Name : Calhy_1471 (Calhy_1471) Accession : YP_003992557.1 Strain : Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 Genome accession: NC_014652 Putative virulence/resistance : Unknown Product : leucyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG0495 EC number : - Position : 1501571 - 1504024 bp Length : 2454 bp Strand : - Note : KEGG: ate:Athe_1254 leucyl-tRNA synthetase; TIGRFAM: leucyl-tRNA synthetase DNA sequence : ATGGAATATAATTTTAAAGAAATTGAAAAGAAATGGCAGCAAAAATGGTTTTCACAGAACAAATACAAAGTATCAGAGGA CAGTCCAAAACCAAAATATTATGTCCTTGAGATGTTTCCATATCCTTCAGGAAAACTTCATATGGGACATGTTAGGAACT ATTCGATTGGTGATGTATTTGCACGTTTTATGAGGTTAAAGGGCTACAACGTTTTGCATCCGATGGGTTGGGATGCGTTT GGTCTTCCCGCTGAAAATGCTGCTATAAAGCATGGAATTCATCCTTCTGACTGGACATGGTCAAACATTGAGAATATGAA AAGGCAGCTTATGGAACTTGGAATTAGCTATGATTGGGATAGAGAAGTAGCCACATGTCATCCAGATTATTATAAATGGA CTCAGTGGATGTTCTTGCAGTTTTATAAAGCTGGACTTGCTTATAGAAAGAGGTCATATGTGAACTGGTGTCCATCATGT GAGACAGTGCTTGCAAATGAACAGGTTGTAAATGGTAGATGTGAAAGATGTAAATCACTTGTTGGTAAAAAAGATTTAGA GCAGTGGTTTTTCAGAATTACCAACTATGCAGAAAGACTTCTTCGTGATATAGAAAAGCTTGATGGCTGGCCAGAAAAGG TAAAGATAATGCAGAAAAACTGGATAGGAAGAAGTGAAGGTGCAGAGATTGAGTTTGAAATTGAAGGACTGAATAAAAAG ATAAAAGTATTCACAACAAGACCTGATACCCTTTTTGGTGTCACATACCTTGTTTTGGCTCCAGAACATCCTTTAACAAA GGAGATAATAGCAGGAAAACCTCAAGAGAGAGAGTGTCTTGAGTTTATCGAAAAGATGCAATATCTAAATGAGATTGAAA GAACTTCTACAGAAACAGAAAAAGAAGGAAGGTTTACGGGTGGATATGCTATTCATCCTCTAACAGGTGAAAGAGTGCCA ATATACATTGCAAATTATGTGCTGGTTGATTATGGAACAGGGGCTGTGATGGGTGTTCCAGCCCATGACCAGAGGGACTT TGAGTTTGCAAAAAAATATAATCTTCCTATTAAAGTTGTAATAAAAGGTGAGGGTGTTGACATCGAAAATTTTCAAAATG CTTATGAAGACGAAGGTGTTTTGATTAATTCTGGAATTTTTGATGGGCTTAAAAACACAGAGGCCATGAAAAAGATAACA CAGTACCTGGAACAAAAAGGTGTTGGCAGGGCATGTGTAACGTATAAACTCAGAGACTGGTTAATATCCAGGCAGCGTTA TTGGGGAGCTCCAATTCCTATTGTATATTGTGATGAATGTGGGGTTGTTCCTGTACCTGAGGAAGATTTGCCTGTTTTGC TACCTTACAATGTTGAGTTCAAACCAACAGGCCAGTCACCACTTTCTTACTGTGAAGAGTTTGTCAACACTACATGTCCA AAGTGCGGGAAGCCTGCAAAGAGAGAAACTGATACAATGGACACATTTATATGTTCCTCGTGGTATTATTTTAGATACAC