|
Name : MSB_A0147 (MSB_A0147) Accession : YP_004046904.1 Strain : Mycoplasma leachii PG50 Genome accession: NC_014751 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha Function : - COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism COG ID : COG0209 EC number : 1.17.4.1 Position : 162240 - 164402 bp Length : 2163 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF00317; match to protein family HMM PF02867; match to protein family HMM PF08343; match to protein family HMM TIGR02506 DNA sequence : ATGAACGAAAATAAAAACACAATCGTTTTAGATGATGTTGATGATGAATATATTAAATTAAATGCTAGATCTAAGATTTT TTCAAAAGATCAAGACAATTTCCAATTAGATGTTAAAGCAGCTGAATTATATTTAAAAAATTATATTGAACCTAGAATGA AAAAGTTTTCTAGTCTAAAAGAAAGACTAGATTATTTGTTAGAAAATCAGTATTATGATTCAGAAATTTTAAATAAATAT AGTTTTGATCAAATTAGTCAATTAAATAATTATGCTTATTCATTTAACCATCATTTTCCAAGTTTTATGGGAGCTTTAAA ATTCTTTAATGCTTATGGATTAAAAACTTTTGATACTACAATGTATTTAGAAACTTATACAGATAGAGTATTAATGAATG CTCTATTTTTAGGTAATGGTAATTTTAATAAAGCAAAAAACTTATTAAAAGATATGATGTTAGGTAGATTTCAACCAGCA ACACCTACTTTTTTAAATGCAGCTAAAAAGCATAGAGGAGAGTATGTTTCTTGTTATTTATTAAGAACTGAAGATAACAT GGAATCAATTTGTAGAACAATTTCAACTTCACTACAACTTTCAAAAAGAGGTGGAGGAGTTGCAATTTGTTTAACTAATT TACGTGAAACAGGTTCTCCTATTAAAAATATTTCAGGTCTAAGTTCAGGTCCAATTCCAGTTATGAAGATTTTAGAAGAT TCATTTACTTATGCTGATCAATTAGGCCAACGTCAAGGAGCTGGAGCTGTTTATATTTCAGCACATCATCCAGATATTAT TTCAGTTTTAGATACTAAAAGAGAAAATGCTGATGAAAAGATTAGGATTAAATCTTTATCATTAGGATTAGTAATTCCAG ATATTACTTTTGAATTAGCTAGAGATAATAAAGATATGGCTTTATTTAGCCCTTATGATGTTCAAAAGACATATGGTAAG CCATTATCAGATATTTCAATTACTGAAAAATATTATGAAATGTTAGAAAATCCTAATATTAAAAAAACATATATTAGTGC TAGAAAATTCTTTTTAACTGTTGCTGAACTACATTTTGAAAGTGGATATCCATATATTTTATTTGAAGATACTGTTAATA GAAGAAATGCTCATGATAAAAAGGGAAGAATTATTATGAGTAATTTATGTAGTGAAATTGTTCAAGTAAGTACAGCAAGT GAATATAGTTCTGATTTATCATTTATAAAAACTGGAGAAGATATTTGTTGTAATTTAGGTAGTTTAAATATTGATAAAAT GATGAAATCAGGAAAAGAATTTTCAGATTCTATTTATAATGCAATTTCTGCTTTAGATATAGTTTCAAGAAATTCAGATT TAAATGCATCTCCTTCAATTAAAAAAGGAAATGCTGAAAATCATGCCGTTGGATTGGGAGCTATGAATCTACATGGATTT TTAGCAACTAATAAGATTATGTATGACTCACCTGAAGCTGTTGATTTTACTAATATGTTTTTTTATACAGTTGCTTATAA CGCTTTTAAAGCTTCAAATAAATTAGCTAAAGAATTTGAAAAATTTGCTTCATTTGATCAATCAAGATTTGCTGATGGTT CTTGATTTGATAAATATACTAAATGTGAATTTGATAAATGAACACCACAAACAAATAGAGTAAAAGAATTATTTAAAGAT TATGATGTTCAAATTCCAAGTCAAGCTGATTGAATTCAATTAGTTGAAGAAATTAAAAAAACAGGTTTAGCAAATTCACA TTTAATGGCAGTTGCTCCAACTGGATCAATTAGTTATTTATCATCATGTACTCCTTCACTACAACCAGTAGTTTCAACAG TTGAAGTTAGAAAAGAAGGAAAATTAGGAAGAGTTTATGTTCCAGCATATCAAATTAATTTTGATAATATGGGATATTAT GCAATGGGTACTTATGAATTAGGACCAGATCCAATTATTAATATTGCTGCAGCAGCTCAACAGCATGTTGATCAAGCAAT TTCACTAACTTTATTTATGACTGATAAAGCAACAACTAGAGATTTAAATAGAGCATATGTTAATGCCTTTAAACAAGGTT GTTCTTCAATTTATTATGTAAGAATTCGTCAAGATGTTTTAGAAGATAGTGAAAACTATGAATGTGATGCATGTAAAATT TAA Protein sequence : MNENKNTIVLDDVDDEYIKLNARSKIFSKDQDNFQLDVKAAELYLKNYIEPRMKKFSSLKERLDYLLENQYYDSEILNKY SFDQISQLNNYAYSFNHHFPSFMGALKFFNAYGLKTFDTTMYLETYTDRVLMNALFLGNGNFNKAKNLLKDMMLGRFQPA TPTFLNAAKKHRGEYVSCYLLRTEDNMESICRTISTSLQLSKRGGGVAICLTNLRETGSPIKNISGLSSGPIPVMKILED SFTYADQLGQRQGAGAVYISAHHPDIISVLDTKRENADEKIRIKSLSLGLVIPDITFELARDNKDMALFSPYDVQKTYGK PLSDISITEKYYEMLENPNIKKTYISARKFFLTVAELHFESGYPYILFEDTVNRRNAHDKKGRIIMSNLCSEIVQVSTAS EYSSDLSFIKTGEDICCNLGSLNIDKMMKSGKEFSDSIYNAISALDIVSRNSDLNASPSIKKGNAENHAVGLGAMNLHGF LATNKIMYDSPEAVDFTNMFFYTVAYNAFKASNKLAKEFEKFASFDQSRFADGSWFDKYTKCEFDKWTPQTNRVKELFKD YDVQIPSQADWIQLVEEIKKTGLANSHLMAVAPTGSISYLSSCTPSLQPVVSTVEVRKEGKLGRVYVPAYQINFDNMGYY AMGTYELGPDPIINIAAAAQQHVDQAISLTLFMTDKATTRDLNRAYVNAFKQGCSSIYYVRIRQDVLEDSENYECDACKI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 5e-179 | 54 |
