|
Name : MSB_A0598 (MSB_A0598) Accession : YP_004047338.1 Strain : Mycoplasma leachii PG50 Genome accession: NC_014751 Putative virulence/resistance : Virulence Product : PTS system lactose/cellobiose specific transporter subunit IIB Function : - COG functional category : S : Function unknown COG ID : COG3037 EC number : - Position : 686960 - 688768 bp Length : 1809 bp Strand : - Note : identified by match to protein family HMM PF02302; match to protein family HMM PF04215 DNA sequence : ATGGATTTTGGAAAATATGTTTTAAATTTCTTTACTGAATTTATTGGAACTCCAGCAATATTAGTAGCACTATTTGCTTT TATTGGTTCTTTATTACAAAAAAAGAAATTTACAGAAAGTTTAACTTCAACAATTAAAACAGCTATTGGTTTTTTAATTA TTGGTGGTGGAGCTGGTATTATTGCTGGTTCTATTCAAAAACTAGGTTTTGCTTTTAACTTATTATTTCAAAGATCTGGA GCTATTGCAAATAATGATGTTTTACCAGGTTTATTTTTAAATATTTCAAAAATAGTTTTAACTGGATCACTAATTATGAT TTGTGCTATGTTTTTAAATATAGTTTTAGCCAGAATTAGTAAATTTAAATATATTTATTTAACAGGTCATGTTTTGTTTT ATTTTTCAACAATGTTTGCAAGTGTAATGCATGTTGCTGGTCTAAATTTAGATGAAGTAAAAAATTTAACAACCGTAGTA ATTTCTGGAGCTTTACTAGTTTCTATCTATATGGTGTTAACCCCAGCTTTATTAAATAATCATGTTATTAGAATTACTAA AAATGATAATTTAGCACTAGGACATACTGGTTCACTTGGTTATTGATTATCAGCAATTATTGGATTAGGAATAACAAAAA TTAGTAAAAAACCATCACGTTCTACTGAAGATGTTAATTTTCCAAAAGGACTAGCATTTTTAAGAAATACTAATGTAGCT ATTGGTATAACTATGTTATTGCTTTATTTGATAATTTACTTTACTACTTTTATAGTTCATGGATATGAGCAAATGGTTGA TCATAAAATTATTGATAATGGAAAAGATGTTTTTGCACAAGGATTATTACAATCTTTAACATTTGCAGCAGGAGTTGAAA TTGTTTTAATTGGAGTAAGAATGTTTATTGCTGAAATTATTCCATCATTTCAAGGGATTTCACAAAAAGTAGTTCCAGAT GCAAAACCAGCTTTAGATTGTCCAATTGTATTTCCTTATGCACCAAATGCAGTTCTAATTGGGTTTATTTCATCATTTAT TGGTGGAATTATAGCAATGGGGATAACAATTTTAATTGTTAATTTAAAAGGAATTAATGTAGATATTTGAATTATTATTA TTCCAAGTATTGTTCCACACTTTTTTGTTGGTGCTACTTGTGGGGTTTTTGGAAATTCAACAGGTGGTATTAAAGGAGCT GTTATTGGTTCTTTTGTTAATGGATTAATTATTTCATTTGTTCCGTTCTTATTTATTGGTTTACAATTAATTCCAAACAT TTCTAATAACAATCAACATATTGCTTGAGGAGATGGAGACTTTTTATTAGGGTTACCAATTGGAGTTTTATTAAGATTAA TTGGAGTTAAAAGTGCTATTTGAGTTTTACTAATAATTAGTATAATAAGTTGATTAATCTTACCAATTTATAGTTTTTTA ACTAAAAAAATTAATTTAGTTAAAAAACTAGATAATAACAATAAAGATGAAATTATTAATAAAGATCAAAAGCTTATATC AAAATATGATCTTAAAAAACAATATAAAATAGTTGCTGTTTGTGGTCAAGGTTTAGGTTCATCATTGCTAATTGAAATGA ATTTAAAAAATGTTATTAAAGAATTAGATTTACCAATACAAATAACACATACTAATTTAAATTCATTTGATCCAACTGAT GAAACTATATTAGCTGTAGTTTGTGGAATAGATTTGCAAAATAGTATTAACTTTGAACGTAAAATTGTTTTAGAAAATCT TTTAGATCAAGATCAAGCTAAACAAAAGATTAAGGAATTTTTAAGTTAA Protein sequence : MDFGKYVLNFFTEFIGTPAILVALFAFIGSLLQKKKFTESLTSTIKTAIGFLIIGGGAGIIAGSIQKLGFAFNLLFQRSG AIANNDVLPGLFLNISKIVLTGSLIMICAMFLNIVLARISKFKYIYLTGHVLFYFSTMFASVMHVAGLNLDEVKNLTTVV ISGALLVSIYMVLTPALLNNHVIRITKNDNLALGHTGSLGYWLSAIIGLGITKISKKPSRSTEDVNFPKGLAFLRNTNVA IGITMLLLYLIIYFTTFIVHGYEQMVDHKIIDNGKDVFAQGLLQSLTFAAGVEIVLIGVRMFIAEIIPSFQGISQKVVPD AKPALDCPIVFPYAPNAVLIGFISSFIGGIIAMGITILIVNLKGINVDIWIIIIPSIVPHFFVGATCGVFGNSTGGIKGA VIGSFVNGLIISFVPFLFIGLQLIPNISNNNQHIAWGDGDFLLGLPIGVLLRLIGVKSAIWVLLIISIISWLILPIYSFL TKKINLVKKLDNNNKDEIINKDQKLISKYDLKKQYKIVAVCGQGLGSSLLIEMNLKNVIKELDLPIQITHTNLNSFDPTD ETILAVVCGIDLQNSINFERKIVLENLLDQDQAKQKIKEFLS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ORF8 | AAK27335.1 | unknown | Not tested | PAI-I AL862 | Protein | 1e-50 | 42 |
| unnamed | CAC39291.1 | hypothetical protein | Not tested | LPA | Protein | 8e-51 | 42 |
| vpeC | ADD91725.1 | putative PTS system-specific IIC component VpeC | Virulence | PAI-I AL862 | Protein | 8e-51 | 42 |
