|
Name : MSB_A0232 (MSB_A0232) Accession : YP_004046989.1 Strain : Mycoplasma leachii PG50 Genome accession: NC_014751 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : - Position : 275598 - 277202 bp Length : 1605 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF00128 DNA sequence : ATGGCAAATTACTGATGAAAAAATACTGTAGTTTATGAAATGTATCTTCAATCATTTAAAGATTCAAATAATGATGGTAT TGGTGATTTAGATGGTGCTATAGAAAAATTAGAGTATTTAAAAGAACTAGGAATTGGTGCTATTTGATTAACTCCAATTT ATGATTCTCCACTTGTAGATAATGGATATGATATTTCAAATTATCAATCTATTAATCAAATTTATGGTGGATTAGAAAAG TTTAAAAAATTTGTTGATAAAGCTAATGAGTTAAATATTGGTATAATTATGGATCTAGTTTTAAACCATACTTCAGATCA ACATGAATGGTTTAAACAATCAAGATCATCTAAAACTAATCCATATCGTGATTATTATATTTGAAGAGATCAGCCTAATG ATATTCAATCAGCTTTTGGTGGATCTGCTTGAACTTATGATCAAACTACAAACCAATATTATTTTCATATGTTTGCAAAA GAACAACCTGATTTAAATTGACAAAACCCTAAAGTTAGAGAAGAAATTGCAAAAATGGTCAAGTGATGATGTGATTTTGG AATAATAGGATTTAGATTAGATGTAATTGAATTGCTTGGTAAAAGAATTGATCAAAAGATTTTATCTAATGGTCCAATGT TACATAAATACATTCAAGACCTAAGAAAAAATAGTTGAAATTCAAATGAATTTTTAACAGTTGGTGAGTGTTGATCAGCA GATATTGATCATGCAATTCAATATTCAAATGAAAAAAATGAAGAATTTTCAATGATATTTAATTTTGAACCAGTTACTTC TTTTTTTAATAAAGATAATAAGTATAAGAAAAAAGCTGTTGATTTTTTAGAACTTAAACAAATTTATAAAAAATGACAAC AAGGTTTACATAATAAAGGTTGAGCTGGTTTATTTTTATCAAATCATGATTTACCTAGAATGGTTTCAAGATATGGAAAT GATCAAAAATATAGAATTCAATCAGCAAAAACTTTATTAACTACTATTTTTTTAATGCAAGGAACTCCTTTTATTCATCA AGGTGATGAAATTGGAATGACTAATGTTAATTGAACTGATTTAAACAAATATAAAGATGTTGAAATTAAAAATACCTATC AATCAGAAGTTTTAAAAAATAAAACCTTAACTTATGATCAGTTTATAGAAGGAATATTAGAAAATAGTAGAGATCATGCA AGAACACCATATCAATGAGATGATAGTAAATATGCAGGATTTAGTAATTATCAACCTTGAATTGATGTAAATGATAATTA CAAAGAAATTAATGCTAAAAATGAGTTAAATAATCCAAATGGTATTTATCATTATTTAAAAAAATTAATTAAATTTAGAG AAGAAAGTGATTATTCTCAATTAATTATTGATGCAGAATTTGAATTATTAGATCCAAATAATAATAAATTGTTTGCTTAT AGTAGAATTGATCAAAATAGATCAATTAAAATAATTGCTAATTGAAGCGATCAACAAGTTAATATTAGTCATTTAATTAA TCAAAATAATAAGATTATTTTAAATACTGAAATTGATTTTGATCAAAATACTTTAAAACCTTGACAAACAATTATTGTTG AATAA Protein sequence : MANYWWKNTVVYEMYLQSFKDSNNDGIGDLDGAIEKLEYLKELGIGAIWLTPIYDSPLVDNGYDISNYQSINQIYGGLEK FKKFVDKANELNIGIIMDLVLNHTSDQHEWFKQSRSSKTNPYRDYYIWRDQPNDIQSAFGGSAWTYDQTTNQYYFHMFAK EQPDLNWQNPKVREEIAKMVKWWCDFGIIGFRLDVIELLGKRIDQKILSNGPMLHKYIQDLRKNSWNSNEFLTVGECWSA DIDHAIQYSNEKNEEFSMIFNFEPVTSFFNKDNKYKKKAVDFLELKQIYKKWQQGLHNKGWAGLFLSNHDLPRMVSRYGN DQKYRIQSAKTLLTTIFLMQGTPFIHQGDEIGMTNVNWTDLNKYKDVEIKNTYQSEVLKNKTLTYDQFIEGILENSRDHA RTPYQWDDSKYAGFSNYQPWIDVNDNYKEINAKNELNNPNGIYHYLKKLIKFREESDYSQLIIDAEFELLDPNNNKLFAY SRIDQNRSIKIIANWSDQQVNISHLINQNNKIILNTEIDFDQNTLKPWQTIIVE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 7e-104 | 44 |
