Name : Calkro_1446 (Calkro_1446) Accession : YP_004024121.1 Strain : Caldicellulosiruptor kronotskyensis 2002 Genome accession: NC_014720 Putative virulence/resistance : Unknown Product : leucyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG0495 EC number : - Position : 1617703 - 1620156 bp Length : 2454 bp Strand : - Note : KEGG: ate:Athe_1254 leucyl-tRNA synthetase; TIGRFAM: leucyl-tRNA synthetase DNA sequence : ATGGAATATAATTTTAAAGAAATTGAAAAGAAATGGCAGCAAAAATGGTTTTCACAGAACAAATACAAAGTATCAGAGGA TAGTTCAAAACCAAAATATTATGTCCTTGAGATGTTTCCATATCCTTCAGGAAAACTTCATATGGGACATGTTAGGAACT ATTCGATTGGTGATGTATTTGCTCGATTTATGAGATTAAAAGGCTACAACGTTTTGCACCCGATGGGCTGGGATGCTTTT GGATTGCCAGCTGAAAATGCTGCTATAAAGCATGGGATTCATCCTTCTGACTGGACGTGGTCAAATATTGAGAATATGAA AAGGCAACTTATGGAGCTTGGAATTAGCTATGATTGGGATAGAGAAGTAGCCACATGCCATCCAGATTATTATAAATGGA CTCAGTGGATGTTCTTGCAGTTTTATAAAGCTGGGCTTGCTTATAGAAAGAGATCATATGTAAACTGGTGCCCATCATGT GAGACAGTGCTTGCAAATGAACAGGTTGTAAATGGTAGATGTGAAAGATGTAAATCACTTGTTGGCAAAAAAGATTTAGA GCAGTGGTTTTTCAGAATTACCAATTATGCAGAAAGACTTCTTCGTGATATAGAAAAGCTTGACGGGTGGCCAGAAAAAG TAAAGATAATGCAAAAGAACTGGATAGGAAGAAGTGAAGGTACAGAGATTGAGTTTGAAATTGAGGATTTGGGTAAAAAA ATAAAAGTATTTACAACAAGACCTGATACTCTTTTTGGCGTCACATACCTTGTTTTGGCTCCAGAACATCCTTTAACAAA GGAGATAATAGCAGGGAAACCTCAAGAGAAAGAATGTCTTGAGTTTATCGAAAAGATGCAATATCTAAATGAGATTGAAA GAACTTCTACAGAAACAGAAAAAGAAGGAAGGTTTACGGGTGGATATGCTATTCATCCTCTAACAGGTGAAAGAGTGCCA ATATACATTGCAAATTATGTACTGGTTGATTATGGAACAGGGGCTGTAATGGGTGTCCCAGCCCATGACCAGAGGGATTT TGAGTTTGCCAAAAAATATAATCTTTCAATTAAAGTTGTAATAAAAGGTGAAGGTATTGACATTGAAAATCTTCAGAGTG CTTATGAAGACGAAGGTGTTTTGATTAATTCTGGAATTTTTGATGGGCTTAATAACAAAGAAGCTATGAAAAAGATAACA CAGTACCTGGAACAAAAAGGTGTTGGCAGGGCGTGTGTCACATATAAACTCAGAGACTGGTTAATATCCAGGCAGCGTTA TTGGGGAGCTCCAATTCCCATTGTATATTGTGAAGAATGTGGAATTGTTCCTGTACCAGAGGAAGATTTGCCTGTTTTAT TACCTTACAATGTTGAGTTTAAACCAACAGGTCAGTCACCACTTTCTTATTGTGAAGAGTTTGTCAACACTACATGCCCG AAGTGCGGGAAGCCTGCAAAGAGAGAAACTGATACAATGGACACATTTATATGTTCATCGTGGTATTATTTTAGATACAC