|
Name : Halsa_2334 (Halsa_2334) Accession : YP_003996092.1 Strain : Halanaerobium hydrogeniformans sapolanicus Genome accession: NC_014654 Putative virulence/resistance : Virulence Product : pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0674 EC number : - Position : 2558015 - 2561551 bp Length : 3537 bp Strand : - Note : KEGG: hor:Hore_20820 pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein; TIGRFAM: pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase; PFAM: pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein; Pyruvate/ketoisovalerate oxidoreductase, catalyt DNA sequence : ATGGCAAAACAAATGAAAACCATGGATGGAAACACTGCTGCAGCTCATGTAGCTTATGCTTTTACAGATGTGGCAGCAAT CTATCCTATCACTCCTTCATCTCCGATGGCTGAACTCGTCGACTCTTGGAGTGCTCATGGTCGTGAAAACATTTTCGGCC AACAAGTTAAGTTGACAGAAATGCAGTCAGAAGGTGGGGCGTCTGGTGCTGTACATGGGTCACTGGTTGCTGGTGCTTTA ACAAGTACATTTACAGCTTCACAGGGGCTATTGCTCATGCTGCCAAATATGTATAAAATCGCTGGGGAATTATTACCTGG TGTTTTTCATGTTAGTGCCCGTACAGTTGCAACCCATGCCCTTTCGATCTTTGGTGATCACTCAGATGTAATGGCTGCTC GTCAAACTGGAACAGCTATGTTAGCTTCTGGTAGTGTTCAGGAAGTAATGGATTTAGCTGGTGTTGCTCATTTATCTGCG ATTAAGTCTAGTTTACCATTTGTTCATTTCTTTGATGGATTTAGAACTTCTCATGAGTATCAAAAAATAGAAGTTTTAGA CTATGATGATCTAGCAGAGCTGGTTGATTATGGAAAGGTCAGTGAATTTAGACATAGAGCATTAAATCCTGAACATCCTG TTACAATGGGTACTGCTCAAAACCCAGATATTTTCTTCCAGGCTCGTGAAGCAGCAAACCGTTTTTATGATGCAGTTCCT GATATTGTTGAAGAATATATGCAGGAAATTTCTGAGTTAACAGGCAGAGAATATCATCCATTCAATTATGTAGGAGCAGA AGATGCTAAATATGTAATTATTGCAATGGGTTCAGTAACAGATACAATTGAAGAAACAGTTAAATATCTGGTTGATAAAG GAGAAAAAGTTGGTTTAATTAAAGTAAGACTTTATCGTCCTTTCTCCGAGAAATACTTCATGAAGGCTCTTCCAGAAACT GCTGAGAAGATTGCTGTACTTGATAGAACTAAGGAACCTGGTGCAGTAGGGGAACCTCTTTATGAAGATGTAAGATCATT ATTCTATGACAAAGAAAAAAGGCCTGTTATTGTTGGTGGCCGTTACGGTTTAAGTTCTAAAGATACTACACCTACTCATA TTAAAGCTGTATTTGATAATCTTAGAGAAGATAATCCGGAAAATGCATTTACCTTAGGTATTGAAGATGATGTAACACAT ACAAATCTTGAGCCTAAAGAACATATCAATACTTCTCCAGAAAGTACAGTTCGCTGCAAGTTCTGGGGCTTTGGCTCTGA TGGAACGGTTGGCGCTAACAAAAATGCTGTTAAGATTATTGGTAATAACACTGATAAATATGCCCAAGCATATTTCTCTT ATGACTCCAAAAAATCTGGTGGTGTAACTGTATCTCACCTAAGATTCGGTGATGAGCCAATTAAATCTACTTACTTAATT GATGAGGCTGACTATGTTGCCTGTCATAAAGAGTCATATGTTGATAAATTTGATATGGTATCTGATCTCAGAGAAGGTGG TAAATTCTTACTTAACTGTTCCTGGTCTGAAGATCAGTTAACAGAAAAACTACCTGCTGAGATGAAAAGATATATTGCTG AAAATAATATTGATTTTTATACCATTGATGGTGTAAAAATTGCTCAAGAAGTTGGTCTAGGTGGCAGAATTAACATGGTT ATGCAGACTGCCTTCTTTAAATTAGCTGATATTATTCCATTTGATGAAGCCGTAGATTATCTCAAAAAAGCTATTGAAGA TACCTATGGTCACAAAGGAGAAAAGATTGTAGAAATGAACTATAAAGCTGTTGATAGAGCAGTTGATGCTTTAACTTCAA TCGATGTTCCTGCAGAATGGGCTCAAGCAGAAATTGAAGAAGTTGAAGAGGAAGAAGATGTACCTGCATTTGTTAAAGAT GTTCTAGAAGTTGTTAATAGACAGGAAGGTGACAGTCTACCTGTTAGTACTTTTGTAGGCCGTGAAGATGGTCACTTCCC TCCAGGACTTTCTAAATATGAAAAACGTGGTATAGCTATTGATGTTCCTGATTGGAAAGATGATATCTGTATTCAGTGTA ATCAGTGTGCTTTAGCTTGTCCACATGCTGTAATTAGACCTTTCTTACTTGATGAAGAAGAAGTTGCAAATGCTCCTGAA