Name : Halsa_0060 (Halsa_0060) Accession : YP_003993910.1 Strain : Halanaerobium hydrogeniformans sapolanicus Genome accession: NC_014654 Putative virulence/resistance : Virulence Product : NAD-dependent epimerase/dehydratase Function : - COG functional category : M : Cell wall/membrane/envelope biogenesis COG ID : COG0451 EC number : - Position : 74508 - 75521 bp Length : 1014 bp Strand : + Note : PFAM: NAD-dependent epimerase/dehydratase; KEGG: dal:Dalk_1699 NAD-dependent epimerase/dehydratase DNA sequence : ATGTCAAAAACACATTTAGTTACTGGAGCTGCAGGCTTTATCGGTTTCCATACAAGTAAGAAGTTACTGGAAGAAGGTCA GCAGGTAATCGGCCTTGATAATCTCAATGATTATTATTCTGTTCAGTTAAAAAAGGATAGGCTGGCTATCTTAAAAGAAT ATGATAATTTCATATTTATCAAAGGTGATTTAGAGAATAATAAACTGGTTGCAAATACATTTGCGAAATATAAGCCTGAA ATAGTTATTAACCTGGCTGCTCAGGCAGGGGTTCGCTATAGTCTTAAAAACCCTCATTCCTATATAGATTCTAACCTTGT TGGTTTTATGAATATACTTGAAGGTTGTCGCCATCATGATGTTGAGCATCTTATTTTTGCTTCATCCAGTTCTGTATATG GCTCAAATGAAAAGGTGCCATTCTCAACGACGGATAATGTCGATCATCCAGTAAGTCTTTATGCAGCTACTAAAAAATCT AATGAATTGATGGCACATAGTTATAGTCATCTGTATGATCTTCCTGTTACCGGGCTGAGGTTCTTTACAGTCTATGGGCC CTGGGGCAGACCAGATATGGCTTTATTTATTTTTGCAGAGAATATGCTTAAAGGCAAACCTATTCAGGTCTTTAATCATG GAGATATGAAGCGTGATTTTACTTATGTGGATGATGTAGTTAAAGGCATTTATAAATTGACCTCATTACCTGCTCAACCA GATAATAGCTGGAATGGCAAAGATCCTAATCCAGGCACAAGCAAAGCTCCTTACAGGATTTATAATATTGGTAATAATAG CCCAGTTAATTTAATGGACTTTATTGAATGTATTGAAGATGAGCTTGGAATTGAAGCTGAAAAAGAATTTAAACCAATGC AACCTGGTGATGTAAAGATGACTTATGCTGATGTTAAGGATTTAATTGAAGATGTTGGCTATAAACCTGAAACTCCTCTA AAAACTGGAGTTAAGAGGTTTATTGATTGGTACAGAGAGTATTATGGATTTTAA Protein sequence : MSKTHLVTGAAGFIGFHTSKKLLEEGQQVIGLDNLNDYYSVQLKKDRLAILKEYDNFIFIKGDLENNKLVANTFAKYKPE IVINLAAQAGVRYSLKNPHSYIDSNLVGFMNILEGCRHHDVEHLIFASSSSVYGSNEKVPFSTTDNVDHPVSLYAATKKS NELMAHSYSHLYDLPVTGLRFFTVYGPWGRPDMALFIFAENMLKGKPIQVFNHGDMKRDFTYVDDVVKGIYKLTSLPAQP DNSWNGKDPNPGTSKAPYRIYNIGNNSPVNLMDFIECIEDELGIEAEKEFKPMQPGDVKMTYADVKDLIEDVGYKPETPL KTGVKRFIDWYREYYGF |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
cap1I | AAA64648.1 | type 1 capsule synthesis gene | Virulence | SCCcap1 | Protein | 6e-103 | 63 |