Gene Information

Name : Calkro_1446 (Calkro_1446)
Accession : YP_004024121.1
Strain : Caldicellulosiruptor kronotskyensis 2002
Genome accession: NC_014720
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : leucyl-tRNA synthetase
Function : -
COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis
COG ID : COG0495
EC number : -
Position : 1617703 - 1620156 bp
Length : 2454 bp
Strand : -
Note : KEGG: ate:Athe_1254 leucyl-tRNA synthetase; TIGRFAM: leucyl-tRNA synthetase

DNA sequence :
ATGGAATATAATTTTAAAGAAATTGAAAAGAAATGGCAGCAAAAATGGTTTTCACAGAACAAATACAAAGTATCAGAGGA
TAGTTCAAAACCAAAATATTATGTCCTTGAGATGTTTCCATATCCTTCAGGAAAACTTCATATGGGACATGTTAGGAACT
ATTCGATTGGTGATGTATTTGCTCGATTTATGAGATTAAAAGGCTACAACGTTTTGCACCCGATGGGCTGGGATGCTTTT
GGATTGCCAGCTGAAAATGCTGCTATAAAGCATGGGATTCATCCTTCTGACTGGACGTGGTCAAATATTGAGAATATGAA
AAGGCAACTTATGGAGCTTGGAATTAGCTATGATTGGGATAGAGAAGTAGCCACATGCCATCCAGATTATTATAAATGGA
CTCAGTGGATGTTCTTGCAGTTTTATAAAGCTGGGCTTGCTTATAGAAAGAGATCATATGTAAACTGGTGCCCATCATGT
GAGACAGTGCTTGCAAATGAACAGGTTGTAAATGGTAGATGTGAAAGATGTAAATCACTTGTTGGCAAAAAAGATTTAGA
GCAGTGGTTTTTCAGAATTACCAATTATGCAGAAAGACTTCTTCGTGATATAGAAAAGCTTGACGGGTGGCCAGAAAAAG
TAAAGATAATGCAAAAGAACTGGATAGGAAGAAGTGAAGGTACAGAGATTGAGTTTGAAATTGAGGATTTGGGTAAAAAA
ATAAAAGTATTTACAACAAGACCTGATACTCTTTTTGGCGTCACATACCTTGTTTTGGCTCCAGAACATCCTTTAACAAA
GGAGATAATAGCAGGGAAACCTCAAGAGAAAGAATGTCTTGAGTTTATCGAAAAGATGCAATATCTAAATGAGATTGAAA
GAACTTCTACAGAAACAGAAAAAGAAGGAAGGTTTACGGGTGGATATGCTATTCATCCTCTAACAGGTGAAAGAGTGCCA
ATATACATTGCAAATTATGTACTGGTTGATTATGGAACAGGGGCTGTAATGGGTGTCCCAGCCCATGACCAGAGGGATTT
TGAGTTTGCCAAAAAATATAATCTTTCAATTAAAGTTGTAATAAAAGGTGAAGGTATTGACATTGAAAATCTTCAGAGTG
CTTATGAAGACGAAGGTGTTTTGATTAATTCTGGAATTTTTGATGGGCTTAATAACAAAGAAGCTATGAAAAAGATAACA
CAGTACCTGGAACAAAAAGGTGTTGGCAGGGCGTGTGTCACATATAAACTCAGAGACTGGTTAATATCCAGGCAGCGTTA
TTGGGGAGCTCCAATTCCCATTGTATATTGTGAAGAATGTGGAATTGTTCCTGTACCAGAGGAAGATTTGCCTGTTTTAT
TACCTTACAATGTTGAGTTTAAACCAACAGGTCAGTCACCACTTTCTTATTGTGAAGAGTTTGTCAACACTACATGCCCG
AAGTGCGGGAAGCCTGCAAAGAGAGAAACTGATACAATGGACACATTTATATGTTCATCGTGGTATTATTTTAGATACAC
AGACCCCAAAAATGATAAAAAACCTTTTGAAAAATCGCTTGTTTCTTACTGGCTTCCTGTTGACCAGTATATTGGCGGGG
TTGAACACGCTATATTGCATCTTCTGTATTCGAGGTTCTTTACAAAGGTGCTATATGACCTTGGCTATGTACCTTTTGAA
GAGCCTTTCAAGAACCTCTTGACCCAAGGCATGGTGTTAAAAGATGGAGCAAAGATGTCAAAATCACTGGGAAATATAGT
CAGTCCTGAAGACATAGTAGAAAAGTATGGAGCTGACACAGCAAGGTTGTTTATACTCTTTGCTGCACCACCAGAGAGAG
ATTTGGAGTGGTCAGACCAAGGGGTTGAGGGATGTTTTAGGTTTTTAAATAGGCTGTGGAGACTTTATATAGAACTTAAA
AACAAACTTGCAGATGATAGTCTTATTGGTGAGTCTGAACTTGACGATGAACTAAGATATAGATTAAATTATACAATTAA
AAAGGTTACAGAGGATATAGCAGAGAGGTTTAATTTTAATACTGCTATCAGTACTATCATGGAGCTTTTGAATTTCTTGT
ATGAGTACAAAGAATGTGGCAAATTAAATAAAGATTTAATTAAAGATACACTCAGGAATTTATTGATATTGATTTATCCA
TTTACGCCTCATATTGCATGTGAGCTATGGGAGATTATGGGGTATGGTAATGATATTGAAGAGGTAAACTGGCCTCAGTA
CAATGAAGCTGCTCTTGTTCGAAAGAACGTAGAGATTGCTATTCAGATAAATGGCAAGGTAAGGTCAAGGATGAACATCT
CTGTGGATATGACAGAAGAAGAAGTGAAACAGGCAGTCATAAGTGACGAGAAACTTAAAGCTCTTTTGAATGGGAAAGAA
ATAGTCAAGTTTGTGTATGTGAAAAATAGACTTGTTAACATTGTGGTGAAATAA