GGTTTCAAAACTATAGAAGCAAAAGGCAAACAGCTTGAAGGTTTAGAGTATAAAATACAGGTTAGCCCTTATGATTGTAC TGGTTGTGGAGTTTGTGTAGACGTATGTCCTGTTAATGCTCTAGAGATGGAGTCATTTGCCAAGATGACAGAACAAGAAG CAGATAATTGGGAGTATGCAATTAATGAAGTTTCAATTAAAGATGATCTGATGCCTGCTGCTAATATTAAAGGTAGTCAA TTCCAGGAACCATTACTTGAGTTCTCAGGTGCTTGCGCAGGTTGTGGAGAAACAGCTTATGCTAAGCTGGTAACTCAATT ATTTGGCGATAGAATGCTAATTGCCAATGCGACAGGTTGTTCATCAATCTGGGGTGGATCTGCTCCTGTGTCAGTTTATA GTACAAATGACGAAGGTCATGGACCTGCCTGGGCTAACTCCTTATTTGAGGATAATGCTGAATTTGGTTATGGTATGTAC CTGGCAACAGAACAGATCAGAGCAAAAATCGCAGATCTTATGGAAGAAGCAATTGAGCTTAACCTTGATGAAAAACTCAA TGAACTAATGAAAGAGTTTCTTGATAATATGCAGGATGGCGAAAAGACAAAAGCACTTAAAAAAGAAATGATGCCATTAC TTGCTAAATATAGTGATAACGAAGTTATTGCTGAGATAGTTGATCGCAAAGAATTTATTGTGAAAAAATCTCAGTGGATC TTTGGTGGAGATGGCTGGGCTTATGATATCGGTTATGGTGGTTTAGACCATGTAATAGCTTCTGGTGATGATGTAAATGT CTTGATCTTTGATACAGAAGTTTATTCTAATACAGGTGGTCAATCATCAAAAGCTACTCCAACTGCTGCAGCTGCTAAAT TTGCTGCTTCAGGTAAGAAAATACAGAAAAAAGATCTGGGTCAAATGGCTATGACTTACGGTTATGTTTATGTAGCTCAG ATTTCATTGGGTGCTAATATGAATCAGGCTATTAAAGCTATTGCTGAAGCTGAAGCATATGATGGCCCTTCTGTAATTAT CGCTTATTCTCCATGTATCTCACATGGGCTTAAAGCTGGTATGGGATGTAGTGTAACCCAGGAAAAAGATGCAGTTAAAG CTGGCTACTGGCACTTATTCCGCTTCAATCCAGAGCTAAAAGAAGAAAATAAAAATCCATTTAGCCTGGATTCTAAAGAG CCTACAGAAGATTTCCGTGAATTCTTGTTAAGTGAGGTTCGTTTCTCATCCTTACAACAGACATTCCCAGAAATCGCAGA AGTGCTTTTTGAAAAGGCTGAAGAAGCTGCTGAAGAGCGTTATAAATCATATGTAAGGCTTGAAGAAGCTTATGCTCCAG AAAAAGAAGAAGAGTAA Protein sequence : MAKQMKTMDGNTAAAHVAYAFTDVAAIYPITPSSPMAELVDSWSAHGRENIFGQQVKLTEMQSEGGASGAVHGSLVAGAL TSTFTASQGLLLMLPNMYKIAGELLPGVFHVSARTVATHALSIFGDHSDVMAARQTGTAMLASGSVQEVMDLAGVAHLSA IKSSLPFVHFFDGFRTSHEYQKIEVLDYDDLAELVDYGKVSEFRHRALNPEHPVTMGTAQNPDIFFQAREAANRFYDAVP DIVEEYMQEISELTGREYHPFNYVGAEDAKYVIIAMGSVTDTIEETVKYLVDKGEKVGLIKVRLYRPFSEKYFMKALPET AEKIAVLDRTKEPGAVGEPLYEDVRSLFYDKEKRPVIVGGRYGLSSKDTTPTHIKAVFDNLREDNPENAFTLGIEDDVTH TNLEPKEHINTSPESTVRCKFWGFGSDGTVGANKNAVKIIGNNTDKYAQAYFSYDSKKSGGVTVSHLRFGDEPIKSTYLI DEADYVACHKESYVDKFDMVSDLREGGKFLLNCSWSEDQLTEKLPAEMKRYIAENNIDFYTIDGVKIAQEVGLGGRINMV MQTAFFKLADIIPFDEAVDYLKKAIEDTYGHKGEKIVEMNYKAVDRAVDALTSIDVPAEWAQAEIEEVEEEEDVPAFVKD VLEVVNRQEGDSLPVSTFVGREDGHFPPGLSKYEKRGIAIDVPDWKDDICIQCNQCALACPHAVIRPFLLDEEEVANAPE GFKTIEAKGKQLEGLEYKIQVSPYDCTGCGVCVDVCPVNALEMESFAKMTEQEADNWEYAINEVSIKDDLMPAANIKGSQ FQEPLLEFSGACAGCGETAYAKLVTQLFGDRMLIANATGCSSIWGGSAPVSVYSTNDEGHGPAWANSLFEDNAEFGYGMY LATEQIRAKIADLMEEAIELNLDEKLNELMKEFLDNMQDGEKTKALKKEMMPLLAKYSDNEVIAEIVDRKEFIVKKSQWI FGGDGWAYDIGYGGLDHVIASGDDVNVLIFDTEVYSNTGGQSSKATPTAAAAKFAASGKKIQKKDLGQMAMTYGYVYVAQ ISLGANMNQAIKAIAEAEAYDGPSVIIAYSPCISHGLKAGMGCSVTQEKDAVKAGYWHLFRFNPELKEENKNPFSLDSKE PTEDFREFLLSEVRFSSLQQTFPEIAEVLFEKAEEAAEERYKSYVRLEEAYAPEKEEE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | AFJ97267.1 | pyruvate ferredoxin | Virulence | Not named | Protein | 0.0 | 56 |