AGACCCCAAAAATGATAAAAAACCTTTTGAAAAATCGCTTGTTTCTTACTGGCTTCCTGTTGACCAGTATATTGGCGGGG TTGAACACGCTATATTGCATCTTCTGTATTCGAGGTTCTTTACAAAGGTGCTATATGACCTTGGCTATGTACCTTTTGAA GAGCCTTTCAAGAACCTCTTGACCCAAGGCATGGTGTTAAAAGATGGAGCAAAGATGTCAAAATCACTGGGAAATATAGT CAGTCCTGAAGACATAGTAGAAAAGTATGGAGCTGACACAGCAAGGTTGTTTATACTCTTTGCTGCACCACCAGAGAGAG ATTTGGAGTGGTCAGACCAAGGGGTTGAGGGATGTTTTAGGTTTTTAAATAGGCTGTGGAGACTTTATATAGAACTTAAA AACAAACTTGCAGATGATAGTCTTATTGGTGAGTCTGAACTTGACGATGAACTAAGATATAGATTAAATTATACAATTAA AAAGGTTACAGAGGATATAGCAGAGAGGTTTAATTTTAATACTGCTATCAGTACTATCATGGAGCTTTTGAATTTCTTGT ATGAGTACAAAGAATGTGGCAAATTAAATAAAGATTTAATTAAAGATACACTCAGGAATTTATTGATATTGATTTATCCA TTTACGCCTCATATTGCATGTGAGCTATGGGAGATTATGGGGTATGGTAATGATATTGAAGAGGTAAACTGGCCTCAGTA CAATGAAGCTGCTCTTGTTCGAAAGAACGTAGAGATTGCTATTCAGATAAATGGCAAGGTAAGGTCAAGGATGAACATCT CTGTGGATATGACAGAAGAAGAAGTGAAACAGGCAGTCATAAGTGACGAGAAACTTAAAGCTCTTTTGAATGGGAAAGAA ATAGTCAAGTTTGTGTATGTGAAAAATAGACTTGTTAACATTGTGGTGAAATAA Protein sequence : MEYNFKEIEKKWQQKWFSQNKYKVSEDSSKPKYYVLEMFPYPSGKLHMGHVRNYSIGDVFARFMRLKGYNVLHPMGWDAF GLPAENAAIKHGIHPSDWTWSNIENMKRQLMELGISYDWDREVATCHPDYYKWTQWMFLQFYKAGLAYRKRSYVNWCPSC ETVLANEQVVNGRCERCKSLVGKKDLEQWFFRITNYAERLLRDIEKLDGWPEKVKIMQKNWIGRSEGTEIEFEIEDLGKK IKVFTTRPDTLFGVTYLVLAPEHPLTKEIIAGKPQEKECLEFIEKMQYLNEIERTSTETEKEGRFTGGYAIHPLTGERVP IYIANYVLVDYGTGAVMGVPAHDQRDFEFAKKYNLSIKVVIKGEGIDIENLQSAYEDEGVLINSGIFDGLNNKEAMKKIT QYLEQKGVGRACVTYKLRDWLISRQRYWGAPIPIVYCEECGIVPVPEEDLPVLLPYNVEFKPTGQSPLSYCEEFVNTTCP KCGKPAKRETDTMDTFICSSWYYFRYTDPKNDKKPFEKSLVSYWLPVDQYIGGVEHAILHLLYSRFFTKVLYDLGYVPFE EPFKNLLTQGMVLKDGAKMSKSLGNIVSPEDIVEKYGADTARLFILFAAPPERDLEWSDQGVEGCFRFLNRLWRLYIELK NKLADDSLIGESELDDELRYRLNYTIKKVTEDIAERFNFNTAISTIMELLNFLYEYKECGKLNKDLIKDTLRNLLILIYP FTPHIACELWEIMGYGNDIEEVNWPQYNEAALVRKNVEIAIQINGKVRSRMNISVDMTEEEVKQAVISDEKLKALLNGKE IVKFVYVKNRLVNIVVK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
leuS | YP_281511.2 | leucyl-tRNA synthetase | Not tested | Not named | Protein | 2e-173 | 46 |