Protein sequence :
MEYNFKEIEKKWQQKWFSQNKYKVSEDSSKPKYYVLEMFPYPSGKLHMGHVRNYSIGDVFARFMRLKGYNVLHPMGWDAF
GLPAENAAIKHGIHPSDWTWSNIENMKRQLMELGISYDWDREVATCHPDYYKWTQWMFLQFYKAGLAYRKRSYVNWCPSC
ETVLANEQVVNGRCERCKSLVGKKDLEQWFFRITNYAERLLRDIEKLDGWPEKVKIMQKNWIGRSEGTEIEFEIEDLGKK
IKVFTTRPDTLFGVTYLVLAPEHPLTKEIIAGKPQEKECLEFIEKMQYLNEIERTSTETEKEGRFTGGYAIHPLTGERVP
IYIANYVLVDYGTGAVMGVPAHDQRDFEFAKKYNLSIKVVIKGEGIDIENLQSAYEDEGVLINSGIFDGLNNKEAMKKIT
QYLEQKGVGRACVTYKLRDWLISRQRYWGAPIPIVYCEECGIVPVPEEDLPVLLPYNVEFKPTGQSPLSYCEEFVNTTCP
KCGKPAKRETDTMDTFICSSWYYFRYTDPKNDKKPFEKSLVSYWLPVDQYIGGVEHAILHLLYSRFFTKVLYDLGYVPFE
EPFKNLLTQGMVLKDGAKMSKSLGNIVSPEDIVEKYGADTARLFILFAAPPERDLEWSDQGVEGCFRFLNRLWRLYIELK
NKLADDSLIGESELDDELRYRLNYTIKKVTEDIAERFNFNTAISTIMELLNFLYEYKECGKLNKDLIKDTLRNLLILIYP
FTPHIACELWEIMGYGNDIEEVNWPQYNEAALVRKNVEIAIQINGKVRSRMNISVDMTEEEVKQAVISDEKLKALLNGKE
IVKFVYVKNRLVNIVVK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
leuS YP_281511.2 leucyl-tRNA synthetase Not tested Not named Protein 2e-173 46