AGACCCCAAAAATGATCAAAAACCTTTCGAAAAATCGCTTGTTTCTTACTGGCTTCCTGTTGACCAGTATATTGGCGGGG TTGAACACGCTATATTGCATCTTCTGTATTCGAGGTTCTTTACAAAGGTGCTATATGACCTTGGCTATGTACCTTTTGAA GAGCCTTTCAAGAACCTCTTGACGCAAGGCATGGTGTTAAAAGATGGAGCAAAGATGTCAAAATCGCTTGGAAATATAGT CAGTCCTGAAGACATAGTAGAAAAGTATGGAGCTGACACAGCAAGGCTGTTTATACTCTTTGCTGCACCGCCAGAGAGAG ATTTAGAGTGGTCAGACCAAGGGGTTGAGGGATGTTTTAGGTTTTTAAATAGGCTGTGGAGACTTTATATAGAACTTAAA AACAAACTTGCAGATGATAATCTTATTGGTGAGTCTGAACTTGACGATGAACTAAGATATAGATTAAATTATACAATTAA AAAGGTCACAGAGGATATAGGAGAGAGGTTCAACTTTAACACTGCTATCAGTACTATCATGGAACTTTTAAATTTCTTGT ATGAGTATAAGGAGAATGGAAAATTAAATAAAGATTTAATTATAGATACACTCAGGAATTTATTAATATTGATTTATCCA TTTACACCTCACATTGCATGTGAGCTATGGGAGATTATGGGGTTTGGTGAGGACATTGAAGAGGTAAGTTGGCCGCAGTA CGATGAAGCTGCTCTTGTTCGAAAGAACGTAGAGATTGCTATTCAGATAAATGGCAAGGTAAGGTCAAGGATGAACATCT CTGTGGATATGACAGAAGAAGAAGTGAAACAGGCAGTTATCAATGACCAGAAACTTAAAGCGCTTTTGAATGGGAAGGAA ATAGTTAAGTTTGTGTATGTGAAAAATAGACTTGTTAACATTGTAGTGAGATAA Protein sequence : MEYNFKEIEKKWQQKWFSQNKYKVSEDSPKPKYYVLEMFPYPSGKLHMGHVRNYSIGDVFARFMRLKGYNVLHPMGWDAF GLPAENAAIKHGIHPSDWTWSNIENMKRQLMELGISYDWDREVATCHPDYYKWTQWMFLQFYKAGLAYRKRSYVNWCPSC ETVLANEQVVNGRCERCKSLVGKKDLEQWFFRITNYAERLLRDIEKLDGWPEKVKIMQKNWIGRSEGAEIEFEIEGLNKK IKVFTTRPDTLFGVTYLVLAPEHPLTKEIIAGKPQERECLEFIEKMQYLNEIERTSTETEKEGRFTGGYAIHPLTGERVP IYIANYVLVDYGTGAVMGVPAHDQRDFEFAKKYNLPIKVVIKGEGVDIENFQNAYEDEGVLINSGIFDGLKNTEAMKKIT QYLEQKGVGRACVTYKLRDWLISRQRYWGAPIPIVYCDECGVVPVPEEDLPVLLPYNVEFKPTGQSPLSYCEEFVNTTCP KCGKPAKRETDTMDTFICSSWYYFRYTDPKNDQKPFEKSLVSYWLPVDQYIGGVEHAILHLLYSRFFTKVLYDLGYVPFE EPFKNLLTQGMVLKDGAKMSKSLGNIVSPEDIVEKYGADTARLFILFAAPPERDLEWSDQGVEGCFRFLNRLWRLYIELK NKLADDNLIGESELDDELRYRLNYTIKKVTEDIGERFNFNTAISTIMELLNFLYEYKENGKLNKDLIIDTLRNLLILIYP FTPHIACELWEIMGFGEDIEEVSWPQYDEAALVRKNVEIAIQINGKVRSRMNISVDMTEEEVKQAVINDQKLKALLNGKE IVKFVYVKNRLVNIVVR |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
leuS | YP_281511.2 | leucyl-tRNA synthetase | Not tested | Not named | Protein | 3e-173 | 45 |