGA TGTGCAATTAGATTCAGATGTGGTTGATGTACAAATTGAAGATATGCACAAACGTTTTAAAGCATGTAATTGAAATACAA TTAAAGTTAGTGATGGAGAAGATTTAAACTCTATTTATAATGCTATTAAAAAAGCTCAAGTTTCAGATAAACCAACATAT ATAGAAGTTAAAACTATTATTGGATTAGGTTCAACTAAACAAGGAACTAAAGACGTTCATGGTGCACCTTTAAATGATGA TATAACTAAAGTTAAAGACTATTTTGACTGAAAATATGATGATTTTATTATTCCAAATAGTGTTTATGAACATTGATCAA TTAATGCTAAAAACGGTTTATTAAAAGAAGAAAAATGAAATGAATTAAAAGCTAAATATAGCTTAGATTATCCTGAATTA AACCAGTACTTAGATAATGCAATTGATAAAAAAATTACTTTTGATTTTAATAGTTTATTAGAAAATGTTCCAAGTAGTGA TGAAGCAACAAGACTAAGTTCAGGAAAAATTTTTGAACAAATTGCAAATAAAGAAAAAATGTTAATTGGTGGAAGTGCTG ATTTATCAAGTTCAACTAGAATTAAAGGTGCTGATAATCAATTCACTAGCTCTAATAAGACTGGTAGAAATATAATGTAT GGAGTTAGAGAATTTGGAATGGGTGCAATTAATAATGGAATTGCAGCTCATAAAGGATTAATTCCAGTTGCTAGTGGATT TTTTGTGTTTGCTGATTATTTAAAACCAGCAATGAGATTAGCTTCTATTATGCAATTGCAACAATTGTATATTTTTACTC ATGATTCAATTGCAGTTGGTGAAGATGGACCTACTCATCAGCCAATTGAACAACTAGCAATGCTTAGAACTATTCCAAAT CATGTTGTTTTAAGACCCGCAGATTTTAGTGAGACTGTTGCTTGTTATAAAATTGCTTTAACAAAACTTGATAAGACTCC AACTTCAATTGTTTTAACTAGACAAAATGTTAAACAATTAAATCATGATGATGCTTTAAATAAAGTTGAATATGGAGCTT ATATAATTAGTGATCAAGCTGATGCAACTATTACTTTAATAGCTAGTGGTAGTGAAGTTAGTTTAGCAATTGATATAAAA GAAGAATTATTAAAACACAACCTAAAAGCAAAAGTAGTTTCAATGGTTTCAACTAATTTATTTGATAAGCAAGATAAAAA ATATCAAGATCAAATCATAGATAAAAAAACAAAAAGAATTGCAATTGAAATGGGAACAAGTGCGATTTGATATAAATATG TTGGTGATGATGGTTTAGTTTATGGAATTGATTGCTTTGGTGAATCAGCTCCAGCTAATAATGTAATTAAAGAGTTTGGA TTTACTAAAGAAAATATTACAAATAAAATATTAGAGAACTTAAATAAATAG Protein sequence : MKNSKNDNLNALRILGVSAINKAKSGHPGIVLGAAGIVYVLFNKIMNFNPKNPEWFNRDRFILSAGHGSALLYSALHLSG YDLSIEDLKQFRQWDSKTPGHPEKTLTSGVEVTTGPLGQGVGMAVGMAVAEAHLASVYNRPNFDLIDHYTYVLCGDGDLQ EGISQEVISFAGKNKLNKLILIHDSNDVQLDSDVVDVQIEDMHKRFKACNWNTIKVSDGEDLNSIYNAIKKAQVSDKPTY IEVKTIIGLGSTKQGTKDVHGAPLNDDITKVKDYFDWKYDDFIIPNSVYEHWSINAKNGLLKEEKWNELKAKYSLDYPEL NQYLDNAIDKKITFDFNSLLENVPSSDEATRLSSGKIFEQIANKEKMLIGGSADLSSSTRIKGADNQFTSSNKTGRNIMY GVREFGMGAINNGIAAHKGLIPVASGFFVFADYLKPAMRLASIMQLQQLYIFTHDSIAVGEDGPTHQPIEQLAMLRTIPN HVVLRPADFSETVACYKIALTKLDKTPTSIVLTRQNVKQLNHDDALNKVEYGAYIISDQADATITLIASGSEVSLAIDIK EELLKHNLKAKVVSMVSTNLFDKQDKKYQDQIIDKKTKRIAIEMGTSAIWYKYVGDDGLVYGIDCFGESAPANNVIKEFG FTKENITNKILENLNK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 3e-111 | 44 |
| APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 6e-109 | 43 |
